MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880101

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011721	ATTTT	2	10	1212	1221	20 %	80 %	0 %	0 %	218203847
2	NC_011721	TTTTA	2	10	2265	2274	20 %	80 %	0 %	0 %	218203848
3	NC_011721	GCTAC	2	10	4506	4515	20 %	20 %	20 %	40 %	218203849
4	NC_011721	ACAGT	2	10	4838	4847	40 %	20 %	20 %	20 %	218203849
5	NC_011721	CAGGA	2	10	6115	6124	40 %	0 %	40 %	20 %	218203850
6	NC_011721	GCAAC	2	10	11718	11727	40 %	0 %	20 %	40 %	218203856
7	NC_011721	TAGAA	2	10	14013	14022	60 %	20 %	20 %	0 %	218203860
8	NC_011721	GAAAC	2	10	14412	14421	60 %	0 %	20 %	20 %	218203860
9	NC_011721	ACAAA	2	10	19554	19563	80 %	0 %	0 %	20 %	218203868
10	NC_011721	AAGAT	2	10	20082	20091	60 %	20 %	20 %	0 %	218203869
11	NC_011721	TTAAG	2	10	20576	20585	40 %	40 %	20 %	0 %	218203870
12	NC_011721	TCCAA	2	10	25054	25063	40 %	20 %	0 %	40 %	218203875
13	NC_011721	CTGTC	2	10	28048	28057	0 %	40 %	20 %	40 %	218203879
14	NC_011721	GCTCC	2	10	28126	28135	0 %	20 %	20 %	60 %	218203879
15	NC_011721	AAGCA	2	10	29544	29553	60 %	0 %	20 %	20 %	218203880
16	NC_011721	GATCA	2	10	29593	29602	40 %	20 %	20 %	20 %	218203880
17	NC_011721	TAGAA	2	10	30509	30518	60 %	20 %	20 %	0 %	218203881
18	NC_011721	GAAAC	2	10	30908	30917	60 %	0 %	20 %	20 %	218203881
19	NC_011721	GAAAA	2	10	36398	36407	80 %	0 %	20 %	0 %	218203882
20	NC_011721	TCATC	2	10	38311	38320	20 %	40 %	0 %	40 %	218203882
21	NC_011721	AAGAC	2	10	39547	39556	60 %	0 %	20 %	20 %	218203884
22	NC_011721	TAGAA	2	10	44257	44266	60 %	20 %	20 %	0 %	218203889
23	NC_011721	GAAAC	2	10	44656	44665	60 %	0 %	20 %	20 %	218203889
24	NC_011721	TTAGT	2	10	49893	49902	20 %	60 %	20 %	0 %	218203894
25	NC_011721	TTAGT	2	10	50262	50271	20 %	60 %	20 %	0 %	218203895
26	NC_011721	TTAGT	2	10	50631	50640	20 %	60 %	20 %	0 %	218203896

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.