MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-3+10

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011720	GA	3	6	1742	1747	50 %	0 %	50 %	0 %	218202753
2	NC_011720	CA	3	6	2309	2314	50 %	0 %	0 %	50 %	218202748
3	NC_011720	TA	3	6	2432	2437	50 %	50 %	0 %	0 %	218202748
4	NC_011720	AG	3	6	2548	2553	50 %	0 %	50 %	0 %	218202748
5	NC_011720	AT	3	6	2744	2749	50 %	50 %	0 %	0 %	218202737
6	NC_011720	AT	3	6	2978	2983	50 %	50 %	0 %	0 %	218202737
7	NC_011720	AT	3	6	3372	3377	50 %	50 %	0 %	0 %	218202768
8	NC_011720	AT	3	6	4057	4062	50 %	50 %	0 %	0 %	218202730
9	NC_011720	AT	3	6	6088	6093	50 %	50 %	0 %	0 %	218202759
10	NC_011720	AT	3	6	6256	6261	50 %	50 %	0 %	0 %	218202759
11	NC_011720	AT	3	6	6561	6566	50 %	50 %	0 %	0 %	218202727
12	NC_011720	AT	3	6	7335	7340	50 %	50 %	0 %	0 %	218202755
13	NC_011720	AT	3	6	7579	7584	50 %	50 %	0 %	0 %	218202755
14	NC_011720	AT	3	6	7633	7638	50 %	50 %	0 %	0 %	218202755
15	NC_011720	AT	3	6	7687	7692	50 %	50 %	0 %	0 %	218202755
16	NC_011720	TA	3	6	10870	10875	50 %	50 %	0 %	0 %	218202757
17	NC_011720	TA	3	6	11457	11462	50 %	50 %	0 %	0 %	218202739
18	NC_011720	TA	3	6	11881	11886	50 %	50 %	0 %	0 %	218202784
19	NC_011720	TA	3	6	12196	12201	50 %	50 %	0 %	0 %	218202784
20	NC_011720	AG	3	6	12637	12642	50 %	0 %	50 %	0 %	218202780
21	NC_011720	AT	3	6	13011	13016	50 %	50 %	0 %	0 %	218202745
22	NC_011720	GA	3	6	15920	15925	50 %	0 %	50 %	0 %	218202743
23	NC_011720	TA	3	6	16174	16179	50 %	50 %	0 %	0 %	218202743
24	NC_011720	GA	3	6	18163	18168	50 %	0 %	50 %	0 %	218202736
25	NC_011720	AT	3	6	18985	18990	50 %	50 %	0 %	0 %	218202744
26	NC_011720	GA	3	6	19478	19483	50 %	0 %	50 %	0 %	218202744
27	NC_011720	AT	3	6	19645	19650	50 %	50 %	0 %	0 %	218202744
28	NC_011720	TG	3	6	19999	20004	0 %	50 %	50 %	0 %	218202742
29	NC_011720	TA	3	6	20050	20055	50 %	50 %	0 %	0 %	218202742
30	NC_011720	AC	3	6	20257	20262	50 %	0 %	0 %	50 %	218202742
31	NC_011720	AT	3	6	20436	20441	50 %	50 %	0 %	0 %	218202742
32	NC_011720	CT	3	6	20607	20612	0 %	50 %	0 %	50 %	218202742
33	NC_011720	TA	3	6	21344	21349	50 %	50 %	0 %	0 %	218202751
34	NC_011720	AG	5	10	21445	21454	50 %	0 %	50 %	0 %	218202751
35	NC_011720	AG	3	6	24645	24650	50 %	0 %	50 %	0 %	218202760
36	NC_011720	AT	3	6	25563	25568	50 %	50 %	0 %	0 %	218202778
37	NC_011720	AT	3	6	25866	25871	50 %	50 %	0 %	0 %	218202756
38	NC_011720	TA	3	6	25882	25887	50 %	50 %	0 %	0 %	218202756
39	NC_011720	TA	3	6	26356	26361	50 %	50 %	0 %	0 %	218202750
40	NC_011720	TA	3	6	27454	27459	50 %	50 %	0 %	0 %	218202734
41	NC_011720	AG	3	6	29125	29130	50 %	0 %	50 %	0 %	218202747
42	NC_011720	CT	3	6	29727	29732	0 %	50 %	0 %	50 %	218202747
43	NC_011720	AC	3	6	30028	30033	50 %	0 %	0 %	50 %	218202747
44	NC_011720	AT	3	6	30137	30142	50 %	50 %	0 %	0 %	218202747
45	NC_011720	TA	3	6	30553	30558	50 %	50 %	0 %	0 %	218202738
46	NC_011720	AT	3	6	31074	31079	50 %	50 %	0 %	0 %	218202731
47	NC_011720	TA	3	6	31571	31576	50 %	50 %	0 %	0 %	218202731
48	NC_011720	TA	3	6	32083	32088	50 %	50 %	0 %	0 %	218202782
49	NC_011720	AT	3	6	32629	32634	50 %	50 %	0 %	0 %	218202746
50	NC_011720	TA	4	8	33020	33027	50 %	50 %	0 %	0 %	218202786
51	NC_011720	AT	3	6	33299	33304	50 %	50 %	0 %	0 %	218202786
52	NC_011720	AT	3	6	33708	33713	50 %	50 %	0 %	0 %	218202775
53	NC_011720	AT	3	6	33905	33910	50 %	50 %	0 %	0 %	218202775
54	NC_011720	CA	3	6	34820	34825	50 %	0 %	0 %	50 %	218202776
55	NC_011720	TA	4	8	34917	34924	50 %	50 %	0 %	0 %	218202776
56	NC_011720	AT	3	6	35737	35742	50 %	50 %	0 %	0 %	218202752
57	NC_011720	AT	3	6	36141	36146	50 %	50 %	0 %	0 %	218202779
58	NC_011720	AT	3	6	36407	36412	50 %	50 %	0 %	0 %	218202733
59	NC_011720	TA	3	6	36701	36706	50 %	50 %	0 %	0 %	218202733
60	NC_011720	TC	4	8	38242	38249	0 %	50 %	0 %	50 %	218202740
61	NC_011720	AT	3	6	39282	39287	50 %	50 %	0 %	0 %	218202772
62	NC_011720	AC	3	6	39485	39490	50 %	0 %	0 %	50 %	218202777
63	NC_011720	TA	4	8	40421	40428	50 %	50 %	0 %	0 %	218202767
64	NC_011720	TA	3	6	40475	40480	50 %	50 %	0 %	0 %	218202767
65	NC_011720	AT	3	6	40899	40904	50 %	50 %	0 %	0 %	218202773
66	NC_011720	AT	3	6	41341	41346	50 %	50 %	0 %	0 %	218202773
67	NC_011720	TG	3	6	41698	41703	0 %	50 %	50 %	0 %	218202761
68	NC_011720	AG	3	6	42030	42035	50 %	0 %	50 %	0 %	218202761
69	NC_011720	CA	3	6	42505	42510	50 %	0 %	0 %	50 %	218202761
70	NC_011720	GT	3	6	43108	43113	0 %	50 %	50 %	0 %	218202766
71	NC_011720	TA	3	6	43433	43438	50 %	50 %	0 %	0 %	218202766
72	NC_011720	GA	3	6	43619	43624	50 %	0 %	50 %	0 %	218202785
73	NC_011720	TA	3	6	43873	43878	50 %	50 %	0 %	0 %	218202785
74	NC_011720	AC	3	6	44858	44863	50 %	0 %	0 %	50 %	218202774
75	NC_011720	TG	3	6	46357	46362	0 %	50 %	50 %	0 %	218202770
76	NC_011720	AT	3	6	46699	46704	50 %	50 %	0 %	0 %	218202770
77	NC_011720	AT	3	6	46883	46888	50 %	50 %	0 %	0 %	218202781
78	NC_011720	AT	3	6	47223	47228	50 %	50 %	0 %	0 %	218202781
79	NC_011720	TA	3	6	47540	47545	50 %	50 %	0 %	0 %	218202781
80	NC_011720	AG	3	6	48127	48132	50 %	0 %	50 %	0 %	218202781

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.