MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880101

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011721	GGAA	2	8	5	12	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011721	ATTA	2	8	992	999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011721	AATA	2	8	1135	1142	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011721	TAGA	2	8	8351	8358	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011721	TCCA	2	8	8632	8639	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011721	TAGA	2	8	8846	8853	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011721	TTAT	2	8	10226	10233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011721	GACT	2	8	10244	10251	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011721	TCAG	2	8	10258	10265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011721	TAAT	2	8	11547	11554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011721	TTAA	2	8	11609	11616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011721	TCTA	2	8	13801	13808	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011721	TTAA	2	8	15757	15764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011721	GAAT	2	8	17855	17862	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011721	ATCT	2	8	21488	21495	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011721	ATTT	2	8	21598	21605	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011721	ATTT	2	8	21876	21883	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011721	TTCA	2	8	22596	22603	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011721	CAGA	2	8	22649	22656	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011721	CGTC	2	8	22740	22747	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011721	CAGA	2	8	22889	22896	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011721	TCTA	2	8	23996	24003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011721	TGGA	2	8	24210	24217	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011721	TCTA	2	8	24491	24498	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011721	TTCT	2	8	24722	24729	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011721	GGCT	2	8	27133	27140	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011721	ATAA	2	8	29352	29359	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011721	TCTA	2	8	30297	30304	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011721	ATCT	2	8	32016	32023	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011721	AATC	2	8	32145	32152	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011721	ACAA	2	8	32346	32353	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011721	TTTG	2	8	33511	33518	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011721	TGAT	2	8	33712	33719	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011721	TCTT	2	8	34100	34107	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011721	TAAT	2	8	34662	34669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011721	GATA	2	8	34857	34864	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011721	ATCA	2	8	34896	34903	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011721	TAAA	2	8	43362	43369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011721	TCTA	2	8	44045	44052	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011721	AAAT	2	8	45646	45653	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011721	TTCT	2	8	47266	47273	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011721	ACAA	2	8	47329	47336	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011721	GACT	2	8	47342	47349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011721	CTAT	2	8	48344	48351	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011721	TTAA	2	8	48642	48649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011721	TTGA	2	8	48659	48666	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.