MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880101

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011721	CAA	2	6	17	22	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011721	AGA	2	6	1188	1193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011721	CTG	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011721	TGA	2	6	2800	2805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011721	TAA	2	6	2868	2873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011721	AAG	2	6	5284	5289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011721	TTC	2	6	5310	5315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011721	AGA	2	6	7786	7791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011721	CAA	2	6	7808	7813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011721	ATC	2	6	8063	8068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011721	TAA	2	6	8147	8152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011721	CTT	2	6	8380	8385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011721	GTT	2	6	8444	8449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011721	TTC	2	6	8478	8483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011721	TTA	2	6	8535	8540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011721	ATG	2	6	8608	8613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011721	AAT	2	6	8642	8647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011721	GAG	2	6	8745	8750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011721	TTA	2	6	8810	8815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011721	TTG	2	6	9299	9304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011721	AAG	2	6	9458	9463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011721	TAA	2	6	10282	10287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011721	GTG	2	6	10330	10335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011721	TAG	2	6	10344	10349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011721	TAT	3	9	11526	11534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011721	ACT	2	6	11617	11622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011721	TCA	2	6	13881	13886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011721	TCA	3	9	13894	13902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011721	TCG	2	6	15073	15078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011721	ATA	2	6	15151	15156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011721	TAA	3	9	15206	15214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011721	TTA	2	6	15231	15236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011721	GAG	2	6	15319	15324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011721	GTT	2	6	15834	15839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011721	TAG	2	6	15843	15848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011721	GGT	2	6	15849	15854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011721	GAT	2	6	15873	15878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011721	TAA	2	6	15912	15917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011721	TAA	2	6	15919	15924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011721	TAA	2	6	15926	15931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011721	ATA	2	6	15932	15937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011721	TCT	2	6	17864	17869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011721	CTG	2	6	18452	18457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011721	TCA	2	6	18478	18483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011721	ATA	2	6	20859	20864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011721	AAT	2	6	21244	21249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011721	AAT	2	6	21344	21349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011721	TTG	2	6	21405	21410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011721	CTG	2	6	21548	21553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011721	AGA	2	6	21666	21671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011721	CAT	2	6	21692	21697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011721	AAC	2	6	21712	21717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011721	AAG	2	6	21726	21731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011721	CAA	2	6	21769	21774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011721	TAT	2	6	21796	21801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011721	ATT	2	6	21827	21832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011721	AGA	2	6	21923	21928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011721	GAA	2	6	22039	22044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011721	GTA	2	6	22048	22053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011721	GAA	2	6	22060	22065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011721	TGA	2	6	22133	22138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011721	ATC	2	6	22250	22255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011721	AGA	2	6	22271	22276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011721	TTG	2	6	22363	22368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011721	TAT	2	6	22525	22530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011721	TTA	2	6	22560	22565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011721	GAA	2	6	22605	22610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011721	TTA	2	6	22665	22670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011721	TTA	2	6	22672	22677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011721	TTA	2	6	22686	22691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011721	AGG	2	6	22722	22727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011721	AGC	2	6	22731	22736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011721	GCT	2	6	22760	22765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011721	TCA	2	6	22810	22815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011721	TGG	2	6	22829	22834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011721	AAC	2	6	23543	23548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011721	TAA	2	6	24034	24039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011721	ATT	2	6	24202	24207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011721	TCA	2	6	24235	24240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011721	TAA	2	6	24309	24314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011721	GAA	2	6	24366	24371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011721	AAC	2	6	24400	24405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011721	AAG	2	6	24464	24469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011721	TTA	2	6	24697	24702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011721	TGA	2	6	24780	24785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011721	TCT	2	6	24852	24857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011721	AAG	2	6	24859	24864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011721	ACT	2	6	26164	26169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011721	ACA	2	6	26215	26220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011721	TCT	2	6	26880	26885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011721	AAC	2	6	26953	26958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011721	GTA	2	6	27045	27050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011721	AGC	2	6	30083	30088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011721	ACG	2	6	30100	30105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011721	ATG	2	6	30155	30160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011721	TCA	2	6	30377	30382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011721	TCA	3	9	30390	30398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011721	TCG	2	6	31569	31574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011721	ATA	2	6	31647	31652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011721	TAA	3	9	31702	31710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011721	TTA	2	6	31727	31732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011721	TTG	2	6	31878	31883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011721	TGC	2	6	31995	32000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011721	GAC	2	6	32081	32086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011721	TAA	2	6	32127	32132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011721	ACC	2	6	32244	32249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_011721	GAT	2	6	32328	32333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011721	ATT	2	6	32406	32411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011721	TAG	2	6	32413	32418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011721	TTC	2	6	32594	32599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011721	TTA	2	6	32707	32712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011721	TGA	2	6	32882	32887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011721	GCC	2	6	33006	33011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_011721	TAA	2	6	33057	33062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011721	AAT	2	6	33136	33141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011721	GAA	2	6	33266	33271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011721	CTA	2	6	33447	33452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011721	AAT	2	6	33454	33459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011721	ATC	2	6	33532	33537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011721	GGT	2	6	33616	33621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011721	ATT	2	6	33732	33737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011721	GTC	2	6	33779	33784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011721	AAT	2	6	33987	33992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011721	ATC	2	6	34148	34153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011721	GTT	2	6	34214	34219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011721	AGA	2	6	34503	34508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011721	TTA	2	6	34515	34520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011721	TAA	2	6	34674	34679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011721	AGG	2	6	34730	34735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011721	AAC	2	6	34752	34757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011721	TTG	2	6	34873	34878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011721	AAG	2	6	34882	34887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011721	TAA	2	6	42164	42169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011721	CAA	2	6	43278	43283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011721	ATA	2	6	43391	43396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011721	TCG	2	6	43884	43889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011721	TCA	2	6	44125	44130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011721	TCA	3	9	44138	44146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011721	TCG	2	6	45317	45322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011721	ATA	2	6	45395	45400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011721	TAA	3	9	45450	45458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011721	TTA	2	6	45475	45480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011721	TTC	2	6	45566	45571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_011721	TAA	2	6	45676	45681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011721	ATA	2	6	45815	45820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011721	ATC	2	6	45895	45900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_011721	AAT	2	6	45961	45966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011721	ACA	2	6	46057	46062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_011721	TAA	2	6	46119	46124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011721	TTC	2	6	46170	46175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_011721	CAT	2	6	46182	46187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_011721	AAT	2	6	46188	46193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_011721	TTC	2	6	50542	50547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_011721	TTG	2	6	50551	50556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.