MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880102

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011723	AAAC	2	8	153	160	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011723	GCAG	2	8	451	458	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011723	TTCA	2	8	1585	1592	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011723	AATT	2	8	1654	1661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011723	TTCT	2	8	1863	1870	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011723	TCTT	2	8	2377	2384	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011723	AAAG	2	8	2458	2465	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011723	GAAT	2	8	2614	2621	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011723	CAAT	2	8	2837	2844	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011723	GAAG	2	8	3074	3081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011723	CAAT	2	8	3086	3093	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011723	TTTA	2	8	3345	3352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011723	TAAT	2	8	3365	3372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011723	TAGA	2	8	8582	8589	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011723	CAAA	2	8	10016	10023	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011723	AAAG	2	8	10062	10069	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011723	TGGG	2	8	12587	12594	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011723	TTGC	2	8	13811	13818	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011723	CAAT	2	8	14651	14658	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011723	CCGT	2	8	18541	18548	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011723	ACGG	2	8	18552	18559	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011723	TTAT	2	8	20382	20389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011723	TAAA	2	8	20391	20398	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011723	TAGA	2	8	20914	20921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011723	TTGA	2	8	20996	21003	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011723	CTTA	2	8	22617	22624	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011723	CTTA	2	8	22631	22638	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011723	AGAC	2	8	22847	22854	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011723	TAGA	2	8	29375	29382	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011723	TTTC	2	8	30519	30526	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011723	AATT	2	8	34822	34829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011723	ATCA	2	8	34867	34874	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011723	TAAC	2	8	35610	35617	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011723	TTGC	2	8	37540	37547	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011723	TCTA	2	8	37723	37730	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011723	TTTA	2	8	39530	39537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.