MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880101

Total Repeats: 636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011721	CAA	2	6	17	22	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011721	GAG	2	6	251	256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203845
3	NC_011721	GGA	2	6	284	289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203845
4	NC_011721	GAT	3	9	331	339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203845
5	NC_011721	AAG	2	6	411	416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203845
6	NC_011721	ATA	2	6	485	490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203845
7	NC_011721	TAA	2	6	567	572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203846
8	NC_011721	TGT	2	6	583	588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203846
9	NC_011721	ATA	2	6	672	677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203846
10	NC_011721	AGG	2	6	745	750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203846
11	NC_011721	AAG	2	6	771	776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203846
12	NC_011721	CTC	2	6	870	875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203846
13	NC_011721	TTA	2	6	886	891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203846
14	NC_011721	AGA	2	6	1188	1193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011721	AAC	2	6	1246	1251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203847
16	NC_011721	ATT	2	6	1287	1292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203847
17	NC_011721	TTC	2	6	1378	1383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203847
18	NC_011721	TAA	2	6	1431	1436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203847
19	NC_011721	ATA	2	6	1455	1460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203847
20	NC_011721	ACA	2	6	1609	1614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203847
21	NC_011721	CTC	2	6	1739	1744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203848
22	NC_011721	TAA	2	6	1896	1901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203848
23	NC_011721	ATA	2	6	1994	1999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203848
24	NC_011721	TTA	2	6	2018	2023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203848
25	NC_011721	ATA	2	6	2225	2230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203848
26	NC_011721	TGA	2	6	2280	2285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203848
27	NC_011721	ATA	2	6	2384	2389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203848
28	NC_011721	TTA	2	6	2432	2437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203848
29	NC_011721	ATA	2	6	2480	2485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203848
30	NC_011721	AAT	2	6	2679	2684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203848
31	NC_011721	TTA	2	6	2692	2697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203848
32	NC_011721	CTG	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011721	TGA	2	6	2800	2805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011721	TAA	2	6	2868	2873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011721	TAT	2	6	3083	3088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203849
36	NC_011721	TCA	2	6	3092	3097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203849
37	NC_011721	TCT	2	6	3269	3274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203849
38	NC_011721	GAA	2	6	3402	3407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203849
39	NC_011721	GAT	2	6	3417	3422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203849
40	NC_011721	CCA	2	6	3424	3429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203849
41	NC_011721	ATT	2	6	3434	3439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203849
42	NC_011721	GCC	2	6	3459	3464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218203849
43	NC_011721	TAT	2	6	3487	3492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203849
44	NC_011721	TGA	2	6	3611	3616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203849
45	NC_011721	CAA	2	6	3669	3674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203849
46	NC_011721	GAG	2	6	3706	3711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203849
47	NC_011721	CGC	2	6	3808	3813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218203849
48	NC_011721	AAG	2	6	3934	3939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203849
49	NC_011721	CAA	2	6	4155	4160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203849
50	NC_011721	GAA	2	6	4209	4214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203849
51	NC_011721	TTA	2	6	4245	4250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203849
52	NC_011721	TGG	2	6	4309	4314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218203849
53	NC_011721	AAC	2	6	4378	4383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203849
54	NC_011721	TCC	2	6	4475	4480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203849
55	NC_011721	CTT	2	6	4498	4503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203849
56	NC_011721	TTG	2	6	4632	4637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203849
57	NC_011721	AGA	2	6	4649	4654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203849
58	NC_011721	AAC	2	6	4655	4660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203849
59	NC_011721	AGA	2	6	4751	4756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203849
60	NC_011721	AGA	2	6	4759	4764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203849
61	NC_011721	CAT	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203849
62	NC_011721	AAC	2	6	4990	4995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203849
63	NC_011721	AAC	2	6	5016	5021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203849
64	NC_011721	TAT	2	6	5153	5158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203849
65	NC_011721	ACC	2	6	5163	5168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203849
66	NC_011721	AAG	2	6	5284	5289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011721	TTC	2	6	5310	5315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011721	GCA	2	6	5450	5455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203850
69	NC_011721	GCA	2	6	5620	5625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203850
70	NC_011721	TAT	2	6	5744	5749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203850
71	NC_011721	ACG	2	6	5768	5773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203850
72	NC_011721	CCT	2	6	5882	5887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203850
73	NC_011721	AGC	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203850
74	NC_011721	ATT	2	6	6183	6188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203850
75	NC_011721	AAG	4	12	6193	6204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203850
76	NC_011721	TTA	2	6	6243	6248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203850
77	NC_011721	TAT	2	6	6297	6302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203850
78	NC_011721	CAA	2	6	6333	6338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203850
79	NC_011721	ATT	2	6	6433	6438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203850
80	NC_011721	TAA	2	6	6458	6463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203850
81	NC_011721	CTG	2	6	6549	6554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203851
82	NC_011721	TCA	2	6	6654	6659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203851
83	NC_011721	GTC	2	6	6660	6665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203851
84	NC_011721	AAG	2	6	6720	6725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203851
85	NC_011721	TAT	2	6	6825	6830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203851
86	NC_011721	ATT	2	6	6909	6914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203851
87	NC_011721	ACC	2	6	6968	6973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203851
88	NC_011721	GTT	2	6	7376	7381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203851
89	NC_011721	TCC	2	6	7403	7408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203851
90	NC_011721	TTC	2	6	7516	7521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203851
91	NC_011721	TAA	2	6	7609	7614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203851
92	NC_011721	AGA	2	6	7786	7791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011721	CAA	2	6	7808	7813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011721	ATC	2	6	8063	8068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011721	TAA	2	6	8147	8152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011721	CTT	2	6	8380	8385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011721	GTT	2	6	8444	8449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011721	TTC	2	6	8478	8483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011721	TTA	2	6	8535	8540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011721	ATG	2	6	8608	8613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011721	AAT	2	6	8642	8647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011721	GAG	2	6	8745	8750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011721	TTA	2	6	8810	8815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011721	CTC	2	6	8974	8979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203852
105	NC_011721	TAT	2	6	9033	9038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203852
106	NC_011721	CAT	2	6	9049	9054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203852
107	NC_011721	TAA	2	6	9074	9079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203852
108	NC_011721	TTA	2	6	9154	9159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203852
109	NC_011721	GAA	2	6	9160	9165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203852
110	NC_011721	TGA	2	6	9230	9235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203852
111	NC_011721	TTG	2	6	9299	9304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011721	AAG	2	6	9458	9463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011721	AAT	2	6	9569	9574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203853
114	NC_011721	CAG	2	6	9585	9590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203853
115	NC_011721	GCC	2	6	9617	9622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218203853
116	NC_011721	CTT	2	6	9641	9646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203854
117	NC_011721	AAG	2	6	9661	9666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203854
118	NC_011721	CCT	2	6	9709	9714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203854
119	NC_011721	TAT	2	6	9732	9737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203854
120	NC_011721	TAA	2	6	9777	9782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203854
121	NC_011721	TTG	2	6	9801	9806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203854
122	NC_011721	TAT	2	6	9923	9928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203854
123	NC_011721	TGA	2	6	10081	10086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203854
124	NC_011721	GAG	2	6	10096	10101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203854
125	NC_011721	TAA	2	6	10110	10115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203854
126	NC_011721	TAA	2	6	10282	10287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011721	GTG	2	6	10330	10335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011721	TAG	2	6	10344	10349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011721	TTC	2	6	10686	10691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203855
130	NC_011721	ATA	2	6	10738	10743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203855
131	NC_011721	GTA	2	6	10830	10835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203855
132	NC_011721	ATG	2	6	10842	10847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203855
133	NC_011721	TTG	2	6	10904	10909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203855
134	NC_011721	CAA	2	6	11016	11021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203855
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262	NC_011721	GCT	2	6	21125	21130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203872
263	NC_011721	AAT	2	6	21244	21249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_011721	AAT	2	6	21344	21349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_011721	TTG	2	6	21405	21410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
266	NC_011721	CTG	2	6	21548	21553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_011721	AGA	2	6	21666	21671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
268	NC_011721	CAT	2	6	21692	21697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_011721	AAC	2	6	21712	21717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_011721	AAG	2	6	21726	21731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
271	NC_011721	CAA	2	6	21769	21774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_011721	TAT	2	6	21796	21801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_011721	ATT	2	6	21827	21832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_011721	AGA	2	6	21923	21928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
275	NC_011721	GAA	2	6	22039	22044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
276	NC_011721	GTA	2	6	22048	22053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
277	NC_011721	GAA	2	6	22060	22065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_011721	TGA	2	6	22133	22138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NC_011721	ATC	2	6	22250	22255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_011721	AGA	2	6	22271	22276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_011721	TTG	2	6	22363	22368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_011721	TAT	2	6	22525	22530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_011721	TTA	2	6	22560	22565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_011721	GAA	2	6	22605	22610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
285	NC_011721	TTA	2	6	22665	22670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_011721	TTA	2	6	22672	22677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_011721	TTA	2	6	22686	22691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_011721	AGG	2	6	22722	22727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
289	NC_011721	AGC	2	6	22731	22736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_011721	GCT	2	6	22760	22765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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292	NC_011721	TGG	2	6	22829	22834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
293	NC_011721	TAA	2	6	23022	23027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203873
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297	NC_011721	TAA	2	6	23193	23198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203873
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308	NC_011721	TAA	2	6	24309	24314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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376	NC_011721	ATG	2	6	30155	30160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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378	NC_011721	TCA	3	9	30390	30398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
379	NC_011721	TTA	2	6	30612	30617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203881
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385	NC_011721	AAG	2	6	30984	30989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203881
386	NC_011721	AGA	2	6	31102	31107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203881
387	NC_011721	GAA	3	9	31128	31136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203881
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