MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp26

Total Repeats: 309

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011724	TAT	2	6	317	322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203988
2	NC_011724	CTG	2	6	644	649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203988
3	NC_011724	ATT	2	6	857	862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203981
4	NC_011724	ATC	2	6	1021	1026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203981
5	NC_011724	TAA	2	6	1132	1137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203981
6	NC_011724	TAT	2	6	1140	1145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203981
7	NC_011724	GTT	2	6	1196	1201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203981
8	NC_011724	AAT	2	6	1239	1244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203981
9	NC_011724	ATT	2	6	1336	1341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203981
10	NC_011724	TAT	2	6	1362	1367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203981
11	NC_011724	AGA	2	6	1384	1389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203981
12	NC_011724	AAC	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203981
13	NC_011724	ATT	2	6	1501	1506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203981
14	NC_011724	GAC	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203981
15	NC_011724	ATT	2	6	1664	1669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203981
16	NC_011724	TCA	2	6	1814	1819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203981
17	NC_011724	TTC	2	6	1893	1898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203981
18	NC_011724	TAT	2	6	1923	1928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203981
19	NC_011724	ATT	2	6	1973	1978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203981
20	NC_011724	ATT	2	6	2003	2008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203981
21	NC_011724	TAA	2	6	2518	2523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218204002
22	NC_011724	AAT	3	9	2553	2561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218204002
23	NC_011724	AAT	2	6	2657	2662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218204002
24	NC_011724	CAA	2	6	2686	2691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218204002
25	NC_011724	ATA	2	6	2763	2768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218204002
26	NC_011724	CAT	2	6	2843	2848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218204002
27	NC_011724	CAC	2	6	2878	2883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218204002
28	NC_011724	AAG	2	6	2993	2998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218204002
29	NC_011724	AAT	2	6	3002	3007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218204002
30	NC_011724	ATA	2	6	3037	3042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218204002
31	NC_011724	ATT	2	6	3120	3125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218204002
32	NC_011724	CAA	2	6	3193	3198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218204002
33	NC_011724	CAG	2	6	3229	3234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218204002
34	NC_011724	AGC	2	6	3308	3313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218204002
35	NC_011724	AAT	2	6	3314	3319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218204002
36	NC_011724	AGC	2	6	3398	3403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218204002
37	NC_011724	TCC	2	6	3470	3475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218204002
38	NC_011724	ACA	2	6	3528	3533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218204002
39	NC_011724	ATA	2	6	3543	3548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218204002
40	NC_011724	AGT	2	6	3770	3775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218204002
41	NC_011724	AGA	2	6	4108	4113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203986
42	NC_011724	TGT	2	6	4138	4143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203986
43	NC_011724	ATA	2	6	4280	4285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203986
44	NC_011724	GAA	2	6	4385	4390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203986
45	NC_011724	ATA	2	6	4409	4414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203986
46	NC_011724	TAC	2	6	4448	4453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203990
47	NC_011724	CAA	2	6	4532	4537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203990
48	NC_011724	GTT	2	6	4570	4575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203990
49	NC_011724	GTT	2	6	4588	4593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203990
50	NC_011724	CAC	2	6	4601	4606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203990
51	NC_011724	TAA	2	6	4617	4622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203990
52	NC_011724	GAA	2	6	4633	4638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203990
53	NC_011724	AAT	2	6	4668	4673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203990
54	NC_011724	ATT	2	6	4821	4826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218204000
55	NC_011724	TAT	2	6	4955	4960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218204000
56	NC_011724	ATT	2	6	5032	5037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218204000
57	NC_011724	GAA	2	6	5091	5096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218204000
58	NC_011724	AAT	2	6	5171	5176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218204000
59	NC_011724	ACA	2	6	5268	5273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218204000
60	NC_011724	ATT	2	6	5287	5292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218204000
61	NC_011724	TTA	2	6	5311	5316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218204000
62	NC_011724	TAA	2	6	5321	5326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218204000
63	NC_011724	AGA	2	6	5330	5335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218204000
64	NC_011724	AAG	2	6	5356	5361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218204000
65	NC_011724	AAG	2	6	5425	5430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218204000
66	NC_011724	AAT	2	6	5561	5566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218204000
67	NC_011724	TAC	2	6	5637	5642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218204000
68	NC_011724	AAT	2	6	5643	5648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218204000
69	NC_011724	TTC	2	6	5705	5710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218204000
70	NC_011724	AAT	2	6	5763	5768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218204000
71	NC_011724	ATG	2	6	5800	5805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218204000
72	NC_011724	ATA	2	6	5850	5855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218204000
73	NC_011724	AAG	2	6	6793	6798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203996
74	NC_011724	ATA	2	6	6804	6809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203996
75	NC_011724	ATA	2	6	6823	6828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203996
76	NC_011724	TCA	2	6	6892	6897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203996
77	NC_011724	GAA	2	6	6942	6947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203996
78	NC_011724	ATT	2	6	6955	6960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203996
79	NC_011724	TAA	2	6	6998	7003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203996
80	NC_011724	ATT	2	6	7008	7013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203996
81	NC_011724	TAA	2	6	7130	7135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203996
82	NC_011724	ATA	2	6	7213	7218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203996
83	NC_011724	ATT	2	6	7273	7278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203996
84	NC_011724	ATT	2	6	7304	7309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203996
85	NC_011724	ATT	2	6	7360	7365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203996
86	NC_011724	ATG	2	6	7444	7449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203996
87	NC_011724	CCT	2	6	7476	7481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203996
88	NC_011724	CTT	2	6	7644	7649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203996
89	NC_011724	AAG	2	6	7663	7668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203996
90	NC_011724	CAA	2	6	7854	7859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203992
91	NC_011724	TAA	2	6	7869	7874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203992
92	NC_011724	AGT	2	6	7875	7880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203992
93	NC_011724	ACT	2	6	7928	7933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203992
94	NC_011724	TGT	2	6	7965	7970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203992
95	NC_011724	ATA	2	6	8236	8241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203992
96	NC_011724	GAA	2	6	8242	8247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203992
97	NC_011724	TAA	2	6	8295	8300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203992
98	NC_011724	AGA	2	6	8418	8423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203992
99	NC_011724	GAA	2	6	8491	8496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203992
100	NC_011724	GAA	2	6	8509	8514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203992
101	NC_011724	TAA	2	6	8612	8617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203992
102	NC_011724	TAA	2	6	8726	8731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203992
103	NC_011724	CAA	2	6	8814	8819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203983
104	NC_011724	ATT	2	6	8842	8847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203983
105	NC_011724	TAA	3	9	8934	8942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203983
106	NC_011724	ATT	2	6	9041	9046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203983
107	NC_011724	AAG	2	6	9135	9140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203983
108	NC_011724	GAA	3	9	9217	9225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203983
109	NC_011724	TAA	2	6	9258	9263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203983
110	NC_011724	ATA	2	6	9297	9302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203983
111	NC_011724	ACA	2	6	9339	9344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203989
112	NC_011724	TAA	2	6	9380	9385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203989
113	NC_011724	ATT	2	6	9389	9394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203989
114	NC_011724	CAA	2	6	9520	9525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203989
115	NC_011724	ATA	3	9	9535	9543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203989
116	NC_011724	GAA	2	6	9585	9590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203989
117	NC_011724	TAT	2	6	9656	9661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203989
118	NC_011724	AAT	2	6	9696	9701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203989
119	NC_011724	ATC	2	6	9708	9713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203989
120	NC_011724	TAA	2	6	9772	9777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203989
121	NC_011724	TGA	2	6	9788	9793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203989
122	NC_011724	TAA	2	6	9826	9831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203989
123	NC_011724	AGA	2	6	9956	9961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203989
124	NC_011724	ATT	2	6	9979	9984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203989
125	NC_011724	ACA	2	6	10235	10240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203997
126	NC_011724	ATA	2	6	10277	10282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203997
127	NC_011724	ACT	2	6	10348	10353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203997
128	NC_011724	AAT	2	6	10456	10461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203997
129	NC_011724	CTT	2	6	10566	10571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203997
130	NC_011724	TAT	2	6	10585	10590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203997
131	NC_011724	ACT	2	6	10602	10607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203997
132	NC_011724	TCT	2	6	11000	11005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203984
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.