MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880102

Total Repeats: 517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011723	AGC	2	6	99	104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011723	TGA	2	6	237	242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011723	TTA	2	6	303	308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011723	TAA	2	6	485	490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011723	TAT	2	6	585	590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203934
6	NC_011723	AAC	2	6	687	692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203934
7	NC_011723	CAA	2	6	725	730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203934
8	NC_011723	GAT	2	6	742	747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203934
9	NC_011723	CTT	2	6	789	794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203934
10	NC_011723	TTG	2	6	858	863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203934
11	NC_011723	GAC	2	6	887	892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203934
12	NC_011723	TAC	2	6	930	935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203934
13	NC_011723	TGC	2	6	994	999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203934
14	NC_011723	AAT	2	6	1007	1012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203934
15	NC_011723	TCT	4	12	1108	1119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203934
16	NC_011723	AGC	2	6	1225	1230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203934
17	NC_011723	TAT	2	6	1250	1255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203934
18	NC_011723	TTC	3	9	1287	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203934
19	NC_011723	TTG	2	6	1410	1415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203934
20	NC_011723	TAA	2	6	1428	1433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203934
21	NC_011723	TAT	3	9	1514	1522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011723	AAC	2	6	1598	1603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011723	TGT	2	6	1669	1674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011723	ACG	2	6	1729	1734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011723	ATC	2	6	1771	1776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011723	TGA	2	6	1988	1993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011723	TTC	2	6	2092	2097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011723	ACA	2	6	2282	2287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011723	TAT	2	6	2319	2324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011723	TTC	2	6	2392	2397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011723	ATA	2	6	2473	2478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011723	ATT	2	6	2587	2592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011723	AGT	2	6	2680	2685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011723	GAA	2	6	2700	2705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011723	TAA	2	6	2752	2757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011723	TAT	2	6	2776	2781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011723	CAT	2	6	2802	2807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011723	TAT	2	6	2823	2828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011723	AGT	2	6	2929	2934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011723	CTT	2	6	2961	2966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011723	TTG	2	6	2971	2976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011723	TCT	2	6	3023	3028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011723	AGA	2	6	3029	3034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011723	TCT	2	6	3173	3178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011723	TAA	2	6	3201	3206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011723	ACT	2	6	3319	3324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011723	AAT	2	6	3334	3339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011723	AGA	2	6	3485	3490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011723	CAA	2	6	3493	3498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011723	ACA	2	6	3632	3637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203935
51	NC_011723	AAC	2	6	3665	3670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203935
52	NC_011723	CAT	2	6	3680	3685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203935
53	NC_011723	AAT	2	6	3736	3741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011723	TGA	2	6	3869	3874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203936
55	NC_011723	TGT	2	6	3885	3890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203936
56	NC_011723	GTT	2	6	3903	3908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203936
57	NC_011723	TCA	2	6	3950	3955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203936
58	NC_011723	TGC	2	6	3963	3968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203936
59	NC_011723	TCA	2	6	3985	3990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203936
60	NC_011723	ATG	2	6	3993	3998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203936
61	NC_011723	TAA	2	6	3999	4004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203936
62	NC_011723	CAA	2	6	4007	4012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203936
63	NC_011723	CTG	3	9	4052	4060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203936
64	NC_011723	ACA	2	6	4162	4167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203936
65	NC_011723	AAC	2	6	4176	4181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203936
66	NC_011723	GTT	2	6	4214	4219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203936
67	NC_011723	TGA	2	6	4350	4355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203936
68	NC_011723	TCA	2	6	4375	4380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203936
69	NC_011723	AAC	2	6	4458	4463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203936
70	NC_011723	CAA	2	6	4491	4496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203936
71	NC_011723	GCA	2	6	4537	4542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203936
72	NC_011723	AAC	2	6	4745	4750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011723	CTT	2	6	4840	4845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203937
74	NC_011723	CTC	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203937
75	NC_011723	TGC	2	6	4924	4929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203937
76	NC_011723	AAC	2	6	4991	4996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203937
77	NC_011723	GAC	2	6	5102	5107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203937
78	NC_011723	AAC	2	6	5152	5157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203937
79	NC_011723	GAC	2	6	5159	5164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203937
80	NC_011723	GAA	2	6	5194	5199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203937
81	NC_011723	TTA	2	6	5220	5225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203937
82	NC_011723	ATT	2	6	5346	5351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203937
83	NC_011723	AGT	2	6	5365	5370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203937
84	NC_011723	GGC	2	6	5403	5408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218203937
85	NC_011723	TAC	2	6	5438	5443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203937
86	NC_011723	CGG	2	6	5532	5537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218203937
87	NC_011723	ATC	2	6	5586	5591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203937
88	NC_011723	GAT	2	6	5594	5599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203937
89	NC_011723	TGC	2	6	5646	5651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203937
90	NC_011723	ATT	2	6	5712	5717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203937
91	NC_011723	AAG	2	6	5757	5762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203937
92	NC_011723	AGT	2	6	6122	6127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011723	ACA	2	6	6165	6170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203938
94	NC_011723	CGA	2	6	6248	6253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203938
95	NC_011723	TCG	2	6	6305	6310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203938
96	NC_011723	AGC	2	6	6311	6316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203938
97	NC_011723	GGT	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218203938
98	NC_011723	TGC	2	6	6373	6378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203938
99	NC_011723	GCC	2	6	6408	6413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218203938
100	NC_011723	AAT	2	6	6527	6532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203938
101	NC_011723	TTG	2	6	6570	6575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203938
102	NC_011723	ACA	2	6	6588	6593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203938
103	NC_011723	AAT	2	6	6681	6686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203938
104	NC_011723	ATT	2	6	7063	7068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011723	TTA	2	6	7150	7155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011723	TAT	2	6	7177	7182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011723	ATT	3	9	7232	7240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011723	CGA	2	6	7312	7317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011723	CAA	2	6	7407	7412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203939
110	NC_011723	TCT	2	6	7480	7485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203939
111	NC_011723	TAA	2	6	7588	7593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203939
112	NC_011723	TCC	2	6	7645	7650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203939
113	NC_011723	TAA	2	6	7737	7742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203939
114	NC_011723	TTC	3	9	7750	7758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203939
115	NC_011723	TCT	2	6	7779	7784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203939
116	NC_011723	TTC	2	6	7895	7900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203939
117	NC_011723	CTT	2	6	7904	7909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203939
118	NC_011723	TAA	2	6	8029	8034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203939
119	NC_011723	AAT	2	6	8048	8053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203939
120	NC_011723	TGC	2	6	8094	8099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203939
121	NC_011723	CTA	2	6	8241	8246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203939
122	NC_011723	ATA	2	6	8268	8273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203939
123	NC_011723	TCT	2	6	8313	8318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203939
124	NC_011723	GAT	3	9	8486	8494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011723	ATG	2	6	8503	8508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011723	TTG	2	6	8716	8721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011723	AAG	2	6	8833	8838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203940
128	NC_011723	GAG	2	6	8877	8882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203940
129	NC_011723	TCA	2	6	8981	8986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203940
130	NC_011723	ACC	2	6	8998	9003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203940
131	NC_011723	AAC	2	6	9004	9009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203940
132	NC_011723	CAT	2	6	9129	9134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203940
133	NC_011723	CTT	2	6	9138	9143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203940
134	NC_011723	ATT	2	6	9160	9165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203940
135	NC_011723	AGC	3	9	9193	9201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203940
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263	NC_011723	GCA	2	6	20853	20858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_011723	ACG	2	6	20886	20891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_011723	TTG	2	6	20961	20966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_011723	AAC	2	6	22687	22692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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