MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-9

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011722	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011722	ATTAA	2	10	1783	1792	60 %	40 %	0 %	0 %	218203924
3	NC_011722	TGGCA	2	10	2333	2342	20 %	20 %	40 %	20 %	218203898
4	NC_011722	AATTA	2	10	2574	2583	60 %	40 %	0 %	0 %	218203898
5	NC_011722	AAGAG	2	10	3413	3422	60 %	0 %	40 %	0 %	218203907
6	NC_011722	TTCAA	2	10	4392	4401	40 %	40 %	0 %	20 %	218203914
7	NC_011722	GAAAA	2	10	6928	6937	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011722	CTGCA	2	10	7582	7591	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_011722	CAAAA	2	10	9495	9504	80 %	0 %	0 %	20 %	218203910
10	NC_011722	GAAAA	2	10	10382	10391	80 %	0 %	20 %	0 %	218203931
11	NC_011722	AATCT	2	10	12298	12307	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011722	TACTT	2	10	13324	13333	20 %	60 %	0 %	20 %	218203922
13	NC_011722	GAAAA	2	10	13402	13411	80 %	0 %	20 %	0 %	218203922
14	NC_011722	AAAGT	2	10	13424	13433	60 %	20 %	20 %	0 %	218203922
15	NC_011722	ATTAA	2	10	15269	15278	60 %	40 %	0 %	0 %	218203915
16	NC_011722	AGTAA	2	10	15906	15915	60 %	20 %	20 %	0 %	218203930
17	NC_011722	TCACT	2	10	16063	16072	20 %	40 %	0 %	40 %	218203930
18	NC_011722	TTGCT	2	10	16160	16169	0 %	60 %	20 %	20 %	218203905
19	NC_011722	TATGT	2	10	16270	16279	20 %	60 %	20 %	0 %	218203905
20	NC_011722	AATTT	2	10	18673	18682	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011722	CACTA	2	10	19285	19294	40 %	20 %	0 %	40 %	218203932
22	NC_011722	TTAAA	2	10	20928	20937	60 %	40 %	0 %	0 %	218203916
23	NC_011722	AAATA	2	10	21522	21531	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011722	TTTTA	2	10	22644	22653	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011722	AAGTT	2	10	23965	23974	40 %	40 %	20 %	0 %	218203928
26	NC_011722	ATAAA	2	10	24410	24419	80 %	20 %	0 %	0 %	218203904
27	NC_011722	ACTTG	2	10	24759	24768	20 %	40 %	20 %	20 %	218203904
28	NC_011722	AATTT	2	10	25840	25849	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011722	AAGAA	2	10	26271	26280	80 %	0 %	20 %	0 %	218203908
30	NC_011722	AACAA	2	10	27053	27062	80 %	0 %	0 %	20 %	218203911
31	NC_011722	TAAAT	2	10	27459	27468	60 %	40 %	0 %	0 %	218203911

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.