MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880102

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011723	T	6	6	253	258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011723	T	6	6	798	803	0 %	100 %	0 %	0 %	218203934
3	NC_011723	T	6	6	976	981	0 %	100 %	0 %	0 %	218203934
4	NC_011723	T	8	8	1014	1021	0 %	100 %	0 %	0 %	218203934
5	NC_011723	T	6	6	1126	1131	0 %	100 %	0 %	0 %	218203934
6	NC_011723	T	6	6	1355	1360	0 %	100 %	0 %	0 %	218203934
7	NC_011723	T	8	8	1492	1499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011723	T	6	6	1979	1984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011723	A	6	6	2052	2057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011723	T	6	6	2182	2187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011723	T	6	6	2239	2244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011723	T	6	6	2591	2596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011723	T	6	6	2640	2645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011723	T	6	6	2738	2743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011723	A	6	6	2993	2998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011723	T	6	6	3093	3098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011723	A	6	6	3223	3228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011723	A	6	6	3797	3802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011723	A	6	6	4495	4500	100 %	0 %	0 %	0 %	218203936
20	NC_011723	T	6	6	4832	4837	0 %	100 %	0 %	0 %	218203937
21	NC_011723	C	6	6	5296	5301	0 %	0 %	0 %	100 %	218203937
22	NC_011723	A	6	6	6810	6815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011723	T	7	7	7223	7229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011723	A	6	6	7251	7256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011723	T	7	7	7838	7844	0 %	100 %	0 %	0 %	218203939
26	NC_011723	T	6	6	8104	8109	0 %	100 %	0 %	0 %	218203939
27	NC_011723	A	6	6	8474	8479	100 %	0 %	0 %	0 %	218203939
28	NC_011723	T	6	6	8624	8629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011723	G	6	6	10176	10181	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011723	T	6	6	10496	10501	0 %	100 %	0 %	0 %	218203942
31	NC_011723	A	8	8	10514	10521	100 %	0 %	0 %	0 %	218203942
32	NC_011723	T	6	6	11060	11065	0 %	100 %	0 %	0 %	218203943
33	NC_011723	T	6	6	11307	11312	0 %	100 %	0 %	0 %	218203943
34	NC_011723	G	7	7	11452	11458	0 %	0 %	100 %	0 %	218203943
35	NC_011723	A	6	6	12046	12051	100 %	0 %	0 %	0 %	218203944
36	NC_011723	C	6	6	12153	12158	0 %	0 %	0 %	100 %	218203944
37	NC_011723	A	6	6	12324	12329	100 %	0 %	0 %	0 %	218203944
38	NC_011723	A	7	7	13621	13627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011723	T	7	7	14609	14615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011723	T	8	8	14677	14684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011723	T	6	6	15100	15105	0 %	100 %	0 %	0 %	218203947
42	NC_011723	T	6	6	15280	15285	0 %	100 %	0 %	0 %	218203947
43	NC_011723	T	6	6	15298	15303	0 %	100 %	0 %	0 %	218203947
44	NC_011723	A	7	7	16268	16274	100 %	0 %	0 %	0 %	218203948
45	NC_011723	C	6	6	16766	16771	0 %	0 %	0 %	100 %	218203949
46	NC_011723	A	7	7	16831	16837	100 %	0 %	0 %	0 %	218203949
47	NC_011723	T	8	8	16881	16888	0 %	100 %	0 %	0 %	218203949
48	NC_011723	T	7	7	16930	16936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011723	T	6	6	16961	16966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011723	A	7	7	16967	16973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011723	A	7	7	16983	16989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011723	A	7	7	17458	17464	100 %	0 %	0 %	0 %	218203950
53	NC_011723	A	6	6	17482	17487	100 %	0 %	0 %	0 %	218203950
54	NC_011723	T	6	6	17933	17938	0 %	100 %	0 %	0 %	218203951
55	NC_011723	A	7	7	18468	18474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011723	A	6	6	20063	20068	100 %	0 %	0 %	0 %	218203953
57	NC_011723	T	6	6	20738	20743	0 %	100 %	0 %	0 %	218203954
58	NC_011723	T	6	6	20780	20785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011723	A	7	7	21208	21214	100 %	0 %	0 %	0 %	218203955
60	NC_011723	A	7	7	21323	21329	100 %	0 %	0 %	0 %	218203955
61	NC_011723	A	6	6	21681	21686	100 %	0 %	0 %	0 %	218203955
62	NC_011723	G	6	6	21962	21967	0 %	0 %	100 %	0 %	218203955
63	NC_011723	A	6	6	22104	22109	100 %	0 %	0 %	0 %	218203955
64	NC_011723	A	6	6	22753	22758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011723	A	6	6	22894	22899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011723	A	7	7	23917	23923	100 %	0 %	0 %	0 %	218203956
67	NC_011723	A	6	6	24330	24335	100 %	0 %	0 %	0 %	218203956
68	NC_011723	A	6	6	24602	24607	100 %	0 %	0 %	0 %	218203956
69	NC_011723	A	6	6	24718	24723	100 %	0 %	0 %	0 %	218203956
70	NC_011723	A	6	6	25084	25089	100 %	0 %	0 %	0 %	218203956
71	NC_011723	A	6	6	25207	25212	100 %	0 %	0 %	0 %	218203956
72	NC_011723	A	6	6	25288	25293	100 %	0 %	0 %	0 %	218203956
73	NC_011723	A	6	6	26095	26100	100 %	0 %	0 %	0 %	218203956
74	NC_011723	A	6	6	26284	26289	100 %	0 %	0 %	0 %	218203956
75	NC_011723	A	6	6	27350	27355	100 %	0 %	0 %	0 %	218203957
76	NC_011723	T	7	7	28016	28022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011723	A	6	6	28044	28049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011723	T	7	7	28631	28637	0 %	100 %	0 %	0 %	218203959
79	NC_011723	T	6	6	28897	28902	0 %	100 %	0 %	0 %	218203959
80	NC_011723	A	6	6	29267	29272	100 %	0 %	0 %	0 %	218203959
81	NC_011723	T	6	6	29417	29422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011723	G	6	6	29613	29618	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011723	C	6	6	29623	29628	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
84	NC_011723	C	6	6	29632	29637	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
85	NC_011723	T	6	6	29819	29824	0 %	100 %	0 %	0 %	218203960
86	NC_011723	A	6	6	30053	30058	100 %	0 %	0 %	0 %	218203960
87	NC_011723	A	6	6	32778	32783	100 %	0 %	0 %	0 %	218203964
88	NC_011723	T	7	7	32813	32819	0 %	100 %	0 %	0 %	218203964
89	NC_011723	T	7	7	33298	33304	0 %	100 %	0 %	0 %	218203966
90	NC_011723	C	6	6	34246	34251	0 %	0 %	0 %	100 %	218203968
91	NC_011723	G	6	6	34555	34560	0 %	0 %	100 %	0 %	218203969
92	NC_011723	G	6	6	34564	34569	0 %	0 %	100 %	0 %	218203969
93	NC_011723	C	6	6	34574	34579	0 %	0 %	0 %	100 %	218203969
94	NC_011723	A	6	6	34926	34931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011723	T	7	7	35565	35571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011723	A	7	7	35580	35586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011723	C	6	6	36454	36459	0 %	0 %	0 %	100 %	218203973
98	NC_011723	A	6	6	36905	36910	100 %	0 %	0 %	0 %	218203973
99	NC_011723	A	7	7	37273	37279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011723	T	6	6	37615	37620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011723	A	6	6	37683	37688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011723	T	6	6	37833	37838	0 %	100 %	0 %	0 %	218203974
103	NC_011723	A	6	6	38203	38208	100 %	0 %	0 %	0 %	218203974
104	NC_011723	A	7	7	38468	38474	100 %	0 %	0 %	0 %	218203974
105	NC_011723	T	6	6	39056	39061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011723	A	7	7	39083	39089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011723	C	6	6	39567	39572	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
108	NC_011723	C	7	7	39960	39966	0 %	0 %	0 %	100 %	218203976
109	NC_011723	A	6	6	40166	40171	100 %	0 %	0 %	0 %	218203977
110	NC_011723	C	6	6	40605	40610	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.