MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880101

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011721	CGATCT	2	12	7051	7062	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218203851
2	NC_011721	TAACTT	2	12	7976	7987	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_011721	TGTTTC	2	12	10197	10208	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218203854
4	NC_011721	TTTTAC	2	12	13964	13975	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218203860
5	NC_011721	TCTTCC	2	12	14037	14048	0 %	50 %	0 %	50 %	218203860
6	NC_011721	GCATTC	2	12	22344	22355	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011721	ATCTCG	2	12	27290	27301	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218203878
8	NC_011721	TTTTAC	2	12	30460	30471	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218203881
9	NC_011721	TCTTCC	2	12	30533	30544	0 %	50 %	0 %	50 %	218203881
10	NC_011721	ACCAGA	2	12	32387	32398	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011721	CATTGC	2	12	32569	32580	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011721	GAGAAA	2	12	33040	33051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011721	GCAATG	2	12	33285	33296	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_011721	GGACAA	2	12	34911	34922	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011721	CTATCG	2	12	38927	38938	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218203883
16	NC_011721	CCAGAA	2	12	42139	42150	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011721	TTTTAC	2	12	44208	44219	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218203889
18	NC_011721	TCTTCC	2	12	44281	44292	0 %	50 %	0 %	50 %	218203889

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.