MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880101

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011721	A	6	6	37	42	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011721	T	7	7	1112	1118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011721	T	9	9	1218	1226	0 %	100 %	0 %	0 %	218203847
4	NC_011721	A	6	6	1272	1277	100 %	0 %	0 %	0 %	218203847
5	NC_011721	A	6	6	1561	1566	100 %	0 %	0 %	0 %	218203847
6	NC_011721	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	218203848
7	NC_011721	T	6	6	2091	2096	0 %	100 %	0 %	0 %	218203848
8	NC_011721	A	8	8	2456	2463	100 %	0 %	0 %	0 %	218203848
9	NC_011721	A	7	7	3076	3082	100 %	0 %	0 %	0 %	218203849
10	NC_011721	A	7	7	4366	4372	100 %	0 %	0 %	0 %	218203849
11	NC_011721	C	6	6	4773	4778	0 %	0 %	0 %	100 %	218203849
12	NC_011721	C	6	6	4781	4786	0 %	0 %	0 %	100 %	218203849
13	NC_011721	C	6	6	4789	4794	0 %	0 %	0 %	100 %	218203849
14	NC_011721	C	7	7	4797	4803	0 %	0 %	0 %	100 %	218203849
15	NC_011721	C	7	7	4813	4819	0 %	0 %	0 %	100 %	218203849
16	NC_011721	C	6	6	4926	4931	0 %	0 %	0 %	100 %	218203849
17	NC_011721	G	6	6	5079	5084	0 %	0 %	100 %	0 %	218203849
18	NC_011721	T	6	6	5265	5270	0 %	100 %	0 %	0 %	218203849
19	NC_011721	T	6	6	5374	5379	0 %	100 %	0 %	0 %	218203850
20	NC_011721	T	6	6	5384	5389	0 %	100 %	0 %	0 %	218203850
21	NC_011721	A	6	6	5533	5538	100 %	0 %	0 %	0 %	218203850
22	NC_011721	A	7	7	5598	5604	100 %	0 %	0 %	0 %	218203850
23	NC_011721	A	6	6	5823	5828	100 %	0 %	0 %	0 %	218203850
24	NC_011721	A	7	7	6036	6042	100 %	0 %	0 %	0 %	218203850
25	NC_011721	C	6	6	7124	7129	0 %	0 %	0 %	100 %	218203851
26	NC_011721	T	6	6	7416	7421	0 %	100 %	0 %	0 %	218203851
27	NC_011721	T	6	6	8155	8160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011721	T	6	6	8248	8253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011721	A	6	6	8570	8575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011721	A	6	6	8887	8892	100 %	0 %	0 %	0 %	218203852
31	NC_011721	A	6	6	9078	9083	100 %	0 %	0 %	0 %	218203852
32	NC_011721	T	6	6	9419	9424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011721	G	6	6	9438	9443	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011721	A	6	6	9840	9845	100 %	0 %	0 %	0 %	218203854
35	NC_011721	T	6	6	10387	10392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011721	G	6	6	10468	10473	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011721	T	6	6	10536	10541	0 %	100 %	0 %	0 %	218203855
38	NC_011721	T	6	6	10992	10997	0 %	100 %	0 %	0 %	218203855
39	NC_011721	T	6	6	11104	11109	0 %	100 %	0 %	0 %	218203855
40	NC_011721	T	6	6	11175	11180	0 %	100 %	0 %	0 %	218203855
41	NC_011721	T	6	6	11324	11329	0 %	100 %	0 %	0 %	218203855
42	NC_011721	T	6	6	11862	11867	0 %	100 %	0 %	0 %	218203856
43	NC_011721	A	6	6	12290	12295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011721	G	6	6	12886	12891	0 %	0 %	100 %	0 %	218203858
45	NC_011721	T	7	7	13679	13685	0 %	100 %	0 %	0 %	218203859
46	NC_011721	A	6	6	13761	13766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011721	T	6	6	13911	13916	0 %	100 %	0 %	0 %	218203860
48	NC_011721	A	6	6	14281	14286	100 %	0 %	0 %	0 %	218203860
49	NC_011721	A	7	7	14546	14552	100 %	0 %	0 %	0 %	218203860
50	NC_011721	T	6	6	15134	15139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011721	A	7	7	15161	15167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011721	T	6	6	15512	15517	0 %	100 %	0 %	0 %	218203861
53	NC_011721	A	7	7	15882	15888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011721	A	6	6	16011	16016	100 %	0 %	0 %	0 %	218203862
55	NC_011721	A	6	6	16631	16636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011721	A	6	6	17463	17468	100 %	0 %	0 %	0 %	218203864
57	NC_011721	T	6	6	17653	17658	0 %	100 %	0 %	0 %	218203864
58	NC_011721	A	6	6	17686	17691	100 %	0 %	0 %	0 %	218203864
59	NC_011721	G	6	6	18575	18580	0 %	0 %	100 %	0 %	218203867
60	NC_011721	T	6	6	18722	18727	0 %	100 %	0 %	0 %	218203867
61	NC_011721	A	7	7	19432	19438	100 %	0 %	0 %	0 %	218203868
62	NC_011721	A	6	6	19572	19577	100 %	0 %	0 %	0 %	218203868
63	NC_011721	C	6	6	19694	19699	0 %	0 %	0 %	100 %	218203868
64	NC_011721	A	6	6	21203	21208	100 %	0 %	0 %	0 %	218203872
65	NC_011721	A	6	6	21386	21391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011721	A	6	6	21398	21403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011721	A	7	7	22872	22878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011721	A	6	6	23077	23082	100 %	0 %	0 %	0 %	218203873
69	NC_011721	T	6	6	23766	23771	0 %	100 %	0 %	0 %	218203874
70	NC_011721	T	6	6	23957	23962	0 %	100 %	0 %	0 %	218203874
71	NC_011721	T	6	6	24274	24279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011721	A	6	6	24596	24601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011721	A	6	6	24689	24694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011721	T	7	7	25824	25830	0 %	100 %	0 %	0 %	218203875
75	NC_011721	T	6	6	26259	26264	0 %	100 %	0 %	0 %	218203876
76	NC_011721	T	6	6	26548	26553	0 %	100 %	0 %	0 %	218203877
77	NC_011721	T	6	6	26731	26736	0 %	100 %	0 %	0 %	218203877
78	NC_011721	A	7	7	26811	26817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011721	T	7	7	26971	26977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011721	G	6	6	29061	29066	0 %	0 %	100 %	0 %	218203879
81	NC_011721	A	6	6	30257	30262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011721	T	6	6	30407	30412	0 %	100 %	0 %	0 %	218203881
83	NC_011721	A	6	6	30777	30782	100 %	0 %	0 %	0 %	218203881
84	NC_011721	A	7	7	31042	31048	100 %	0 %	0 %	0 %	218203881
85	NC_011721	T	6	6	31630	31635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011721	A	7	7	31657	31663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011721	A	7	7	32097	32103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011721	A	6	6	32811	32816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011721	A	6	6	32824	32829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011721	A	6	6	32987	32992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011721	A	6	6	33049	33054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011721	A	6	6	33061	33066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011721	A	6	6	33106	33111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011721	T	7	7	33762	33768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011721	A	6	6	34613	34618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011721	T	6	6	35137	35142	0 %	100 %	0 %	0 %	218203882
97	NC_011721	C	6	6	35641	35646	0 %	0 %	0 %	100 %	218203882
98	NC_011721	A	6	6	36121	36126	100 %	0 %	0 %	0 %	218203882
99	NC_011721	A	6	6	36612	36617	100 %	0 %	0 %	0 %	218203882
100	NC_011721	G	7	7	37009	37015	0 %	0 %	100 %	0 %	218203882
101	NC_011721	A	6	6	37636	37641	100 %	0 %	0 %	0 %	218203882
102	NC_011721	T	6	6	37663	37668	0 %	100 %	0 %	0 %	218203882
103	NC_011721	C	6	6	37743	37748	0 %	0 %	0 %	100 %	218203882
104	NC_011721	T	6	6	38589	38594	0 %	100 %	0 %	0 %	218203883
105	NC_011721	T	6	6	39915	39920	0 %	100 %	0 %	0 %	218203884
106	NC_011721	A	6	6	40349	40354	100 %	0 %	0 %	0 %	218203884
107	NC_011721	A	6	6	41560	41565	100 %	0 %	0 %	0 %	218203886
108	NC_011721	A	6	6	41594	41599	100 %	0 %	0 %	0 %	218203886
109	NC_011721	A	10	10	41747	41756	100 %	0 %	0 %	0 %	218203886
110	NC_011721	A	6	6	41912	41917	100 %	0 %	0 %	0 %	218203886
111	NC_011721	T	6	6	42652	42657	0 %	100 %	0 %	0 %	218203887
112	NC_011721	T	6	6	43285	43290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011721	T	6	6	43297	43302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011721	A	6	6	43381	43386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011721	T	6	6	43431	43436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011721	T	6	6	43490	43495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011721	A	6	6	44005	44010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011721	T	6	6	44155	44160	0 %	100 %	0 %	0 %	218203889
119	NC_011721	A	6	6	44525	44530	100 %	0 %	0 %	0 %	218203889
120	NC_011721	A	7	7	44790	44796	100 %	0 %	0 %	0 %	218203889
121	NC_011721	T	6	6	45378	45383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011721	A	7	7	45405	45411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011721	T	7	7	45704	45710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011721	G	6	6	46515	46520	0 %	0 %	100 %	0 %	218203890
125	NC_011721	G	7	7	46923	46929	0 %	0 %	100 %	0 %	218203890
126	NC_011721	T	8	8	46973	46980	0 %	100 %	0 %	0 %	218203890
127	NC_011721	A	6	6	47212	47217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011721	A	7	7	47251	47257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011721	T	6	6	47706	47711	0 %	100 %	0 %	0 %	218203891
130	NC_011721	G	6	6	47839	47844	0 %	0 %	100 %	0 %	218203891
131	NC_011721	T	6	6	48105	48110	0 %	100 %	0 %	0 %	218203891
132	NC_011721	A	6	6	48140	48145	100 %	0 %	0 %	0 %	218203891
133	NC_011721	A	6	6	48200	48205	100 %	0 %	0 %	0 %	218203891
134	NC_011721	T	7	7	50194	50200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011721	T	7	7	50563	50569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.