MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-3+10

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011720	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011720	AGACAC	2	12	3773	3784	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	218202768
3	NC_011720	ATTACT	2	12	3834	3845	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218202768
4	NC_011720	TATTGA	2	12	3887	3898	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218202768
5	NC_011720	ACAGAA	2	12	3962	3973	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	218202730
6	NC_011720	TAAAAA	2	12	5381	5392	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011720	CAAAAG	2	12	6199	6210	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	218202759
8	NC_011720	AGTTAA	2	12	6461	6472	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218202727
9	NC_011720	TAATGA	2	12	8096	8107	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218202728
10	NC_011720	TTTTCG	2	12	8972	8983	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011720	ACAAAT	2	12	13582	13593	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011720	TAGTGT	2	12	15241	15252	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011720	AAGTAA	2	12	16557	16568	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011720	GGAGTA	2	12	16943	16954	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011720	TACTGA	2	12	17627	17638	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	218202764
16	NC_011720	TTGACT	2	12	20347	20358	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	218202742
17	NC_011720	GCTTTG	2	12	20871	20882	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	218202742
18	NC_011720	TGAAAA	2	12	21247	21258	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218202751
19	NC_011720	TTGAAG	2	12	22202	22213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218202765
20	NC_011720	TTAGAA	2	12	22576	22587	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218202749
21	NC_011720	ATGTTG	2	12	22913	22924	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	218202749
22	NC_011720	TGAATT	2	12	25154	25165	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218202763
23	NC_011720	TGAACT	2	12	25193	25204	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	218202763
24	NC_011720	GAAAAA	2	12	26866	26877	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218202734
25	NC_011720	AGCTGA	2	12	28143	28154	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218202771
26	NC_011720	CAAAAA	2	12	32424	32435	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	218202746
27	NC_011720	ATGGCA	2	12	35228	35239	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218202758
28	NC_011720	TAAAAA	2	12	39875	39886	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	218202777
29	NC_011720	TTAAAA	2	12	42763	42774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218202761
30	NC_011720	TTAAGA	2	12	43306	43317	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218202766
31	NC_011720	AAGTAA	2	12	44256	44267	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011720	TACTAA	2	12	45135	45146	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	218202774

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.