MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS223 plasmid pS22302

Total Repeats: 174

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011668	ATTC	2	8	2	9	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011668	TCGG	2	8	76	83	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011668	GCAA	2	8	125	132	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011668	GCGA	2	8	375	382	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011668	AGCA	2	8	425	432	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011668	TAGA	2	8	1184	1191	50 %	25 %	25 %	0 %	217980265
7	NC_011668	ATTT	2	8	1489	1496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011668	CAGC	2	8	1981	1988	25 %	0 %	25 %	50 %	217980266
9	NC_011668	TGAC	2	8	2220	2227	25 %	25 %	25 %	25 %	217980266
10	NC_011668	CAAT	2	8	2236	2243	50 %	25 %	0 %	25 %	217980266
11	NC_011668	CTCC	2	8	2587	2594	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_011668	TAAA	2	8	3104	3111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011668	ATTA	2	8	3273	3280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011668	TTTA	2	8	3824	3831	25 %	75 %	0 %	0 %	217980268
15	NC_011668	TTAT	2	8	4430	4437	25 %	75 %	0 %	0 %	217980268
16	NC_011668	GTAA	2	8	4474	4481	50 %	25 %	25 %	0 %	217980268
17	NC_011668	CTTG	2	8	4611	4618	0 %	50 %	25 %	25 %	217980268
18	NC_011668	GAGT	2	8	4636	4643	25 %	25 %	50 %	0 %	217980268
19	NC_011668	GTTC	2	8	4767	4774	0 %	50 %	25 %	25 %	217980268
20	NC_011668	GTTA	2	8	5269	5276	25 %	50 %	25 %	0 %	217980268
21	NC_011668	TGAT	2	8	5999	6006	25 %	50 %	25 %	0 %	217980268
22	NC_011668	ATTG	2	8	6190	6197	25 %	50 %	25 %	0 %	217980268
23	NC_011668	TCAA	2	8	6293	6300	50 %	25 %	0 %	25 %	217980268
24	NC_011668	GTCT	2	8	6744	6751	0 %	50 %	25 %	25 %	217980268
25	NC_011668	TTTG	2	8	7443	7450	0 %	75 %	25 %	0 %	217980268
26	NC_011668	TTTG	2	8	7959	7966	0 %	75 %	25 %	0 %	217980268
27	NC_011668	CTTG	2	8	8037	8044	0 %	50 %	25 %	25 %	217980268
28	NC_011668	CTTT	2	8	8427	8434	0 %	75 %	0 %	25 %	217980268
29	NC_011668	CAAA	2	8	9030	9037	75 %	0 %	0 %	25 %	217980268
30	NC_011668	GTGA	2	8	9230	9237	25 %	25 %	50 %	0 %	217980268
31	NC_011668	GGTT	2	8	9339	9346	0 %	50 %	50 %	0 %	217980268
32	NC_011668	GCAA	2	8	9443	9450	50 %	0 %	25 %	25 %	217980268
33	NC_011668	ATTA	2	8	10685	10692	50 %	50 %	0 %	0 %	217980271
34	NC_011668	TTTG	2	8	10718	10725	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011668	GCGT	2	8	11185	11192	0 %	25 %	50 %	25 %	217980272
36	NC_011668	CATC	2	8	11557	11564	25 %	25 %	0 %	50 %	217980272
37	NC_011668	TTGA	2	8	13459	13466	25 %	50 %	25 %	0 %	217980274
38	NC_011668	GTTG	2	8	14120	14127	0 %	50 %	50 %	0 %	217980274
39	NC_011668	ACAT	2	8	14349	14356	50 %	25 %	0 %	25 %	217980274
40	NC_011668	GCTT	2	8	14555	14562	0 %	50 %	25 %	25 %	217980274
41	NC_011668	CTTG	2	8	14734	14741	0 %	50 %	25 %	25 %	217980274
42	NC_011668	GTGA	2	8	15183	15190	25 %	25 %	50 %	0 %	217980274
43	NC_011668	ATTG	2	8	15249	15256	25 %	50 %	25 %	0 %	217980274
44	NC_011668	CATA	2	8	15907	15914	50 %	25 %	0 %	25 %	217980274
45	NC_011668	GCAA	2	8	16029	16036	50 %	0 %	25 %	25 %	217980274
46	NC_011668	CTTG	2	8	16195	16202	0 %	50 %	25 %	25 %	217980274
47	NC_011668	AAGG	2	8	16924	16931	50 %	0 %	50 %	0 %	217980275
48	NC_011668	TCTT	2	8	16997	17004	0 %	75 %	0 %	25 %	217980275
49	NC_011668	CCGC	2	8	17033	17040	0 %	0 %	25 %	75 %	217980275
50	NC_011668	AAAT	2	8	17440	17447	75 %	25 %	0 %	0 %	217980275
51	NC_011668	AGCA	2	8	17579	17586	50 %	0 %	25 %	25 %	217980275
52	NC_011668	GCAA	2	8	17723	17730	50 %	0 %	25 %	25 %	217980276
53	NC_011668	ATGC	2	8	17744	17751	25 %	25 %	25 %	25 %	217980276
54	NC_011668	GGCA	2	8	17959	17966	25 %	0 %	50 %	25 %	217980277
55	NC_011668	GGAA	2	8	18016	18023	50 %	0 %	50 %	0 %	217980277
56	NC_011668	GAAA	2	8	18147	18154	75 %	0 %	25 %	0 %	217980277
57	NC_011668	TTTG	2	8	18579	18586	0 %	75 %	25 %	0 %	217980278
58	NC_011668	GGCG	2	8	18681	18688	0 %	0 %	75 %	25 %	217980278
59	NC_011668	TTGA	2	8	18768	18775	25 %	50 %	25 %	0 %	217980278
60	NC_011668	TAAC	2	8	19147	19154	50 %	25 %	0 %	25 %	217980279
61	NC_011668	TGGC	2	8	19213	19220	0 %	25 %	50 %	25 %	217980279
62	NC_011668	GCTT	2	8	19686	19693	0 %	50 %	25 %	25 %	217980279
63	NC_011668	AAGT	2	8	21786	21793	50 %	25 %	25 %	0 %	217980281
64	NC_011668	AATG	2	8	22381	22388	50 %	25 %	25 %	0 %	217980281
65	NC_011668	ATCT	2	8	22984	22991	25 %	50 %	0 %	25 %	217980282
66	NC_011668	TTGT	2	8	23502	23509	0 %	75 %	25 %	0 %	217980282
67	NC_011668	GCTT	2	8	23571	23578	0 %	50 %	25 %	25 %	217980283
68	NC_011668	GCCC	2	8	24775	24782	0 %	0 %	25 %	75 %	217980285
69	NC_011668	TGAG	2	8	25653	25660	25 %	25 %	50 %	0 %	217980285
70	NC_011668	TGCC	2	8	26032	26039	0 %	25 %	25 %	50 %	217980285
71	NC_011668	GATT	2	8	26407	26414	25 %	50 %	25 %	0 %	217980285
72	NC_011668	ATAG	2	8	26798	26805	50 %	25 %	25 %	0 %	217980285
73	NC_011668	GACT	2	8	27281	27288	25 %	25 %	25 %	25 %	217980286
74	NC_011668	AATT	2	8	27629	27636	50 %	50 %	0 %	0 %	217980287
75	NC_011668	ATCA	2	8	28936	28943	50 %	25 %	0 %	25 %	217980287
76	NC_011668	TGTT	2	8	29196	29203	0 %	75 %	25 %	0 %	217980288
77	NC_011668	CAAT	2	8	29788	29795	50 %	25 %	0 %	25 %	217980288
78	NC_011668	CGTT	2	8	30609	30616	0 %	50 %	25 %	25 %	217980290
79	NC_011668	CATC	2	8	30800	30807	25 %	25 %	0 %	50 %	217980290
80	NC_011668	GTTT	2	8	31437	31444	0 %	75 %	25 %	0 %	217980292
81	NC_011668	TAAG	2	8	32173	32180	50 %	25 %	25 %	0 %	217980293
82	NC_011668	GCTC	2	8	33078	33085	0 %	25 %	25 %	50 %	217980294
83	NC_011668	CAAG	2	8	33147	33154	50 %	0 %	25 %	25 %	217980294
84	NC_011668	AAGC	2	8	33295	33302	50 %	0 %	25 %	25 %	217980294
85	NC_011668	CTTT	2	8	33669	33676	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011668	GCAA	2	8	33748	33755	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_011668	TGAT	2	8	34910	34917	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011668	TACC	2	8	35251	35258	25 %	25 %	0 %	50 %	217980296
89	NC_011668	ACAA	2	8	35259	35266	75 %	0 %	0 %	25 %	217980296
90	NC_011668	TGAA	2	8	35291	35298	50 %	25 %	25 %	0 %	217980296
91	NC_011668	ATAG	2	8	37277	37284	50 %	25 %	25 %	0 %	217980297
92	NC_011668	TATT	2	8	37455	37462	25 %	75 %	0 %	0 %	217980297
93	NC_011668	TTGA	2	8	37594	37601	25 %	50 %	25 %	0 %	217980298
94	NC_011668	CAAT	2	8	37742	37749	50 %	25 %	0 %	25 %	217980298
95	NC_011668	GAGT	2	8	38067	38074	25 %	25 %	50 %	0 %	217980298
96	NC_011668	ATTA	2	8	38202	38209	50 %	50 %	0 %	0 %	217980298
97	NC_011668	ATTG	2	8	38559	38566	25 %	50 %	25 %	0 %	217980298
98	NC_011668	CTCC	2	8	38614	38621	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
99	NC_011668	CCTG	2	8	38845	38852	0 %	25 %	25 %	50 %	217980299
100	NC_011668	TTTC	2	8	39059	39066	0 %	75 %	0 %	25 %	217980299
101	NC_011668	ATTA	2	8	39408	39415	50 %	50 %	0 %	0 %	217980299
102	NC_011668	GCTG	2	8	40004	40011	0 %	25 %	50 %	25 %	217980300
103	NC_011668	GTTT	2	8	40090	40097	0 %	75 %	25 %	0 %	217980300
104	NC_011668	TTTC	2	8	40420	40427	0 %	75 %	0 %	25 %	217980300
105	NC_011668	AGCC	2	8	40693	40700	25 %	0 %	25 %	50 %	217980300
106	NC_011668	GCAC	2	8	40752	40759	25 %	0 %	25 %	50 %	217980300
107	NC_011668	TTAA	2	8	41445	41452	50 %	50 %	0 %	0 %	217980301
108	NC_011668	AAAC	2	8	42373	42380	75 %	0 %	0 %	25 %	217980301
109	NC_011668	TCAC	2	8	42399	42406	25 %	25 %	0 %	50 %	217980301
110	NC_011668	AAAG	2	8	43401	43408	75 %	0 %	25 %	0 %	217980302
111	NC_011668	ATCA	2	8	43722	43729	50 %	25 %	0 %	25 %	217980302
112	NC_011668	CGAC	2	8	43975	43982	25 %	0 %	25 %	50 %	217980302
113	NC_011668	TGTT	2	8	44197	44204	0 %	75 %	25 %	0 %	217980302
114	NC_011668	GTAC	2	8	44422	44429	25 %	25 %	25 %	25 %	217980302
115	NC_011668	TTGG	2	8	44743	44750	0 %	50 %	50 %	0 %	217980302
116	NC_011668	GTTT	2	8	45199	45206	0 %	75 %	25 %	0 %	217980302
117	NC_011668	ACGA	2	8	45228	45235	50 %	0 %	25 %	25 %	217980302
118	NC_011668	TTGG	2	8	45274	45281	0 %	50 %	50 %	0 %	217980302
119	NC_011668	TAAA	2	8	45569	45576	75 %	25 %	0 %	0 %	217980303
120	NC_011668	CTTC	2	8	46379	46386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_011668	ATCA	2	8	46677	46684	50 %	25 %	0 %	25 %	217980305
122	NC_011668	TTTA	2	8	47384	47391	25 %	75 %	0 %	0 %	217980306
123	NC_011668	ATAC	2	8	48275	48282	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011668	ACAT	2	8	49030	49037	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_011668	TCAA	2	8	49307	49314	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_011668	AGCA	2	8	49637	49644	50 %	0 %	25 %	25 %	217980311
127	NC_011668	CTAC	2	8	49807	49814	25 %	25 %	0 %	50 %	217980311
128	NC_011668	GATC	2	8	50156	50163	25 %	25 %	25 %	25 %	217980312
129	NC_011668	TCTG	2	8	50326	50333	0 %	50 %	25 %	25 %	217980312
130	NC_011668	ATGG	2	8	50363	50370	25 %	25 %	50 %	0 %	217980312
131	NC_011668	CCCA	2	8	50648	50655	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_011668	CTTT	2	8	51516	51523	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_011668	TGCT	2	8	51640	51647	0 %	50 %	25 %	25 %	217980315
134	NC_011668	GTTG	2	8	52625	52632	0 %	50 %	50 %	0 %	217980315
135	NC_011668	TTGA	2	8	53269	53276	25 %	50 %	25 %	0 %	217980315
136	NC_011668	AATG	2	8	53425	53432	50 %	25 %	25 %	0 %	217980315
137	NC_011668	GAAC	2	8	55210	55217	50 %	0 %	25 %	25 %	217980316
138	NC_011668	CATT	2	8	55382	55389	25 %	50 %	0 %	25 %	217980316
139	NC_011668	TGGT	2	8	55896	55903	0 %	50 %	50 %	0 %	217980316
140	NC_011668	TAAG	2	8	56486	56493	50 %	25 %	25 %	0 %	217980317
141	NC_011668	TATC	2	8	56503	56510	25 %	50 %	0 %	25 %	217980317
142	NC_011668	CAAA	2	8	56596	56603	75 %	0 %	0 %	25 %	217980317
143	NC_011668	TTTA	2	8	56804	56811	25 %	75 %	0 %	0 %	217980317
144	NC_011668	TAAA	2	8	56987	56994	75 %	25 %	0 %	0 %	217980317
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158	NC_011668	TGTC	2	8	62273	62280	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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172	NC_011668	CAAT	2	8	64968	64975	50 %	25 %	0 %	25 %	217980325
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174	NC_011668	TAGC	2	8	65410	65417	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.