MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880102

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011723	AT	3	6	243	248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011723	AT	3	6	1764	1769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011723	GA	3	6	1832	1837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011723	AC	3	6	2108	2113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011723	TC	3	6	2921	2926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011723	AT	3	6	3242	3247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011723	GA	3	6	4092	4097	50 %	0 %	50 %	0 %	218203936
8	NC_011723	CT	3	6	5002	5007	0 %	50 %	0 %	50 %	218203937
9	NC_011723	GT	3	6	6900	6905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011723	AT	3	6	7515	7520	50 %	50 %	0 %	0 %	218203939
11	NC_011723	CT	3	6	8139	8144	0 %	50 %	0 %	50 %	218203939
12	NC_011723	TC	3	6	10229	10234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011723	TC	3	6	11007	11012	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011723	GA	3	6	11133	11138	50 %	0 %	50 %	0 %	218203943
15	NC_011723	CT	3	6	11419	11424	0 %	50 %	0 %	50 %	218203943
16	NC_011723	GA	3	6	13056	13061	50 %	0 %	50 %	0 %	218203945
17	NC_011723	AG	4	8	13375	13382	50 %	0 %	50 %	0 %	218203945
18	NC_011723	GA	3	6	13656	13661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011723	AG	3	6	14321	14326	50 %	0 %	50 %	0 %	218203946
20	NC_011723	CA	3	6	15865	15870	50 %	0 %	0 %	50 %	218203947
21	NC_011723	GA	3	6	16104	16109	50 %	0 %	50 %	0 %	218203948
22	NC_011723	AT	3	6	16379	16384	50 %	50 %	0 %	0 %	218203948
23	NC_011723	GA	3	6	16517	16522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011723	TA	3	6	17651	17656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011723	GA	3	6	20096	20101	50 %	0 %	50 %	0 %	218203953
26	NC_011723	TA	3	6	20364	20369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011723	TA	3	6	20408	20413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011723	GA	3	6	20612	20617	50 %	0 %	50 %	0 %	218203954
29	NC_011723	CT	3	6	21790	21795	0 %	50 %	0 %	50 %	218203955
30	NC_011723	GA	3	6	22324	22329	50 %	0 %	50 %	0 %	218203955
31	NC_011723	TA	3	6	23630	23635	50 %	50 %	0 %	0 %	218203956
32	NC_011723	TC	3	6	24725	24730	0 %	50 %	0 %	50 %	218203956
33	NC_011723	AT	3	6	25635	25640	50 %	50 %	0 %	0 %	218203956
34	NC_011723	TA	3	6	26755	26760	50 %	50 %	0 %	0 %	218203956
35	NC_011723	GA	3	6	27452	27457	50 %	0 %	50 %	0 %	218203957
36	NC_011723	AT	3	6	28308	28313	50 %	50 %	0 %	0 %	218203959
37	NC_011723	CT	3	6	28932	28937	0 %	50 %	0 %	50 %	218203959
38	NC_011723	CA	3	6	30037	30042	50 %	0 %	0 %	50 %	218203960
39	NC_011723	TC	3	6	32694	32699	0 %	50 %	0 %	50 %	218203964
40	NC_011723	AT	3	6	33463	33468	50 %	50 %	0 %	0 %	218203966
41	NC_011723	GA	3	6	35131	35136	50 %	0 %	50 %	0 %	218203970
42	NC_011723	AG	3	6	38168	38173	50 %	0 %	50 %	0 %	218203974
43	NC_011723	TA	3	6	38791	38796	50 %	50 %	0 %	0 %	218203974

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.