MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 4536

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011726	AG	3	6	50	55	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011726	AT	3	6	2168	2173	50 %	50 %	0 %	0 %	218244895
3	NC_011726	TA	3	6	2506	2511	50 %	50 %	0 %	0 %	218244895
4	NC_011726	AT	4	8	2983	2990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011726	AC	3	6	4194	4199	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011726	TA	3	6	4471	4476	50 %	50 %	0 %	0 %	218244897
7	NC_011726	AT	3	6	5102	5107	50 %	50 %	0 %	0 %	218244898
8	NC_011726	TA	3	6	5805	5810	50 %	50 %	0 %	0 %	218244899
9	NC_011726	TA	3	6	6784	6789	50 %	50 %	0 %	0 %	218244900
10	NC_011726	AT	3	6	7003	7008	50 %	50 %	0 %	0 %	218244900
11	NC_011726	CA	3	6	7174	7179	50 %	0 %	0 %	50 %	218244900
12	NC_011726	CA	3	6	8076	8081	50 %	0 %	0 %	50 %	218244901
13	NC_011726	CG	3	6	8328	8333	0 %	0 %	50 %	50 %	218244901
14	NC_011726	AG	3	6	11559	11564	50 %	0 %	50 %	0 %	218244903
15	NC_011726	TC	3	6	12299	12304	0 %	50 %	0 %	50 %	218244904
16	NC_011726	AT	3	6	13274	13279	50 %	50 %	0 %	0 %	218244906
17	NC_011726	CT	3	6	15679	15684	0 %	50 %	0 %	50 %	218244908
18	NC_011726	AT	3	6	16158	16163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011726	AT	3	6	19088	19093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011726	TC	3	6	19516	19521	0 %	50 %	0 %	50 %	218244913
21	NC_011726	AT	3	6	19545	19550	50 %	50 %	0 %	0 %	218244913
22	NC_011726	CA	3	6	22341	22346	50 %	0 %	0 %	50 %	218244915
23	NC_011726	CT	3	6	23015	23020	0 %	50 %	0 %	50 %	218244915
24	NC_011726	CT	3	6	23526	23531	0 %	50 %	0 %	50 %	218244916
25	NC_011726	AC	3	6	28066	28071	50 %	0 %	0 %	50 %	218244919
26	NC_011726	TC	3	6	28183	28188	0 %	50 %	0 %	50 %	218244919
27	NC_011726	AT	3	6	30624	30629	50 %	50 %	0 %	0 %	218244920
28	NC_011726	CT	3	6	30781	30786	0 %	50 %	0 %	50 %	218244921
29	NC_011726	AT	3	6	32455	32460	50 %	50 %	0 %	0 %	218244922
30	NC_011726	TA	3	6	32879	32884	50 %	50 %	0 %	0 %	218244923
31	NC_011726	CA	3	6	37937	37942	50 %	0 %	0 %	50 %	218244929
32	NC_011726	AG	3	6	40852	40857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011726	GA	3	6	41666	41671	50 %	0 %	50 %	0 %	218244932
34	NC_011726	TC	3	6	41759	41764	0 %	50 %	0 %	50 %	218244932
35	NC_011726	AT	3	6	41773	41778	50 %	50 %	0 %	0 %	218244932
36	NC_011726	AT	3	6	43745	43750	50 %	50 %	0 %	0 %	218244933
37	NC_011726	AT	3	6	45494	45499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011726	AG	3	6	45611	45616	50 %	0 %	50 %	0 %	218244935
39	NC_011726	AT	3	6	45642	45647	50 %	50 %	0 %	0 %	218244935
40	NC_011726	TA	3	6	47712	47717	50 %	50 %	0 %	0 %	218244937
41	NC_011726	AT	3	6	51422	51427	50 %	50 %	0 %	0 %	218244940
42	NC_011726	TA	3	6	51475	51480	50 %	50 %	0 %	0 %	218244940
43	NC_011726	GA	3	6	51702	51707	50 %	0 %	50 %	0 %	218244940
44	NC_011726	AT	3	6	51973	51978	50 %	50 %	0 %	0 %	218244941
45	NC_011726	AT	3	6	53856	53861	50 %	50 %	0 %	0 %	218244942
46	NC_011726	TG	3	6	54558	54563	0 %	50 %	50 %	0 %	218244943
47	NC_011726	GT	3	6	55263	55268	0 %	50 %	50 %	0 %	218244944
48	NC_011726	GA	3	6	57168	57173	50 %	0 %	50 %	0 %	218244946
49	NC_011726	AT	3	6	57813	57818	50 %	50 %	0 %	0 %	218244947
50	NC_011726	AG	3	6	58946	58951	50 %	0 %	50 %	0 %	218244947
51	NC_011726	TA	3	6	61302	61307	50 %	50 %	0 %	0 %	218244950
52	NC_011726	AT	3	6	61817	61822	50 %	50 %	0 %	0 %	218244950
53	NC_011726	AT	3	6	61853	61858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011726	TC	3	6	62108	62113	0 %	50 %	0 %	50 %	218244951
55	NC_011726	GA	3	6	62846	62851	50 %	0 %	50 %	0 %	218244952
56	NC_011726	CA	3	6	62893	62898	50 %	0 %	0 %	50 %	218244952
57	NC_011726	TA	3	6	63101	63106	50 %	50 %	0 %	0 %	218244952
58	NC_011726	CT	3	6	64140	64145	0 %	50 %	0 %	50 %	218244953
59	NC_011726	AG	3	6	66095	66100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011726	TG	3	6	67845	67850	0 %	50 %	50 %	0 %	218244957
61	NC_011726	CA	3	6	68908	68913	50 %	0 %	0 %	50 %	218244958
62	NC_011726	AG	3	6	70395	70400	50 %	0 %	50 %	0 %	218244959
63	NC_011726	TC	3	6	71685	71690	0 %	50 %	0 %	50 %	218244960
64	NC_011726	GT	3	6	72392	72397	0 %	50 %	50 %	0 %	218244961
65	NC_011726	TA	3	6	73952	73957	50 %	50 %	0 %	0 %	218244963
66	NC_011726	TC	4	8	74739	74746	0 %	50 %	0 %	50 %	218244964
67	NC_011726	AG	3	6	77571	77576	50 %	0 %	50 %	0 %	218244965
68	NC_011726	GA	3	6	79838	79843	50 %	0 %	50 %	0 %	218244968
69	NC_011726	CT	3	6	82536	82541	0 %	50 %	0 %	50 %	218244969
70	NC_011726	GA	3	6	83059	83064	50 %	0 %	50 %	0 %	218244970
71	NC_011726	TA	3	6	84203	84208	50 %	50 %	0 %	0 %	218244971
72	NC_011726	CT	3	6	85517	85522	0 %	50 %	0 %	50 %	218244971
73	NC_011726	AT	3	6	87268	87273	50 %	50 %	0 %	0 %	218244974
74	NC_011726	GA	3	6	87379	87384	50 %	0 %	50 %	0 %	218244974
75	NC_011726	TC	3	6	87783	87788	0 %	50 %	0 %	50 %	218244974
76	NC_011726	TC	3	6	89155	89160	0 %	50 %	0 %	50 %	218244975
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78	NC_011726	AT	3	6	90325	90330	50 %	50 %	0 %	0 %	218244976
79	NC_011726	TA	4	8	90395	90402	50 %	50 %	0 %	0 %	218244976
80	NC_011726	AT	3	6	90440	90445	50 %	50 %	0 %	0 %	218244976
81	NC_011726	GA	5	10	91195	91204	50 %	0 %	50 %	0 %	218244977
82	NC_011726	CG	3	6	91614	91619	0 %	0 %	50 %	50 %	218244977
83	NC_011726	GA	3	6	92878	92883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011726	AC	3	6	93335	93340	50 %	0 %	0 %	50 %	218244979
85	NC_011726	CT	3	6	93354	93359	0 %	50 %	0 %	50 %	218244979
86	NC_011726	GA	3	6	94174	94179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011726	GA	3	6	95036	95041	50 %	0 %	50 %	0 %	218244981
88	NC_011726	CG	3	6	97973	97978	0 %	0 %	50 %	50 %	218244984
89	NC_011726	AG	3	6	98194	98199	50 %	0 %	50 %	0 %	218244984
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91	NC_011726	TC	3	6	98810	98815	0 %	50 %	0 %	50 %	218244984
92	NC_011726	CA	3	6	102731	102736	50 %	0 %	0 %	50 %	218244988
93	NC_011726	AG	3	6	103274	103279	50 %	0 %	50 %	0 %	218244989
94	NC_011726	CA	4	8	103674	103681	50 %	0 %	0 %	50 %	218244989
95	NC_011726	TC	3	6	105540	105545	0 %	50 %	0 %	50 %	218244991
96	NC_011726	TA	3	6	106199	106204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011726	AT	3	6	107835	107840	50 %	50 %	0 %	0 %	218244993
98	NC_011726	TA	3	6	108653	108658	50 %	50 %	0 %	0 %	218244993
99	NC_011726	AT	3	6	110609	110614	50 %	50 %	0 %	0 %	218244995
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103	NC_011726	GA	3	6	116314	116319	50 %	0 %	50 %	0 %	218245002
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106	NC_011726	CT	3	6	118013	118018	0 %	50 %	0 %	50 %	218245004
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109	NC_011726	TC	3	6	120767	120772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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111	NC_011726	AT	3	6	123479	123484	50 %	50 %	0 %	0 %	218245008
112	NC_011726	TG	3	6	123848	123853	0 %	50 %	50 %	0 %	218245008
113	NC_011726	GT	3	6	124055	124060	0 %	50 %	50 %	0 %	218245009
114	NC_011726	AT	3	6	128260	128265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011726	GC	3	6	129173	129178	0 %	0 %	50 %	50 %	218245016
116	NC_011726	TG	3	6	129206	129211	0 %	50 %	50 %	0 %	218245016
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121	NC_011726	TA	3	6	133615	133620	50 %	50 %	0 %	0 %	218245019
122	NC_011726	GT	3	6	135773	135778	0 %	50 %	50 %	0 %	218245023
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125	NC_011726	TC	3	6	144669	144674	0 %	50 %	0 %	50 %	218245026
126	NC_011726	TC	3	6	145408	145413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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129	NC_011726	AT	3	6	147264	147269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_011726	CA	3	6	149485	149490	50 %	0 %	0 %	50 %	218245034
132	NC_011726	TG	3	6	153611	153616	0 %	50 %	50 %	0 %	218245041
133	NC_011726	CA	3	6	154231	154236	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_011726	AG	3	6	154614	154619	50 %	0 %	50 %	0 %	218245042
135	NC_011726	TA	3	6	155821	155826	50 %	50 %	0 %	0 %	218245043
136	NC_011726	TA	3	6	156963	156968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011726	TC	3	6	157402	157407	0 %	50 %	0 %	50 %	218245044
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139	NC_011726	GA	3	6	157773	157778	50 %	0 %	50 %	0 %	218245044
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