MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-9

Total Repeats: 293

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011722	AGA	2	6	1320	1325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203924
2	NC_011722	AGA	2	6	1329	1334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203924
3	NC_011722	AGA	2	6	1353	1358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203924
4	NC_011722	GCA	2	6	1359	1364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203924
5	NC_011722	ATT	2	6	1533	1538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203924
6	NC_011722	AGG	2	6	1607	1612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203924
7	NC_011722	TCT	2	6	1816	1821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203924
8	NC_011722	TTG	2	6	1844	1849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203924
9	NC_011722	AGA	2	6	1857	1862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203924
10	NC_011722	AGA	2	6	2039	2044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203898
11	NC_011722	TAG	2	6	2174	2179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203898
12	NC_011722	ACA	2	6	2259	2264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203898
13	NC_011722	TGG	3	9	2282	2290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218203898
14	NC_011722	GAA	2	6	2700	2705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203929
15	NC_011722	TAG	2	6	2813	2818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203929
16	NC_011722	GTT	2	6	2827	2832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203929
17	NC_011722	AGA	2	6	2897	2902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203929
18	NC_011722	TAG	2	6	3035	3040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203929
19	NC_011722	TTA	2	6	3145	3150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203929
20	NC_011722	TGG	3	9	3158	3166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218203929
21	NC_011722	CCA	2	6	3168	3173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203929
22	NC_011722	TGG	2	6	3341	3346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218203929
23	NC_011722	ATT	2	6	3396	3401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203907
24	NC_011722	ATC	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203907
25	NC_011722	TGG	3	9	3657	3665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218203907
26	NC_011722	AAT	2	6	3736	3741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203907
27	NC_011722	TAG	2	6	3755	3760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203907
28	NC_011722	TAA	2	6	3801	3806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203907
29	NC_011722	CAC	2	6	3836	3841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203907
30	NC_011722	ATT	2	6	3981	3986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203914
31	NC_011722	TGA	2	6	3987	3992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203914
32	NC_011722	ATT	2	6	3995	4000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203914
33	NC_011722	TAA	2	6	4299	4304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203914
34	NC_011722	ATT	2	6	4351	4356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203914
35	NC_011722	TTA	2	6	4361	4366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203914
36	NC_011722	CTT	2	6	4447	4452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203914
37	NC_011722	AGA	2	6	4473	4478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203914
38	NC_011722	TAA	2	6	4491	4496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203914
39	NC_011722	ATG	2	6	4576	4581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203914
40	NC_011722	GCA	3	9	4627	4635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203914
41	NC_011722	GCA	2	6	4642	4647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203914
42	NC_011722	GGA	2	6	4665	4670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203914
43	NC_011722	TAA	2	6	4698	4703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203914
44	NC_011722	AGA	2	6	4707	4712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203914
45	NC_011722	TTA	2	6	4778	4783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203914
46	NC_011722	AGG	2	6	4878	4883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203914
47	NC_011722	CTA	2	6	4892	4897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203914
48	NC_011722	GAA	3	9	4994	5002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203925
49	NC_011722	GTT	2	6	5207	5212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203925
50	NC_011722	ATT	2	6	5268	5273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203925
51	NC_011722	TAG	2	6	5278	5283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203925
52	NC_011722	GAA	2	6	5294	5299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203925
53	NC_011722	TGT	2	6	5502	5507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203913
54	NC_011722	TTC	2	6	5523	5528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203913
55	NC_011722	TTA	2	6	5576	5581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203913
56	NC_011722	TGG	2	6	5825	5830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218203923
57	NC_011722	TAG	2	6	5906	5911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203923
58	NC_011722	AAT	2	6	5934	5939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203923
59	NC_011722	CTA	2	6	6027	6032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203923
60	NC_011722	GCA	2	6	6102	6107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203923
61	NC_011722	TTG	2	6	6115	6120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203923
62	NC_011722	AAT	2	6	6242	6247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203926
63	NC_011722	ATC	2	6	6276	6281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203926
64	NC_011722	GCT	2	6	6302	6307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203926
65	NC_011722	ATA	2	6	6317	6322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203926
66	NC_011722	TAA	2	6	6559	6564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203926
67	NC_011722	AGG	2	6	6699	6704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203926
68	NC_011722	TGG	2	6	7880	7885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218203919
69	NC_011722	ACA	2	6	7929	7934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203919
70	NC_011722	TAG	2	6	7946	7951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203919
71	NC_011722	TAA	2	6	7972	7977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203919
72	NC_011722	TGA	2	6	8066	8071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203919
73	NC_011722	ACA	2	6	8080	8085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203919
74	NC_011722	ATT	2	6	8148	8153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203919
75	NC_011722	AAG	2	6	8186	8191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203919
76	NC_011722	CTG	2	6	8197	8202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203919
77	NC_011722	ACA	2	6	8260	8265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203919
78	NC_011722	TGA	2	6	8783	8788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203917
79	NC_011722	TAC	2	6	8871	8876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203917
80	NC_011722	TGC	2	6	9027	9032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203910
81	NC_011722	TAG	2	6	9156	9161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203910
82	NC_011722	AGA	2	6	9274	9279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203910
83	NC_011722	TTG	2	6	9383	9388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203910
84	NC_011722	CAT	2	6	9420	9425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203910
85	NC_011722	GGA	2	6	9448	9453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203910
86	NC_011722	GAA	2	6	9484	9489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203910
87	NC_011722	AGA	2	6	9630	9635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203910
88	NC_011722	GTG	2	6	9743	9748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218203910
89	NC_011722	AGC	2	6	9754	9759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203910
90	NC_011722	CTA	2	6	9820	9825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203910
91	NC_011722	AGA	2	6	9855	9860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203910
92	NC_011722	GAT	2	6	9918	9923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203910
93	NC_011722	CTG	2	6	9974	9979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203910
94	NC_011722	ATT	2	6	9982	9987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203910
95	NC_011722	ACT	2	6	10033	10038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203910
96	NC_011722	TAA	2	6	10065	10070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203910
97	NC_011722	ATT	2	6	10111	10116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203910
98	NC_011722	ATT	2	6	10157	10162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203910
99	NC_011722	AAG	2	6	10235	10240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203910
100	NC_011722	TAA	3	9	10351	10359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203931
101	NC_011722	AAT	2	6	10447	10452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203931
102	NC_011722	TAA	2	6	10461	10466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203931
103	NC_011722	GTT	2	6	10605	10610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203931
104	NC_011722	ATT	2	6	10629	10634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203931
105	NC_011722	ATT	2	6	10690	10695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203931
106	NC_011722	AAC	2	6	10800	10805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203931
107	NC_011722	TGA	2	6	10915	10920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203931
108	NC_011722	TAC	2	6	10995	11000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203903
109	NC_011722	GAA	2	6	11072	11077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203903
110	NC_011722	ATC	2	6	11090	11095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203903
111	NC_011722	CGA	2	6	11212	11217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203903
112	NC_011722	CCT	2	6	11306	11311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203903
113	NC_011722	TTA	2	6	11363	11368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203903
114	NC_011722	TTC	2	6	11381	11386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203903
115	NC_011722	AAG	2	6	11406	11411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203903
116	NC_011722	AGG	2	6	11439	11444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203903
117	NC_011722	ATT	2	6	11507	11512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203903
118	NC_011722	AGA	2	6	11680	11685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203903
119	NC_011722	CAA	2	6	11708	11713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203903
120	NC_011722	AGA	2	6	11905	11910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203903
121	NC_011722	AAT	2	6	12558	12563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203902
122	NC_011722	TAA	2	6	12578	12583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203902
123	NC_011722	TTG	2	6	12595	12600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203902
124	NC_011722	GAA	2	6	12609	12614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203902
125	NC_011722	CTC	2	6	12670	12675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203902
126	NC_011722	TAA	2	6	12781	12786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203902
127	NC_011722	ACT	2	6	12795	12800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203902
128	NC_011722	TGA	2	6	12973	12978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203922
129	NC_011722	ATT	2	6	13001	13006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203922
130	NC_011722	TCT	2	6	13010	13015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203922
131	NC_011722	GAA	3	9	13028	13036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203922
132	NC_011722	GCT	2	6	13094	13099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203922
133	NC_011722	GAA	2	6	13103	13108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203922
134	NC_011722	TTC	2	6	13114	13119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203922
135	NC_011722	TGA	2	6	13165	13170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203922
136	NC_011722	AAC	2	6	13309	13314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203922
137	NC_011722	ATT	2	6	13502	13507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203922
138	NC_011722	ATG	2	6	13686	13691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203922
139	NC_011722	ACA	2	6	13712	13717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203922
140	NC_011722	CTT	2	6	15284	15289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203915
141	NC_011722	TTC	2	6	15360	15365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203915
142	NC_011722	TTA	2	6	15374	15379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203915
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147	NC_011722	ATA	2	6	16023	16028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203930
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152	NC_011722	ATA	2	6	16397	16402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203905
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251	NC_011722	ATT	2	6	25593	25598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203921
252	NC_011722	ATG	2	6	26114	26119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203908
253	NC_011722	AGT	2	6	26125	26130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203908
254	NC_011722	ATG	2	6	26153	26158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203908
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.