MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-3+10

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011720	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011720	ATTAA	2	10	1783	1792	60 %	40 %	0 %	0 %	218202753
3	NC_011720	TACTT	2	10	3482	3491	20 %	60 %	0 %	20 %	218202768
4	NC_011720	AAAGT	2	10	3582	3591	60 %	20 %	20 %	0 %	218202768
5	NC_011720	AGAAA	2	10	4348	4357	80 %	0 %	20 %	0 %	218202730
6	NC_011720	ATTAA	2	10	5423	5432	60 %	40 %	0 %	0 %	218202741
7	NC_011720	AGTAA	2	10	6059	6068	60 %	20 %	20 %	0 %	218202759
8	NC_011720	TCACT	2	10	6216	6225	20 %	40 %	0 %	40 %	218202759
9	NC_011720	TTGTT	2	10	6313	6322	0 %	80 %	20 %	0 %	218202727
10	NC_011720	TATGT	2	10	6423	6432	20 %	60 %	20 %	0 %	218202727
11	NC_011720	TAATT	2	10	6837	6846	40 %	60 %	0 %	0 %	218202783
12	NC_011720	AAAAC	2	10	6959	6968	80 %	0 %	0 %	20 %	218202783
13	NC_011720	AAAGA	2	10	7087	7096	80 %	0 %	20 %	0 %	218202783
14	NC_011720	ATAAA	2	10	8311	8320	80 %	20 %	0 %	0 %	218202728
15	NC_011720	TGTAG	2	10	9678	9687	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011720	CACTA	2	10	10030	10039	40 %	20 %	0 %	40 %	218202757
17	NC_011720	ATTAT	2	10	12330	12339	40 %	60 %	0 %	0 %	218202780
18	NC_011720	CAAAA	2	10	12660	12669	80 %	0 %	0 %	20 %	218202780
19	NC_011720	TTTTA	2	10	13572	13581	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011720	CAATC	2	10	13784	13793	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_011720	GAGTT	2	10	14880	14889	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011720	ATAAA	2	10	15325	15334	80 %	20 %	0 %	0 %	218202769
23	NC_011720	AATTT	2	10	16755	16764	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011720	GAAAA	2	10	17456	17465	80 %	0 %	20 %	0 %	218202764
25	NC_011720	AAAAG	2	10	17827	17836	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011720	AGTTT	2	10	22169	22178	20 %	60 %	20 %	0 %	218202765
27	NC_011720	CAATT	2	10	23417	23426	40 %	40 %	0 %	20 %	218202754
28	NC_011720	TACTT	2	10	25691	25700	20 %	60 %	0 %	20 %	218202778
29	NC_011720	TAATA	2	10	26249	26258	60 %	40 %	0 %	0 %	218202750
30	NC_011720	TATGC	2	10	26421	26430	20 %	40 %	20 %	20 %	218202750
31	NC_011720	AAAAC	2	10	28263	28272	80 %	0 %	0 %	20 %	218202729
32	NC_011720	GCAAG	2	10	29561	29570	40 %	0 %	40 %	20 %	218202747
33	NC_011720	CATAT	2	10	31555	31564	40 %	40 %	0 %	20 %	218202731
34	NC_011720	AATCT	2	10	32116	32125	40 %	40 %	0 %	20 %	218202782
35	NC_011720	ACAAT	2	10	32150	32159	60 %	20 %	0 %	20 %	218202782
36	NC_011720	GACTA	2	10	32491	32500	40 %	20 %	20 %	20 %	218202746
37	NC_011720	ATTCA	2	10	33166	33175	40 %	40 %	0 %	20 %	218202786
38	NC_011720	GAAAA	2	10	33211	33220	80 %	0 %	20 %	0 %	218202786
39	NC_011720	AAAGT	2	10	33233	33242	60 %	20 %	20 %	0 %	218202786
40	NC_011720	AGAAA	2	10	33999	34008	80 %	0 %	20 %	0 %	218202775
41	NC_011720	TAAAA	2	10	34506	34515	80 %	20 %	0 %	0 %	218202776
42	NC_011720	TAATA	2	10	34794	34803	60 %	40 %	0 %	0 %	218202776
43	NC_011720	TTATG	2	10	36074	36083	20 %	60 %	20 %	0 %	218202779
44	NC_011720	AAACA	2	10	36101	36110	80 %	0 %	0 %	20 %	218202779
45	NC_011720	CACTT	2	10	36873	36882	20 %	40 %	0 %	40 %	218202733
46	NC_011720	TAAAA	2	10	38533	38542	80 %	20 %	0 %	0 %	218202740
47	NC_011720	AATTG	2	10	38560	38569	40 %	40 %	20 %	0 %	218202740
48	NC_011720	TTTTA	2	10	43196	43205	20 %	80 %	0 %	0 %	218202766
49	NC_011720	TTTTG	2	10	44691	44700	0 %	80 %	20 %	0 %	218202774
50	NC_011720	AGATT	2	10	45858	45867	40 %	40 %	20 %	0 %	218202732
51	NC_011720	AAATA	2	10	45926	45935	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011720	TTATT	2	10	45988	45997	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011720	TTACA	2	10	48000	48009	40 %	40 %	0 %	20 %	218202781

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.