MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880101

Total Repeats: 470

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011721	GAG	2	6	251	256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203845
2	NC_011721	GGA	2	6	284	289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203845
3	NC_011721	GAT	3	9	331	339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203845
4	NC_011721	AAG	2	6	411	416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203845
5	NC_011721	ATA	2	6	485	490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203845
6	NC_011721	TAA	2	6	567	572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203846
7	NC_011721	TGT	2	6	583	588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203846
8	NC_011721	ATA	2	6	672	677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203846
9	NC_011721	AGG	2	6	745	750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203846
10	NC_011721	AAG	2	6	771	776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203846
11	NC_011721	CTC	2	6	870	875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203846
12	NC_011721	TTA	2	6	886	891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203846
13	NC_011721	AAC	2	6	1246	1251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203847
14	NC_011721	ATT	2	6	1287	1292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203847
15	NC_011721	TTC	2	6	1378	1383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203847
16	NC_011721	TAA	2	6	1431	1436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203847
17	NC_011721	ATA	2	6	1455	1460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203847
18	NC_011721	ACA	2	6	1609	1614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203847
19	NC_011721	CTC	2	6	1739	1744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203848
20	NC_011721	TAA	2	6	1896	1901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203848
21	NC_011721	ATA	2	6	1994	1999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203848
22	NC_011721	TTA	2	6	2018	2023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203848
23	NC_011721	ATA	2	6	2225	2230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203848
24	NC_011721	TGA	2	6	2280	2285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203848
25	NC_011721	ATA	2	6	2384	2389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203848
26	NC_011721	TTA	2	6	2432	2437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203848
27	NC_011721	ATA	2	6	2480	2485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203848
28	NC_011721	AAT	2	6	2679	2684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203848
29	NC_011721	TTA	2	6	2692	2697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203848
30	NC_011721	TAT	2	6	3083	3088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203849
31	NC_011721	TCA	2	6	3092	3097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203849
32	NC_011721	TCT	2	6	3269	3274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203849
33	NC_011721	GAA	2	6	3402	3407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203849
34	NC_011721	GAT	2	6	3417	3422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203849
35	NC_011721	CCA	2	6	3424	3429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203849
36	NC_011721	ATT	2	6	3434	3439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203849
37	NC_011721	GCC	2	6	3459	3464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218203849
38	NC_011721	TAT	2	6	3487	3492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203849
39	NC_011721	TGA	2	6	3611	3616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203849
40	NC_011721	CAA	2	6	3669	3674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203849
41	NC_011721	GAG	2	6	3706	3711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203849
42	NC_011721	CGC	2	6	3808	3813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218203849
43	NC_011721	AAG	2	6	3934	3939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203849
44	NC_011721	CAA	2	6	4155	4160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203849
45	NC_011721	GAA	2	6	4209	4214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203849
46	NC_011721	TTA	2	6	4245	4250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203849
47	NC_011721	TGG	2	6	4309	4314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218203849
48	NC_011721	AAC	2	6	4378	4383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203849
49	NC_011721	TCC	2	6	4475	4480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203849
50	NC_011721	CTT	2	6	4498	4503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203849
51	NC_011721	TTG	2	6	4632	4637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203849
52	NC_011721	AGA	2	6	4649	4654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203849
53	NC_011721	AAC	2	6	4655	4660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203849
54	NC_011721	AGA	2	6	4751	4756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203849
55	NC_011721	AGA	2	6	4759	4764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203849
56	NC_011721	CAT	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203849
57	NC_011721	AAC	2	6	4990	4995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203849
58	NC_011721	AAC	2	6	5016	5021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203849
59	NC_011721	TAT	2	6	5153	5158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203849
60	NC_011721	ACC	2	6	5163	5168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203849
61	NC_011721	GCA	2	6	5450	5455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203850
62	NC_011721	GCA	2	6	5620	5625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203850
63	NC_011721	TAT	2	6	5744	5749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203850
64	NC_011721	ACG	2	6	5768	5773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203850
65	NC_011721	CCT	2	6	5882	5887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203850
66	NC_011721	AGC	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203850
67	NC_011721	ATT	2	6	6183	6188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203850
68	NC_011721	AAG	4	12	6193	6204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203850
69	NC_011721	TTA	2	6	6243	6248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203850
70	NC_011721	TAT	2	6	6297	6302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203850
71	NC_011721	CAA	2	6	6333	6338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203850
72	NC_011721	ATT	2	6	6433	6438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203850
73	NC_011721	TAA	2	6	6458	6463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203850
74	NC_011721	CTG	2	6	6549	6554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203851
75	NC_011721	TCA	2	6	6654	6659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203851
76	NC_011721	GTC	2	6	6660	6665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203851
77	NC_011721	AAG	2	6	6720	6725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203851
78	NC_011721	TAT	2	6	6825	6830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203851
79	NC_011721	ATT	2	6	6909	6914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203851
80	NC_011721	ACC	2	6	6968	6973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203851
81	NC_011721	GTT	2	6	7376	7381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203851
82	NC_011721	TCC	2	6	7403	7408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203851
83	NC_011721	TTC	2	6	7516	7521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203851
84	NC_011721	TAA	2	6	7609	7614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203851
85	NC_011721	CTC	2	6	8974	8979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203852
86	NC_011721	TAT	2	6	9033	9038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203852
87	NC_011721	CAT	2	6	9049	9054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203852
88	NC_011721	TAA	2	6	9074	9079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203852
89	NC_011721	TTA	2	6	9154	9159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203852
90	NC_011721	GAA	2	6	9160	9165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203852
91	NC_011721	TGA	2	6	9230	9235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203852
92	NC_011721	AAT	2	6	9569	9574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203853
93	NC_011721	CAG	2	6	9585	9590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203853
94	NC_011721	GCC	2	6	9617	9622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218203853
95	NC_011721	CTT	2	6	9641	9646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203854
96	NC_011721	AAG	2	6	9661	9666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203854
97	NC_011721	CCT	2	6	9709	9714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203854
98	NC_011721	TAT	2	6	9732	9737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203854
99	NC_011721	TAA	2	6	9777	9782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203854
100	NC_011721	TTG	2	6	9801	9806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203854
101	NC_011721	TAT	2	6	9923	9928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203854
102	NC_011721	TGA	2	6	10081	10086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203854
103	NC_011721	GAG	2	6	10096	10101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203854
104	NC_011721	TAA	2	6	10110	10115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203854
105	NC_011721	TTC	2	6	10686	10691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203855
106	NC_011721	ATA	2	6	10738	10743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203855
107	NC_011721	GTA	2	6	10830	10835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203855
108	NC_011721	ATG	2	6	10842	10847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203855
109	NC_011721	TTG	2	6	10904	10909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203855
110	NC_011721	CAA	2	6	11016	11021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203855
111	NC_011721	TTC	2	6	11049	11054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203855
112	NC_011721	ATT	2	6	11110	11115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203855
113	NC_011721	TTC	2	6	11193	11198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203855
114	NC_011721	TTG	2	6	11223	11228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203855
115	NC_011721	TAA	2	6	11280	11285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203855
116	NC_011721	GAG	2	6	11414	11419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203855
117	NC_011721	TTA	2	6	11441	11446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203855
118	NC_011721	CGG	2	6	11901	11906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218203856
119	NC_011721	GGA	2	6	11921	11926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203856
120	NC_011721	TTC	2	6	11945	11950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203856
121	NC_011721	TAG	2	6	11999	12004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203856
122	NC_011721	TGC	2	6	12096	12101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203857
123	NC_011721	GTC	2	6	12139	12144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203857
124	NC_011721	GGT	2	6	12145	12150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218203857
125	NC_011721	ACA	2	6	12178	12183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203857
126	NC_011721	AGG	2	6	12195	12200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203857
127	NC_011721	AGA	2	6	12207	12212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203857
128	NC_011721	CTA	2	6	12264	12269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203857
129	NC_011721	GCT	2	6	12541	12546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203858
130	NC_011721	GCT	2	6	12574	12579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203858
131	NC_011721	GAT	2	6	12582	12587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203858
132	NC_011721	AGG	2	6	12611	12616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203858
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135	NC_011721	CAC	2	6	12759	12764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203858
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153	NC_011721	TAG	2	6	14144	14149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203860
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