MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp26

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011724	AAAT	2	8	622	629	75 %	25 %	0 %	0 %	218203988
2	NC_011724	AGAC	2	8	1311	1318	50 %	0 %	25 %	25 %	218203981
3	NC_011724	AATT	2	8	1446	1453	50 %	50 %	0 %	0 %	218203981
4	NC_011724	AATT	2	8	1686	1693	50 %	50 %	0 %	0 %	218203981
5	NC_011724	ACAA	2	8	1778	1785	75 %	0 %	0 %	25 %	218203981
6	NC_011724	TTTC	2	8	2076	2083	0 %	75 %	0 %	25 %	218203981
7	NC_011724	ATCA	2	8	4287	4294	50 %	25 %	0 %	25 %	218203986
8	NC_011724	AATG	2	8	4695	4702	50 %	25 %	25 %	0 %	218203990
9	NC_011724	CAAT	2	8	4724	4731	50 %	25 %	0 %	25 %	218203990
10	NC_011724	AAGG	2	8	4757	4764	50 %	0 %	50 %	0 %	218203990
11	NC_011724	GAAA	2	8	4772	4779	75 %	0 %	25 %	0 %	218204000
12	NC_011724	ATAA	2	8	5151	5158	75 %	25 %	0 %	0 %	218204000
13	NC_011724	GAAA	2	8	5348	5355	75 %	0 %	25 %	0 %	218204000
14	NC_011724	ATAA	2	8	5860	5867	75 %	25 %	0 %	0 %	218204000
15	NC_011724	ATCC	2	8	6728	6735	25 %	25 %	0 %	50 %	218203996
16	NC_011724	ACTA	2	8	7022	7029	50 %	25 %	0 %	25 %	218203996
17	NC_011724	ATTA	2	8	8064	8071	50 %	50 %	0 %	0 %	218203992
18	NC_011724	TACT	2	8	8112	8119	25 %	50 %	0 %	25 %	218203992
19	NC_011724	AATA	2	8	8124	8131	75 %	25 %	0 %	0 %	218203992
20	NC_011724	AGAA	2	8	8338	8345	75 %	0 %	25 %	0 %	218203992
21	NC_011724	ATAC	2	8	8677	8684	50 %	25 %	0 %	25 %	218203992
22	NC_011724	ATAA	2	8	8872	8879	75 %	25 %	0 %	0 %	218203983
23	NC_011724	ATTT	2	8	8960	8967	25 %	75 %	0 %	0 %	218203983
24	NC_011724	AGAA	2	8	9198	9205	75 %	0 %	25 %	0 %	218203983
25	NC_011724	CAAG	2	8	9411	9418	50 %	0 %	25 %	25 %	218203989
26	NC_011724	GAAA	2	8	9602	9609	75 %	0 %	25 %	0 %	218203989
27	NC_011724	TAAA	2	8	10112	10119	75 %	25 %	0 %	0 %	218203997
28	NC_011724	GAAA	2	8	10197	10204	75 %	0 %	25 %	0 %	218203997
29	NC_011724	AATT	2	8	10409	10416	50 %	50 %	0 %	0 %	218203997
30	NC_011724	AAAT	2	8	10620	10627	75 %	25 %	0 %	0 %	218203997
31	NC_011724	TCCA	2	8	11170	11177	25 %	25 %	0 %	50 %	218203984
32	NC_011724	TTTA	2	8	11287	11294	25 %	75 %	0 %	0 %	218203984
33	NC_011724	ATTT	2	8	13966	13973	25 %	75 %	0 %	0 %	218203980
34	NC_011724	ATTA	2	8	15205	15212	50 %	50 %	0 %	0 %	218203985
35	NC_011724	TTCA	2	8	15577	15584	25 %	50 %	0 %	25 %	218203985
36	NC_011724	AATT	2	8	16083	16090	50 %	50 %	0 %	0 %	218203985
37	NC_011724	TGGA	2	8	16159	16166	25 %	25 %	50 %	0 %	218203985
38	NC_011724	TTTG	2	8	16294	16301	0 %	75 %	25 %	0 %	218203985
39	NC_011724	AATA	2	8	16803	16810	75 %	25 %	0 %	0 %	218203982
40	NC_011724	TGCT	2	8	17476	17483	0 %	50 %	25 %	25 %	218203979
41	NC_011724	TTAA	2	8	17537	17544	50 %	50 %	0 %	0 %	218203979
42	NC_011724	ATAA	2	8	17992	17999	75 %	25 %	0 %	0 %	218203995
43	NC_011724	AATT	2	8	18195	18202	50 %	50 %	0 %	0 %	218203995
44	NC_011724	AATA	2	8	18274	18281	75 %	25 %	0 %	0 %	218203995
45	NC_011724	AAAT	2	8	18529	18536	75 %	25 %	0 %	0 %	218203995
46	NC_011724	TAAA	2	8	18804	18811	75 %	25 %	0 %	0 %	218203995
47	NC_011724	CCAA	2	8	18839	18846	50 %	0 %	0 %	50 %	218203995
48	NC_011724	ATTC	2	8	19045	19052	25 %	50 %	0 %	25 %	218203995
49	NC_011724	GATT	2	8	19328	19335	25 %	50 %	25 %	0 %	218203995
50	NC_011724	ATAA	2	8	19457	19464	75 %	25 %	0 %	0 %	218204001
51	NC_011724	AAAT	2	8	19994	20001	75 %	25 %	0 %	0 %	218204001
52	NC_011724	TAAA	2	8	20269	20276	75 %	25 %	0 %	0 %	218204001
53	NC_011724	CCAA	2	8	20304	20311	50 %	0 %	0 %	50 %	218204001
54	NC_011724	AATT	2	8	21208	21215	50 %	50 %	0 %	0 %	218203998
55	NC_011724	TAAA	2	8	21478	21485	75 %	25 %	0 %	0 %	218203994
56	NC_011724	ACTA	2	8	21578	21585	50 %	25 %	0 %	25 %	218203994
57	NC_011724	AATT	2	8	21626	21633	50 %	50 %	0 %	0 %	218203994
58	NC_011724	ATGA	2	8	21915	21922	50 %	25 %	25 %	0 %	218203993
59	NC_011724	TAAA	2	8	22099	22106	75 %	25 %	0 %	0 %	218203993
60	NC_011724	TCTA	2	8	22208	22215	25 %	50 %	0 %	25 %	218203993
61	NC_011724	ATTT	2	8	22392	22399	25 %	75 %	0 %	0 %	218203993
62	NC_011724	TAAT	2	8	22411	22418	50 %	50 %	0 %	0 %	218203993
63	NC_011724	ATTT	2	8	22764	22771	25 %	75 %	0 %	0 %	218203991
64	NC_011724	TAAA	2	8	22888	22895	75 %	25 %	0 %	0 %	218203991
65	NC_011724	ATTT	2	8	23079	23086	25 %	75 %	0 %	0 %	218203991
66	NC_011724	CAAA	2	8	23674	23681	75 %	0 %	0 %	25 %	218203999

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.