MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-3+10

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011720	ATTAA	2	10	1783	1792	60 %	40 %	0 %	0 %	218202753
2	NC_011720	TACTT	2	10	3482	3491	20 %	60 %	0 %	20 %	218202768
3	NC_011720	AAAGT	2	10	3582	3591	60 %	20 %	20 %	0 %	218202768
4	NC_011720	AGAAA	2	10	4348	4357	80 %	0 %	20 %	0 %	218202730
5	NC_011720	ATTAA	2	10	5423	5432	60 %	40 %	0 %	0 %	218202741
6	NC_011720	AGTAA	2	10	6059	6068	60 %	20 %	20 %	0 %	218202759
7	NC_011720	TCACT	2	10	6216	6225	20 %	40 %	0 %	40 %	218202759
8	NC_011720	TTGTT	2	10	6313	6322	0 %	80 %	20 %	0 %	218202727
9	NC_011720	TATGT	2	10	6423	6432	20 %	60 %	20 %	0 %	218202727
10	NC_011720	TAATT	2	10	6837	6846	40 %	60 %	0 %	0 %	218202783
11	NC_011720	AAAAC	2	10	6959	6968	80 %	0 %	0 %	20 %	218202783
12	NC_011720	AAAGA	2	10	7087	7096	80 %	0 %	20 %	0 %	218202783
13	NC_011720	ATAAA	2	10	8311	8320	80 %	20 %	0 %	0 %	218202728
14	NC_011720	CACTA	2	10	10030	10039	40 %	20 %	0 %	40 %	218202757
15	NC_011720	ATTAT	2	10	12330	12339	40 %	60 %	0 %	0 %	218202780
16	NC_011720	CAAAA	2	10	12660	12669	80 %	0 %	0 %	20 %	218202780
17	NC_011720	ATAAA	2	10	15325	15334	80 %	20 %	0 %	0 %	218202769
18	NC_011720	GAAAA	2	10	17456	17465	80 %	0 %	20 %	0 %	218202764
19	NC_011720	AGTTT	2	10	22169	22178	20 %	60 %	20 %	0 %	218202765
20	NC_011720	CAATT	2	10	23417	23426	40 %	40 %	0 %	20 %	218202754
21	NC_011720	TACTT	2	10	25691	25700	20 %	60 %	0 %	20 %	218202778
22	NC_011720	TAATA	2	10	26249	26258	60 %	40 %	0 %	0 %	218202750
23	NC_011720	TATGC	2	10	26421	26430	20 %	40 %	20 %	20 %	218202750
24	NC_011720	AAAAC	2	10	28263	28272	80 %	0 %	0 %	20 %	218202729
25	NC_011720	GCAAG	2	10	29561	29570	40 %	0 %	40 %	20 %	218202747
26	NC_011720	CATAT	2	10	31555	31564	40 %	40 %	0 %	20 %	218202731
27	NC_011720	AATCT	2	10	32116	32125	40 %	40 %	0 %	20 %	218202782
28	NC_011720	ACAAT	2	10	32150	32159	60 %	20 %	0 %	20 %	218202782
29	NC_011720	GACTA	2	10	32491	32500	40 %	20 %	20 %	20 %	218202746
30	NC_011720	ATTCA	2	10	33166	33175	40 %	40 %	0 %	20 %	218202786
31	NC_011720	GAAAA	2	10	33211	33220	80 %	0 %	20 %	0 %	218202786
32	NC_011720	AAAGT	2	10	33233	33242	60 %	20 %	20 %	0 %	218202786
33	NC_011720	AGAAA	2	10	33999	34008	80 %	0 %	20 %	0 %	218202775
34	NC_011720	TAAAA	2	10	34506	34515	80 %	20 %	0 %	0 %	218202776
35	NC_011720	TAATA	2	10	34794	34803	60 %	40 %	0 %	0 %	218202776
36	NC_011720	TTATG	2	10	36074	36083	20 %	60 %	20 %	0 %	218202779
37	NC_011720	AAACA	2	10	36101	36110	80 %	0 %	0 %	20 %	218202779
38	NC_011720	CACTT	2	10	36873	36882	20 %	40 %	0 %	40 %	218202733
39	NC_011720	TAAAA	2	10	38533	38542	80 %	20 %	0 %	0 %	218202740
40	NC_011720	AATTG	2	10	38560	38569	40 %	40 %	20 %	0 %	218202740
41	NC_011720	TTTTA	2	10	43196	43205	20 %	80 %	0 %	0 %	218202766
42	NC_011720	TTTTG	2	10	44691	44700	0 %	80 %	20 %	0 %	218202774
43	NC_011720	AGATT	2	10	45858	45867	40 %	40 %	20 %	0 %	218202732
44	NC_011720	TTACA	2	10	48000	48009	40 %	40 %	0 %	20 %	218202781

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.