MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880101

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011721	T	9	9	1218	1226	0 %	100 %	0 %	0 %	218203847
2	NC_011721	A	6	6	1272	1277	100 %	0 %	0 %	0 %	218203847
3	NC_011721	A	6	6	1561	1566	100 %	0 %	0 %	0 %	218203847
4	NC_011721	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	218203848
5	NC_011721	T	6	6	2091	2096	0 %	100 %	0 %	0 %	218203848
6	NC_011721	A	8	8	2456	2463	100 %	0 %	0 %	0 %	218203848
7	NC_011721	A	7	7	3076	3082	100 %	0 %	0 %	0 %	218203849
8	NC_011721	A	7	7	4366	4372	100 %	0 %	0 %	0 %	218203849
9	NC_011721	C	6	6	4773	4778	0 %	0 %	0 %	100 %	218203849
10	NC_011721	C	6	6	4781	4786	0 %	0 %	0 %	100 %	218203849
11	NC_011721	C	6	6	4789	4794	0 %	0 %	0 %	100 %	218203849
12	NC_011721	C	7	7	4797	4803	0 %	0 %	0 %	100 %	218203849
13	NC_011721	C	7	7	4813	4819	0 %	0 %	0 %	100 %	218203849
14	NC_011721	C	6	6	4926	4931	0 %	0 %	0 %	100 %	218203849
15	NC_011721	G	6	6	5079	5084	0 %	0 %	100 %	0 %	218203849
16	NC_011721	T	6	6	5265	5270	0 %	100 %	0 %	0 %	218203849
17	NC_011721	T	6	6	5374	5379	0 %	100 %	0 %	0 %	218203850
18	NC_011721	T	6	6	5384	5389	0 %	100 %	0 %	0 %	218203850
19	NC_011721	A	6	6	5533	5538	100 %	0 %	0 %	0 %	218203850
20	NC_011721	A	7	7	5598	5604	100 %	0 %	0 %	0 %	218203850
21	NC_011721	A	6	6	5823	5828	100 %	0 %	0 %	0 %	218203850
22	NC_011721	A	7	7	6036	6042	100 %	0 %	0 %	0 %	218203850
23	NC_011721	C	6	6	7124	7129	0 %	0 %	0 %	100 %	218203851
24	NC_011721	T	6	6	7416	7421	0 %	100 %	0 %	0 %	218203851
25	NC_011721	A	6	6	8887	8892	100 %	0 %	0 %	0 %	218203852
26	NC_011721	A	6	6	9078	9083	100 %	0 %	0 %	0 %	218203852
27	NC_011721	A	6	6	9840	9845	100 %	0 %	0 %	0 %	218203854
28	NC_011721	T	6	6	10536	10541	0 %	100 %	0 %	0 %	218203855
29	NC_011721	T	6	6	10992	10997	0 %	100 %	0 %	0 %	218203855
30	NC_011721	T	6	6	11104	11109	0 %	100 %	0 %	0 %	218203855
31	NC_011721	T	6	6	11175	11180	0 %	100 %	0 %	0 %	218203855
32	NC_011721	T	6	6	11324	11329	0 %	100 %	0 %	0 %	218203855
33	NC_011721	T	6	6	11862	11867	0 %	100 %	0 %	0 %	218203856
34	NC_011721	G	6	6	12886	12891	0 %	0 %	100 %	0 %	218203858
35	NC_011721	T	7	7	13679	13685	0 %	100 %	0 %	0 %	218203859
36	NC_011721	T	6	6	13911	13916	0 %	100 %	0 %	0 %	218203860
37	NC_011721	A	6	6	14281	14286	100 %	0 %	0 %	0 %	218203860
38	NC_011721	A	7	7	14546	14552	100 %	0 %	0 %	0 %	218203860
39	NC_011721	T	6	6	15512	15517	0 %	100 %	0 %	0 %	218203861
40	NC_011721	A	6	6	16011	16016	100 %	0 %	0 %	0 %	218203862
41	NC_011721	A	6	6	17463	17468	100 %	0 %	0 %	0 %	218203864
42	NC_011721	T	6	6	17653	17658	0 %	100 %	0 %	0 %	218203864
43	NC_011721	A	6	6	17686	17691	100 %	0 %	0 %	0 %	218203864
44	NC_011721	G	6	6	18575	18580	0 %	0 %	100 %	0 %	218203867
45	NC_011721	T	6	6	18722	18727	0 %	100 %	0 %	0 %	218203867
46	NC_011721	A	7	7	19432	19438	100 %	0 %	0 %	0 %	218203868
47	NC_011721	A	6	6	19572	19577	100 %	0 %	0 %	0 %	218203868
48	NC_011721	C	6	6	19694	19699	0 %	0 %	0 %	100 %	218203868
49	NC_011721	A	6	6	21203	21208	100 %	0 %	0 %	0 %	218203872
50	NC_011721	A	6	6	23077	23082	100 %	0 %	0 %	0 %	218203873
51	NC_011721	T	6	6	23766	23771	0 %	100 %	0 %	0 %	218203874
52	NC_011721	T	6	6	23957	23962	0 %	100 %	0 %	0 %	218203874
53	NC_011721	T	7	7	25824	25830	0 %	100 %	0 %	0 %	218203875
54	NC_011721	T	6	6	26259	26264	0 %	100 %	0 %	0 %	218203876
55	NC_011721	T	6	6	26548	26553	0 %	100 %	0 %	0 %	218203877
56	NC_011721	T	6	6	26731	26736	0 %	100 %	0 %	0 %	218203877
57	NC_011721	G	6	6	29061	29066	0 %	0 %	100 %	0 %	218203879
58	NC_011721	T	6	6	30407	30412	0 %	100 %	0 %	0 %	218203881
59	NC_011721	A	6	6	30777	30782	100 %	0 %	0 %	0 %	218203881
60	NC_011721	A	7	7	31042	31048	100 %	0 %	0 %	0 %	218203881
61	NC_011721	T	6	6	35137	35142	0 %	100 %	0 %	0 %	218203882
62	NC_011721	C	6	6	35641	35646	0 %	0 %	0 %	100 %	218203882
63	NC_011721	A	6	6	36121	36126	100 %	0 %	0 %	0 %	218203882
64	NC_011721	A	6	6	36612	36617	100 %	0 %	0 %	0 %	218203882
65	NC_011721	G	7	7	37009	37015	0 %	0 %	100 %	0 %	218203882
66	NC_011721	A	6	6	37636	37641	100 %	0 %	0 %	0 %	218203882
67	NC_011721	T	6	6	37663	37668	0 %	100 %	0 %	0 %	218203882
68	NC_011721	C	6	6	37743	37748	0 %	0 %	0 %	100 %	218203882
69	NC_011721	T	6	6	38589	38594	0 %	100 %	0 %	0 %	218203883
70	NC_011721	T	6	6	39915	39920	0 %	100 %	0 %	0 %	218203884
71	NC_011721	A	6	6	40349	40354	100 %	0 %	0 %	0 %	218203884
72	NC_011721	A	6	6	41560	41565	100 %	0 %	0 %	0 %	218203886
73	NC_011721	A	6	6	41594	41599	100 %	0 %	0 %	0 %	218203886
74	NC_011721	A	10	10	41747	41756	100 %	0 %	0 %	0 %	218203886
75	NC_011721	A	6	6	41912	41917	100 %	0 %	0 %	0 %	218203886
76	NC_011721	T	6	6	42652	42657	0 %	100 %	0 %	0 %	218203887
77	NC_011721	T	6	6	44155	44160	0 %	100 %	0 %	0 %	218203889
78	NC_011721	A	6	6	44525	44530	100 %	0 %	0 %	0 %	218203889
79	NC_011721	A	7	7	44790	44796	100 %	0 %	0 %	0 %	218203889
80	NC_011721	G	6	6	46515	46520	0 %	0 %	100 %	0 %	218203890
81	NC_011721	G	7	7	46923	46929	0 %	0 %	100 %	0 %	218203890
82	NC_011721	T	8	8	46973	46980	0 %	100 %	0 %	0 %	218203890
83	NC_011721	T	6	6	47706	47711	0 %	100 %	0 %	0 %	218203891
84	NC_011721	G	6	6	47839	47844	0 %	0 %	100 %	0 %	218203891
85	NC_011721	T	6	6	48105	48110	0 %	100 %	0 %	0 %	218203891
86	NC_011721	A	6	6	48140	48145	100 %	0 %	0 %	0 %	218203891
87	NC_011721	A	6	6	48200	48205	100 %	0 %	0 %	0 %	218203891

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.