MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 55959

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011726	GTT	2	6	75	80	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244893
2	NC_011726	AGA	2	6	92	97	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218244893
3	NC_011726	GGT	2	6	99	104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218244893
4	NC_011726	TTA	2	6	165	170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244893
5	NC_011726	GAC	2	6	216	221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244893
6	NC_011726	AGA	2	6	551	556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218244894
7	NC_011726	GAT	2	6	573	578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244894
8	NC_011726	ATT	2	6	611	616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244894
9	NC_011726	CCT	2	6	624	629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218244894
10	NC_011726	CTT	2	6	694	699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244894
11	NC_011726	AGA	2	6	779	784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218244894
12	NC_011726	TTG	2	6	949	954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244894
13	NC_011726	AAC	2	6	964	969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244894
14	NC_011726	TAG	2	6	988	993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244894
15	NC_011726	AAT	3	9	1105	1113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244894
16	NC_011726	TAT	2	6	1436	1441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244895
17	NC_011726	TGC	2	6	1652	1657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218244895
18	NC_011726	TCG	2	6	1877	1882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218244895
19	NC_011726	GAT	2	6	1902	1907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244895
20	NC_011726	AAG	2	6	1939	1944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218244895
21	NC_011726	ATT	2	6	1946	1951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244895
22	NC_011726	TTC	2	6	2113	2118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244895
23	NC_011726	TCC	2	6	2291	2296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218244895
24	NC_011726	CGA	2	6	2388	2393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244895
25	NC_011726	GAA	2	6	2472	2477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218244895
26	NC_011726	ATC	2	6	3072	3077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244896
27	NC_011726	AAT	2	6	3164	3169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244896
28	NC_011726	CGT	2	6	3221	3226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218244896
29	NC_011726	ATT	2	6	3246	3251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244896
30	NC_011726	TTG	2	6	3417	3422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244896
31	NC_011726	AGC	2	6	3475	3480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244896
32	NC_011726	GTC	2	6	3505	3510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218244896
33	NC_011726	AAT	2	6	3518	3523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244896
34	NC_011726	GGA	2	6	3533	3538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218244896
35	NC_011726	ATC	2	6	3549	3554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244896
36	NC_011726	GAA	2	6	3587	3592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218244896
37	NC_011726	CAA	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244896
38	NC_011726	AAT	2	6	3692	3697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244896
39	NC_011726	ATT	2	6	3778	3783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244896
40	NC_011726	ATG	2	6	3822	3827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244896
41	NC_011726	TTG	2	6	3831	3836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244896
42	NC_011726	ATA	2	6	3902	3907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244896
43	NC_011726	CTT	2	6	3917	3922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244896
44	NC_011726	ACA	2	6	4030	4035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244896
45	NC_011726	GGC	2	6	4260	4265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218244897
46	NC_011726	TTC	2	6	4309	4314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244897
47	NC_011726	GTT	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244897
48	NC_011726	ATA	2	6	4584	4589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244897
49	NC_011726	ATA	2	6	4656	4661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244897
50	NC_011726	AAT	2	6	4717	4722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244897
51	NC_011726	CCA	2	6	4729	4734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218244897
52	NC_011726	TAA	2	6	4786	4791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244897
53	NC_011726	TTC	2	6	4944	4949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244897
54	NC_011726	GTT	2	6	4961	4966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244897
55	NC_011726	TTG	2	6	4968	4973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244897
56	NC_011726	GTA	2	6	5143	5148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244898
57	NC_011726	AGC	2	6	5152	5157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244898
58	NC_011726	TAA	2	6	5192	5197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244898
59	NC_011726	AGT	2	6	5277	5282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244898
60	NC_011726	TTA	2	6	5466	5471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244899
61	NC_011726	ATT	2	6	5525	5530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244899
62	NC_011726	CCA	2	6	5535	5540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218244899
63	NC_011726	CCT	2	6	5547	5552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218244899
64	NC_011726	ATT	2	6	5567	5572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244899
65	NC_011726	TGT	2	6	5609	5614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244899
66	NC_011726	TTA	2	6	5634	5639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244899
67	NC_011726	TAA	2	6	5692	5697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244899
68	NC_011726	AGG	2	6	5699	5704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218244899
69	NC_011726	TTA	2	6	5773	5778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244899
70	NC_011726	ATT	2	6	5824	5829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244899
71	NC_011726	TTA	2	6	5931	5936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244899
72	NC_011726	ATT	2	6	6032	6037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244899
73	NC_011726	TTG	2	6	6281	6286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244900
74	NC_011726	CAT	2	6	6398	6403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244900
75	NC_011726	TAA	2	6	6415	6420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244900
76	NC_011726	GTT	2	6	6603	6608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244900
77	NC_011726	CAA	2	6	6682	6687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244900
78	NC_011726	TTC	2	6	6758	6763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244900
79	NC_011726	GCT	2	6	6912	6917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218244900
80	NC_011726	TTG	2	6	7115	7120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244900
81	NC_011726	TAA	2	6	7121	7126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244900
82	NC_011726	CTT	2	6	7135	7140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244900
83	NC_011726	TAA	3	9	7187	7195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244900
84	NC_011726	ATC	2	6	7244	7249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244900
85	NC_011726	TGG	2	6	7327	7332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218244900
86	NC_011726	AAT	2	6	7465	7470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244901
87	NC_011726	ATT	2	6	7504	7509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218244901
88	NC_011726	TCT	2	6	7510	7515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244901
89	NC_011726	TAA	2	6	7590	7595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244901
90	NC_011726	AAT	2	6	7685	7690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244901
91	NC_011726	GCA	2	6	7696	7701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244901
92	NC_011726	TAA	2	6	7734	7739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244901
93	NC_011726	ATC	2	6	7899	7904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244901
94	NC_011726	AAT	2	6	7953	7958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218244901
95	NC_011726	AGG	2	6	8023	8028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218244901
96	NC_011726	GAC	3	9	8087	8095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244901
97	NC_011726	CGA	2	6	8338	8343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244901
98	NC_011726	CAG	2	6	8357	8362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244901
99	NC_011726	AGG	2	6	8515	8520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218244901
100	NC_011726	GAG	2	6	8544	8549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218244901
101	NC_011726	GGA	2	6	8579	8584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218244901
102	NC_011726	TTC	4	12	8667	8678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244901
103	NC_011726	GTT	2	6	8735	8740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244901
104	NC_011726	GGA	2	6	8796	8801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218244901
105	NC_011726	GTT	2	6	8825	8830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244901
106	NC_011726	GCC	2	6	9007	9012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218244901
107	NC_011726	GTG	2	6	9045	9050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218244901
108	NC_011726	GTT	2	6	9107	9112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244901
109	NC_011726	CTG	2	6	9123	9128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218244901
110	NC_011726	GGT	2	6	9183	9188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218244901
111	NC_011726	GAG	2	6	9231	9236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218244901
112	NC_011726	TCC	2	6	9252	9257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218244901
113	NC_011726	CGA	2	6	9278	9283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244901
114	NC_011726	TCG	2	6	9295	9300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218244901
115	NC_011726	TTC	2	6	9360	9365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244901
116	NC_011726	TGA	2	6	9458	9463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218244901
117	NC_011726	CGG	2	6	9565	9570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218244901
118	NC_011726	TTC	2	6	9573	9578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244901
119	NC_011726	CTT	2	6	9608	9613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244901
120	NC_011726	AAC	2	6	9755	9760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244901
121	NC_011726	TCT	2	6	9778	9783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244901
122	NC_011726	TGT	2	6	9940	9945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244901
123	NC_011726	TTG	2	6	10277	10282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244902
124	NC_011726	TCC	2	6	10319	10324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218244902
125	NC_011726	GGC	2	6	10337	10342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218244902
126	NC_011726	TCT	2	6	10368	10373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244902
127	NC_011726	CTA	2	6	10381	10386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218244902
128	NC_011726	TTC	2	6	10388	10393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244902
129	NC_011726	TTG	2	6	10551	10556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244902
130	NC_011726	TTC	2	6	10577	10582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244902
131	NC_011726	TCT	2	6	10587	10592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218244902
132	NC_011726	TTG	2	6	10622	10627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244902
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256	NC_011726	AAC	2	6	21123	21128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244913
257	NC_011726	AGC	2	6	21184	21189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218244913
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259	NC_011726	TGT	2	6	21596	21601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218244914
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261	NC_011726	CAA	2	6	21723	21728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218244914
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