MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-3+10

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011720	GTTC	2	8	1680	1687	0 %	50 %	25 %	25 %	218202753
2	NC_011720	ATAC	2	8	1931	1938	50 %	25 %	0 %	25 %	218202753
3	NC_011720	GAAT	2	8	2121	2128	50 %	25 %	25 %	0 %	218202748
4	NC_011720	GAAT	2	8	2148	2155	50 %	25 %	25 %	0 %	218202748
5	NC_011720	TCAA	2	8	2371	2378	50 %	25 %	0 %	25 %	218202748
6	NC_011720	GTTT	2	8	2655	2662	0 %	75 %	25 %	0 %	218202748
7	NC_011720	TAAT	2	8	3196	3203	50 %	50 %	0 %	0 %	218202768
8	NC_011720	AGAT	2	8	3875	3882	50 %	25 %	25 %	0 %	218202768
9	NC_011720	TATC	2	8	4086	4093	25 %	50 %	0 %	25 %	218202730
10	NC_011720	AAAC	2	8	4278	4285	75 %	0 %	0 %	25 %	218202730
11	NC_011720	GAAT	2	8	4822	4829	50 %	25 %	25 %	0 %	218202762
12	NC_011720	TACA	2	8	5206	5213	50 %	25 %	0 %	25 %	218202762
13	NC_011720	TAAC	2	8	6003	6010	50 %	25 %	0 %	25 %	218202759
14	NC_011720	TTAT	2	8	6811	6818	25 %	75 %	0 %	0 %	218202783
15	NC_011720	AGAT	2	8	7546	7553	50 %	25 %	25 %	0 %	218202755
16	NC_011720	AAGA	3	12	10311	10322	75 %	0 %	25 %	0 %	218202757
17	NC_011720	AATA	2	8	10438	10445	75 %	25 %	0 %	0 %	218202757
18	NC_011720	GAAA	2	8	10504	10511	75 %	0 %	25 %	0 %	218202757
19	NC_011720	AAAT	2	8	10590	10597	75 %	25 %	0 %	0 %	218202757
20	NC_011720	AAAT	2	8	11277	11284	75 %	25 %	0 %	0 %	218202739
21	NC_011720	TTTA	2	8	11422	11429	25 %	75 %	0 %	0 %	218202739
22	NC_011720	GAAA	2	8	11721	11728	75 %	0 %	25 %	0 %	218202784
23	NC_011720	ATTT	2	8	11996	12003	25 %	75 %	0 %	0 %	218202784
24	NC_011720	ATTT	2	8	12026	12033	25 %	75 %	0 %	0 %	218202784
25	NC_011720	AGAT	2	8	12111	12118	50 %	25 %	25 %	0 %	218202784
26	NC_011720	TAAA	2	8	12185	12192	75 %	25 %	0 %	0 %	218202784
27	NC_011720	AATT	2	8	12388	12395	50 %	50 %	0 %	0 %	218202780
28	NC_011720	ATGG	2	8	13274	13281	25 %	25 %	50 %	0 %	218202745
29	NC_011720	AAAT	2	8	15442	15449	75 %	25 %	0 %	0 %	218202769
30	NC_011720	AAAT	3	12	15895	15906	75 %	25 %	0 %	0 %	218202743
31	NC_011720	TTTA	2	8	15926	15933	25 %	75 %	0 %	0 %	218202743
32	NC_011720	AACC	2	8	16278	16285	50 %	0 %	0 %	50 %	218202743
33	NC_011720	AAAG	2	8	17234	17241	75 %	0 %	25 %	0 %	218202764
34	NC_011720	AAAT	2	8	17486	17493	75 %	25 %	0 %	0 %	218202764
35	NC_011720	TAAA	2	8	18397	18404	75 %	25 %	0 %	0 %	218202736
36	NC_011720	CAAA	2	8	18590	18597	75 %	0 %	0 %	25 %	218202744
37	NC_011720	AATT	2	8	18679	18686	50 %	50 %	0 %	0 %	218202744
38	NC_011720	TGAT	2	8	18993	19000	25 %	50 %	25 %	0 %	218202744
39	NC_011720	TTAC	2	8	19746	19753	25 %	50 %	0 %	25 %	218202744
40	NC_011720	TATC	2	8	21190	21197	25 %	50 %	0 %	25 %	218202742
41	NC_011720	AATT	2	8	21832	21839	50 %	50 %	0 %	0 %	218202751
42	NC_011720	GTAA	2	8	21860	21867	50 %	25 %	25 %	0 %	218202751
43	NC_011720	CAAG	2	8	22618	22625	50 %	0 %	25 %	25 %	218202749
44	NC_011720	ATGT	2	8	22958	22965	25 %	50 %	25 %	0 %	218202749
45	NC_011720	CAAT	2	8	23147	23154	50 %	25 %	0 %	25 %	218202749
46	NC_011720	TCAT	2	8	24794	24801	25 %	50 %	0 %	25 %	218202760
47	NC_011720	TTGC	2	8	24825	24832	0 %	50 %	25 %	25 %	218202760
48	NC_011720	CAAA	2	8	24863	24870	75 %	0 %	0 %	25 %	218202760
49	NC_011720	CAAA	2	8	25261	25268	75 %	0 %	0 %	25 %	218202763
50	NC_011720	TAAA	2	8	26497	26504	75 %	25 %	0 %	0 %	218202750
51	NC_011720	GATT	2	8	26548	26555	25 %	50 %	25 %	0 %	218202750
52	NC_011720	ACTA	2	8	27054	27061	50 %	25 %	0 %	25 %	218202734
53	NC_011720	TTAT	2	8	27188	27195	25 %	75 %	0 %	0 %	218202734
54	NC_011720	GATT	2	8	27608	27615	25 %	50 %	25 %	0 %	218202734
55	NC_011720	TTAC	2	8	27686	27693	25 %	50 %	0 %	25 %	218202734
56	NC_011720	ACTA	2	8	28099	28106	50 %	25 %	0 %	25 %	218202771
57	NC_011720	TCAA	2	8	28329	28336	50 %	25 %	0 %	25 %	218202729
58	NC_011720	TTAC	2	8	28637	28644	25 %	50 %	0 %	25 %	218202729
59	NC_011720	GTTG	2	8	28749	28756	0 %	50 %	50 %	0 %	218202735
60	NC_011720	AATA	2	8	28771	28778	75 %	25 %	0 %	0 %	218202735
61	NC_011720	TCAA	2	8	28853	28860	50 %	25 %	0 %	25 %	218202735
62	NC_011720	AATT	2	8	28895	28902	50 %	50 %	0 %	0 %	218202735
63	NC_011720	AAGA	2	8	29083	29090	75 %	0 %	25 %	0 %	218202747
64	NC_011720	ACAA	2	8	29440	29447	75 %	0 %	0 %	25 %	218202747
65	NC_011720	CAAA	2	8	29812	29819	75 %	0 %	0 %	25 %	218202747
66	NC_011720	TAAT	2	8	30816	30823	50 %	50 %	0 %	0 %	218202738
67	NC_011720	CAAA	2	8	31960	31967	75 %	0 %	0 %	25 %	218202782
68	NC_011720	TTTA	2	8	32307	32314	25 %	75 %	0 %	0 %	218202782
69	NC_011720	ATTG	2	8	32830	32837	25 %	50 %	25 %	0 %	218202786
70	NC_011720	TAAT	2	8	32847	32854	50 %	50 %	0 %	0 %	218202786
71	NC_011720	AAAC	2	8	33929	33936	75 %	0 %	0 %	25 %	218202775
72	NC_011720	ATTT	2	8	33945	33952	25 %	75 %	0 %	0 %	218202775
73	NC_011720	TATT	2	8	35952	35959	25 %	75 %	0 %	0 %	218202779
74	NC_011720	ATTC	2	8	37230	37237	25 %	50 %	0 %	25 %	218202733
75	NC_011720	ATTT	2	8	37263	37270	25 %	75 %	0 %	0 %	218202733
76	NC_011720	AACT	2	8	37936	37943	50 %	25 %	0 %	25 %	218202740
77	NC_011720	TAAA	2	8	38346	38353	75 %	25 %	0 %	0 %	218202740
78	NC_011720	AAAT	2	8	38701	38708	75 %	25 %	0 %	0 %	218202740
79	NC_011720	AATA	2	8	38821	38828	75 %	25 %	0 %	0 %	218202772
80	NC_011720	TCAA	3	12	39015	39026	50 %	25 %	0 %	25 %	218202772
81	NC_011720	GATA	2	8	39474	39481	50 %	25 %	25 %	0 %	218202777
82	NC_011720	TAAA	2	8	40001	40008	75 %	25 %	0 %	0 %	218202777
83	NC_011720	TATG	2	8	40089	40096	25 %	50 %	25 %	0 %	218202777
84	NC_011720	AGGG	2	8	40189	40196	25 %	0 %	75 %	0 %	218202767
85	NC_011720	AATT	2	8	40866	40873	50 %	50 %	0 %	0 %	218202773
86	NC_011720	AGAT	2	8	40920	40927	50 %	25 %	25 %	0 %	218202773
87	NC_011720	AGAT	2	8	40953	40960	50 %	25 %	25 %	0 %	218202773
88	NC_011720	AGAT	2	8	40986	40993	50 %	25 %	25 %	0 %	218202773
89	NC_011720	AGAT	2	8	41094	41101	50 %	25 %	25 %	0 %	218202773
90	NC_011720	AGAT	2	8	41169	41176	50 %	25 %	25 %	0 %	218202773
91	NC_011720	AGAT	2	8	41223	41230	50 %	25 %	25 %	0 %	218202773
92	NC_011720	CATT	2	8	41324	41331	25 %	50 %	0 %	25 %	218202773
93	NC_011720	TAAT	2	8	41360	41367	50 %	50 %	0 %	0 %	218202773
94	NC_011720	AAAT	2	8	41674	41681	75 %	25 %	0 %	0 %	218202761
95	NC_011720	AAAC	2	8	41861	41868	75 %	0 %	0 %	25 %	218202761
96	NC_011720	GATG	2	8	42159	42166	25 %	25 %	50 %	0 %	218202761
97	NC_011720	TAAA	2	8	42709	42716	75 %	25 %	0 %	0 %	218202761
98	NC_011720	AATA	2	8	42789	42796	75 %	25 %	0 %	0 %	218202761
99	NC_011720	TAAT	2	8	42802	42809	50 %	50 %	0 %	0 %	218202761
100	NC_011720	AGAT	2	8	42872	42879	50 %	25 %	25 %	0 %	218202761
101	NC_011720	AAAT	3	12	43594	43605	75 %	25 %	0 %	0 %	218202785
102	NC_011720	TTTA	2	8	43625	43632	25 %	75 %	0 %	0 %	218202785
103	NC_011720	AACC	2	8	43977	43984	50 %	0 %	0 %	50 %	218202785
104	NC_011720	GCAA	2	8	44880	44887	50 %	0 %	25 %	25 %	218202774
105	NC_011720	GAAA	2	8	44919	44926	75 %	0 %	25 %	0 %	218202774
106	NC_011720	AGAA	2	8	44986	44993	75 %	0 %	25 %	0 %	218202774
107	NC_011720	TAAA	2	8	46623	46630	75 %	25 %	0 %	0 %	218202770
108	NC_011720	AATT	2	8	46669	46676	50 %	50 %	0 %	0 %	218202770
109	NC_011720	CAAA	2	8	46828	46835	75 %	0 %	0 %	25 %	218202781
110	NC_011720	AAAT	2	8	46866	46873	75 %	25 %	0 %	0 %	218202781
111	NC_011720	AATT	2	8	46917	46924	50 %	50 %	0 %	0 %	218202781
112	NC_011720	TAGC	2	8	47024	47031	25 %	25 %	25 %	25 %	218202781
113	NC_011720	TGAT	2	8	47231	47238	25 %	50 %	25 %	0 %	218202781
114	NC_011720	AGCA	2	8	47592	47599	50 %	0 %	25 %	25 %	218202781
115	NC_011720	AAAT	2	8	47618	47625	75 %	25 %	0 %	0 %	218202781

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.