MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS223 plasmid pS22302

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011668	GC	3	6	349	354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011668	AC	3	6	439	444	50 %	0 %	0 %	50 %	217980265
3	NC_011668	GT	3	6	643	648	0 %	50 %	50 %	0 %	217980265
4	NC_011668	AC	3	6	1156	1161	50 %	0 %	0 %	50 %	217980265
5	NC_011668	TA	3	6	1309	1314	50 %	50 %	0 %	0 %	217980265
6	NC_011668	GT	3	6	3218	3223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011668	AT	3	6	3781	3786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011668	CG	4	8	4678	4685	0 %	0 %	50 %	50 %	217980268
9	NC_011668	CG	3	6	5257	5262	0 %	0 %	50 %	50 %	217980268
10	NC_011668	TG	3	6	5401	5406	0 %	50 %	50 %	0 %	217980268
11	NC_011668	GC	5	10	6275	6284	0 %	0 %	50 %	50 %	217980268
12	NC_011668	GT	3	6	6469	6474	0 %	50 %	50 %	0 %	217980268
13	NC_011668	TG	3	6	6515	6520	0 %	50 %	50 %	0 %	217980268
14	NC_011668	GC	3	6	6831	6836	0 %	0 %	50 %	50 %	217980268
15	NC_011668	AT	3	6	7206	7211	50 %	50 %	0 %	0 %	217980268
16	NC_011668	GT	3	6	7865	7870	0 %	50 %	50 %	0 %	217980268
17	NC_011668	CT	3	6	8516	8521	0 %	50 %	0 %	50 %	217980268
18	NC_011668	CG	3	6	8655	8660	0 %	0 %	50 %	50 %	217980268
19	NC_011668	GC	3	6	9082	9087	0 %	0 %	50 %	50 %	217980268
20	NC_011668	GC	4	8	9189	9196	0 %	0 %	50 %	50 %	217980268
21	NC_011668	GT	3	6	9820	9825	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011668	CA	3	6	9984	9989	50 %	0 %	0 %	50 %	217980269
23	NC_011668	AC	3	6	10030	10035	50 %	0 %	0 %	50 %	217980269
24	NC_011668	AC	3	6	10230	10235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011668	GC	3	6	12052	12057	0 %	0 %	50 %	50 %	217980272
26	NC_011668	CA	3	6	12488	12493	50 %	0 %	0 %	50 %	217980272
27	NC_011668	GC	3	6	14867	14872	0 %	0 %	50 %	50 %	217980274
28	NC_011668	CG	3	6	15274	15279	0 %	0 %	50 %	50 %	217980274
29	NC_011668	CG	3	6	16845	16850	0 %	0 %	50 %	50 %	217980275
30	NC_011668	CA	3	6	16952	16957	50 %	0 %	0 %	50 %	217980275
31	NC_011668	TG	3	6	17087	17092	0 %	50 %	50 %	0 %	217980275
32	NC_011668	TG	3	6	18208	18213	0 %	50 %	50 %	0 %	217980277
33	NC_011668	GA	3	6	19099	19104	50 %	0 %	50 %	0 %	217980279
34	NC_011668	GC	3	6	19371	19376	0 %	0 %	50 %	50 %	217980279
35	NC_011668	GC	3	6	19843	19848	0 %	0 %	50 %	50 %	217980279
36	NC_011668	GC	3	6	20106	20111	0 %	0 %	50 %	50 %	217980280
37	NC_011668	GC	3	6	20131	20136	0 %	0 %	50 %	50 %	217980280
38	NC_011668	AC	3	6	20179	20184	50 %	0 %	0 %	50 %	217980280
39	NC_011668	TG	3	6	22263	22268	0 %	50 %	50 %	0 %	217980281
40	NC_011668	CG	3	6	23202	23207	0 %	0 %	50 %	50 %	217980282
41	NC_011668	CG	3	6	23644	23649	0 %	0 %	50 %	50 %	217980283
42	NC_011668	GT	3	6	23706	23711	0 %	50 %	50 %	0 %	217980283
43	NC_011668	CG	3	6	23860	23865	0 %	0 %	50 %	50 %	217980283
44	NC_011668	CG	3	6	24486	24491	0 %	0 %	50 %	50 %	217980284
45	NC_011668	GC	3	6	24732	24737	0 %	0 %	50 %	50 %	217980285
46	NC_011668	CA	3	6	25097	25102	50 %	0 %	0 %	50 %	217980285
47	NC_011668	GT	3	6	26449	26454	0 %	50 %	50 %	0 %	217980285
48	NC_011668	AC	3	6	27433	27438	50 %	0 %	0 %	50 %	217980286
49	NC_011668	CG	3	6	29729	29734	0 %	0 %	50 %	50 %	217980288
50	NC_011668	GC	3	6	29930	29935	0 %	0 %	50 %	50 %	217980288
51	NC_011668	GC	3	6	30067	30072	0 %	0 %	50 %	50 %	217980289
52	NC_011668	GT	3	6	30481	30486	0 %	50 %	50 %	0 %	217980289
53	NC_011668	AG	3	6	31488	31493	50 %	0 %	50 %	0 %	217980292
54	NC_011668	GT	3	6	31699	31704	0 %	50 %	50 %	0 %	217980293
55	NC_011668	GA	3	6	31753	31758	50 %	0 %	50 %	0 %	217980293
56	NC_011668	TG	3	6	31964	31969	0 %	50 %	50 %	0 %	217980293
57	NC_011668	AT	3	6	32245	32250	50 %	50 %	0 %	0 %	217980293
58	NC_011668	TC	3	6	32392	32397	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011668	TA	3	6	32405	32410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011668	GT	3	6	32691	32696	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011668	GT	3	6	33158	33163	0 %	50 %	50 %	0 %	217980294
62	NC_011668	TC	3	6	33544	33549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011668	GT	3	6	34217	34222	0 %	50 %	50 %	0 %	217980295
64	NC_011668	AG	3	6	34726	34731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011668	TG	3	6	34941	34946	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011668	GT	3	6	35673	35678	0 %	50 %	50 %	0 %	217980296
67	NC_011668	TA	3	6	36770	36775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011668	AG	3	6	37430	37435	50 %	0 %	50 %	0 %	217980297
69	NC_011668	GC	3	6	37625	37630	0 %	0 %	50 %	50 %	217980298
70	NC_011668	AG	3	6	38436	38441	50 %	0 %	50 %	0 %	217980298
71	NC_011668	AT	3	6	39127	39132	50 %	50 %	0 %	0 %	217980299
72	NC_011668	TC	3	6	39219	39224	0 %	50 %	0 %	50 %	217980299
73	NC_011668	TA	3	6	39459	39464	50 %	50 %	0 %	0 %	217980299
74	NC_011668	CA	3	6	40134	40139	50 %	0 %	0 %	50 %	217980300
75	NC_011668	TA	3	6	41399	41404	50 %	50 %	0 %	0 %	217980301
76	NC_011668	TC	3	6	42152	42157	0 %	50 %	0 %	50 %	217980301
77	NC_011668	CA	3	6	44166	44171	50 %	0 %	0 %	50 %	217980302
78	NC_011668	TC	3	6	45693	45698	0 %	50 %	0 %	50 %	217980303
79	NC_011668	CG	3	6	46068	46073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_011668	AT	3	6	47119	47124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011668	TA	3	6	47922	47927	50 %	50 %	0 %	0 %	217980308
82	NC_011668	TG	5	10	48076	48085	0 %	50 %	50 %	0 %	217980308
83	NC_011668	AC	3	6	48247	48252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011668	GT	3	6	48257	48262	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011668	GT	3	6	48269	48274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011668	GT	3	6	48287	48292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011668	GT	3	6	48305	48310	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011668	CT	3	6	48383	48388	0 %	50 %	0 %	50 %	217980309
89	NC_011668	AT	3	6	48767	48772	50 %	50 %	0 %	0 %	217980309
90	NC_011668	CT	3	6	48876	48881	0 %	50 %	0 %	50 %	217980309
91	NC_011668	GT	3	6	49044	49049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011668	GT	3	6	49062	49067	0 %	50 %	50 %	0 %	217980310
93	NC_011668	AC	3	6	49070	49075	50 %	0 %	0 %	50 %	217980310
94	NC_011668	GT	3	6	49080	49085	0 %	50 %	50 %	0 %	217980310
95	NC_011668	TG	3	6	50065	50070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011668	AG	3	6	52150	52155	50 %	0 %	50 %	0 %	217980315
97	NC_011668	AC	3	6	52731	52736	50 %	0 %	0 %	50 %	217980315
98	NC_011668	AC	3	6	53373	53378	50 %	0 %	0 %	50 %	217980315
99	NC_011668	CT	3	6	55176	55181	0 %	50 %	0 %	50 %	217980316
100	NC_011668	CT	3	6	55304	55309	0 %	50 %	0 %	50 %	217980316
101	NC_011668	CT	3	6	55830	55835	0 %	50 %	0 %	50 %	217980316
102	NC_011668	CA	3	6	56310	56315	50 %	0 %	0 %	50 %	217980317
103	NC_011668	AT	3	6	58405	58410	50 %	50 %	0 %	0 %	217980318
104	NC_011668	AG	3	6	59695	59700	50 %	0 %	50 %	0 %	217980319
105	NC_011668	AT	3	6	60253	60258	50 %	50 %	0 %	0 %	217980320
106	NC_011668	AG	3	6	60560	60565	50 %	0 %	50 %	0 %	217980320
107	NC_011668	TC	3	6	61733	61738	0 %	50 %	0 %	50 %	217980321
108	NC_011668	GC	3	6	62264	62269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_011668	GC	3	6	62819	62824	0 %	0 %	50 %	50 %	217980322
110	NC_011668	CG	3	6	63287	63292	0 %	0 %	50 %	50 %	217980322

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.