MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880101

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011721	ATTTT	2	10	1212	1221	20 %	80 %	0 %	0 %	218203847
2	NC_011721	TTTTA	2	10	2265	2274	20 %	80 %	0 %	0 %	218203848
3	NC_011721	GCTAC	2	10	4506	4515	20 %	20 %	20 %	40 %	218203849
4	NC_011721	ACAGT	2	10	4838	4847	40 %	20 %	20 %	20 %	218203849
5	NC_011721	CAGGA	2	10	6115	6124	40 %	0 %	40 %	20 %	218203850
6	NC_011721	GAGAA	2	10	7991	8000	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011721	GAAAG	2	10	8112	8121	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011721	TAAAA	2	10	8512	8521	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011721	TGATT	2	10	10316	10325	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011721	ATAAG	2	10	10355	10364	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011721	GCAAC	2	10	11718	11727	40 %	0 %	20 %	40 %	218203856
12	NC_011721	TAGAA	2	10	14013	14022	60 %	20 %	20 %	0 %	218203860
13	NC_011721	GAAAC	2	10	14412	14421	60 %	0 %	20 %	20 %	218203860
14	NC_011721	AAGTC	2	10	15257	15266	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_011721	ACAAA	2	10	19554	19563	80 %	0 %	0 %	20 %	218203868
16	NC_011721	AAGAT	2	10	20082	20091	60 %	20 %	20 %	0 %	218203869
17	NC_011721	TTAAG	2	10	20576	20585	40 %	40 %	20 %	0 %	218203870
18	NC_011721	ACAAA	2	10	21316	21325	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011721	TTTTA	2	10	24328	24337	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011721	TCCAA	2	10	25054	25063	40 %	20 %	0 %	40 %	218203875
21	NC_011721	ATTTT	2	10	26226	26235	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011721	CTGTC	2	10	28048	28057	0 %	40 %	20 %	40 %	218203879
23	NC_011721	GCTCC	2	10	28126	28135	0 %	20 %	20 %	60 %	218203879
24	NC_011721	AGTCG	2	10	29262	29271	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011721	AAGCA	2	10	29544	29553	60 %	0 %	20 %	20 %	218203880
26	NC_011721	GATCA	2	10	29593	29602	40 %	20 %	20 %	20 %	218203880
27	NC_011721	TAGAA	2	10	30509	30518	60 %	20 %	20 %	0 %	218203881
28	NC_011721	GAAAC	2	10	30908	30917	60 %	0 %	20 %	20 %	218203881
29	NC_011721	AAGTC	2	10	31753	31762	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_011721	AGTCT	2	10	32060	32069	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011721	ACCGT	2	10	33215	33224	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_011721	TAGAC	2	10	33795	33804	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011721	TTTAA	2	10	34057	34066	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011721	TGGCT	2	10	34296	34305	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011721	GAAAA	2	10	36398	36407	80 %	0 %	20 %	0 %	218203882
36	NC_011721	TCATC	2	10	38311	38320	20 %	40 %	0 %	40 %	218203882
37	NC_011721	AAGAC	2	10	39547	39556	60 %	0 %	20 %	20 %	218203884
38	NC_011721	TCGAT	2	10	42065	42074	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_011721	TAGAA	2	10	44257	44266	60 %	20 %	20 %	0 %	218203889
40	NC_011721	GAAAC	2	10	44656	44665	60 %	0 %	20 %	20 %	218203889
41	NC_011721	AAGTC	2	10	45501	45510	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_011721	TTAGT	2	10	49893	49902	20 %	60 %	20 %	0 %	218203894
43	NC_011721	TTAGT	2	10	50262	50271	20 %	60 %	20 %	0 %	218203895
44	NC_011721	TTAGT	2	10	50631	50640	20 %	60 %	20 %	0 %	218203896

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.