MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylocella silvestris BL2 chromosome

Total Repeats: 652

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011666	CGATC	2	10	206	215	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_011666	CGGCA	2	10	4732	4741	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_011666	ATCTC	2	10	5235	5244	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_011666	CGATC	2	10	15275	15284	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_011666	CGAGC	2	10	19685	19694	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_011666	GCTGC	3	15	19695	19709	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_011666	CCAGT	2	10	38168	38177	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_011666	GGCGA	2	10	42493	42502	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011666	CGCTT	2	10	51695	51704	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_011666	AAGAC	2	10	51989	51998	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011666	TGCGT	2	10	52231	52240	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011666	CGGCT	2	10	60766	60775	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_011666	GACGC	2	10	77487	77496	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_011666	CCGAT	2	10	81195	81204	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_011666	CGTCG	2	10	84306	84315	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_011666	GCCTT	2	10	97187	97196	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_011666	GGCCG	2	10	111431	111440	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18	NC_011666	AGGCG	2	10	115586	115595	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011666	GGCGA	2	10	140630	140639	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011666	GGCGC	2	10	142423	142432	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
21	NC_011666	ACGGA	2	10	143726	143735	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011666	CTGCG	2	10	148824	148833	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_011666	TCGAT	2	10	148980	148989	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_011666	CTGCG	2	10	149412	149421	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_011666	GGAGC	2	10	149576	149585	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011666	CACGC	2	10	151059	151068	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_011666	CAACG	2	10	156332	156341	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_011666	AGCGC	2	10	156575	156584	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_011666	CGATC	2	10	156767	156776	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_011666	GGGCA	2	10	183782	183791	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011666	GCCTC	2	10	192292	192301	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_011666	ATCCA	2	10	202590	202599	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_011666	ATTGG	2	10	213860	213869	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011666	GCGCC	2	10	216615	216624	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
35	NC_011666	TCGGC	2	10	236520	236529	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_011666	GCGCC	2	10	244722	244731	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_011666	GCCAT	2	10	246304	246313	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_011666	TCCGC	2	10	246412	246421	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_011666	TCCGG	2	10	249196	249205	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_011666	CGATG	2	10	258618	258627	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_011666	GCGTC	2	10	265496	265505	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_011666	CGAGG	2	10	284750	284759	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_011666	CGGCG	2	10	285734	285743	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_011666	TGCGT	2	10	291111	291120	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_011666	GCCGC	2	10	294907	294916	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
46	NC_011666	AGGGC	2	10	298352	298361	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011666	GGGCG	2	10	298824	298833	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
48	NC_011666	AGGCG	2	10	299330	299339	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_011666	CCTGA	2	10	309019	309028	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_011666	GCGTT	2	10	311623	311632	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_011666	CCGCC	2	10	311701	311710	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
52	NC_011666	GCCGC	2	10	320856	320865	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
53	NC_011666	GATTC	2	10	322548	322557	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_011666	GCCGC	2	10	324592	324601	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_011666	CCGCG	2	10	324665	324674	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
56	NC_011666	AATGG	2	10	330213	330222	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011666	GCGGG	2	10	330449	330458	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
58	NC_011666	CGCGC	2	10	364093	364102	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
59	NC_011666	AGAAC	2	10	368768	368777	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_011666	GAAGT	2	10	387792	387801	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011666	GCGCC	2	10	392240	392249	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
62	NC_011666	CCCGC	2	10	397986	397995	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
63	NC_011666	TTGGA	2	10	402960	402969	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011666	TGAGC	2	10	406244	406253	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_011666	GCCTA	2	10	422211	422220	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_011666	GCTCC	2	10	428610	428619	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
67	NC_011666	GCCGA	2	10	435861	435870	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_011666	GCCGC	2	10	435894	435903	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
69	NC_011666	CGCGC	2	10	450154	450163	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
70	NC_011666	GAACA	2	10	468788	468797	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011666	AAAAG	2	10	468868	468877	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011666	GGCGA	2	10	471969	471978	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_011666	CAGCT	2	10	499754	499763	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_011666	ATACT	2	10	506257	506266	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_011666	ATATC	2	10	506414	506423	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_011666	TTTAA	2	10	506520	506529	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011666	CCAAG	2	10	506641	506650	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_011666	AGGGC	2	10	513263	513272	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
79	NC_011666	GGCTC	2	10	513839	513848	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_011666	CCTAA	2	10	515113	515122	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_011666	CGGCG	2	10	519131	519140	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
82	NC_011666	TCACG	2	10	535284	535293	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_011666	AGGGC	2	10	548000	548009	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
84	NC_011666	ATCGG	2	10	548278	548287	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_011666	CCCGG	2	10	572092	572101	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
86	NC_011666	GCCGC	2	10	573641	573650	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
87	NC_011666	GATCT	2	10	579237	579246	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_011666	AGGGC	2	10	582162	582171	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_011666	CGCTT	2	10	598887	598896	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_011666	CGGCG	2	10	602280	602289	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_011666	CGCGG	2	10	606888	606897	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
92	NC_011666	TCGCG	2	10	610478	610487	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_011666	GACGC	2	10	613412	613421	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_011666	GCCGC	2	10	617520	617529	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
95	NC_011666	GAAAC	2	10	623560	623569	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_011666	CCGAC	2	10	630042	630051	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
97	NC_011666	CGGCG	2	10	630444	630453	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
98	NC_011666	CGCTC	2	10	636624	636633	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
99	NC_011666	TCACG	2	10	638269	638278	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_011666	CGCTC	2	10	641794	641803	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
101	NC_011666	CGAGG	2	10	645607	645616	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
102	NC_011666	TGCTT	2	10	659124	659133	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_011666	CGTGG	2	10	665297	665306	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_011666	TCCCT	2	10	667511	667520	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
105	NC_011666	CAAAT	2	10	668139	668148	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011666	GCCCG	2	10	675269	675278	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
107	NC_011666	CAATT	2	10	685459	685468	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_011666	TGCCC	2	10	686843	686852	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
109	NC_011666	ATTCG	2	10	686993	687002	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_011666	TTGAG	2	10	693178	693187	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011666	GCCCG	2	10	694063	694072	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
112	NC_011666	GCGCC	2	10	704356	704365	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
113	NC_011666	TCCGC	2	10	708371	708380	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
114	NC_011666	CCCCG	2	10	732642	732651	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
115	NC_011666	GCCTC	2	10	740141	740150	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
116	NC_011666	TCGCC	2	10	742295	742304	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
117	NC_011666	GCGCC	2	10	742408	742417	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
118	NC_011666	GCTTC	2	10	742425	742434	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_011666	CCCGC	2	10	744232	744241	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
120	NC_011666	TTCGT	2	10	748079	748088	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_011666	CAAAA	2	10	761310	761319	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_011666	GGCGC	2	10	764849	764858	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
123	NC_011666	TCAAG	2	10	768964	768973	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_011666	CGCGG	2	10	780017	780026	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
125	NC_011666	GGAAA	2	10	780072	780081	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011666	CGCTT	2	10	802328	802337	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_011666	AGGAG	2	10	809005	809014	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011666	ATCCC	2	10	813181	813190	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
129	NC_011666	AGCGC	2	10	838293	838302	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_011666	CGATC	2	10	844599	844608	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_011666	TGACA	2	10	855397	855406	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_011666	GCGCC	2	10	864035	864044	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
133	NC_011666	CCGCG	2	10	864356	864365	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
134	NC_011666	TTGGC	2	10	864518	864527	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_011666	GTCTC	2	10	864653	864662	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_011666	CCGGC	2	10	865979	865988	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
137	NC_011666	TGGCG	2	10	903453	903462	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
138	NC_011666	GGACC	2	10	903536	903545	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
139	NC_011666	GGCGC	2	10	918367	918376	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
140	NC_011666	GCGTC	2	10	927312	927321	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
141	NC_011666	GGCGC	2	10	938550	938559	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
142	NC_011666	GCCCG	2	10	953689	953698	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
143	NC_011666	CGAAG	2	10	958227	958236	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_011666	GCTCA	2	10	962473	962482	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_011666	AATCG	2	10	962671	962680	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_011666	GAAAG	2	10	964716	964725	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011666	GCCGC	2	10	965091	965100	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
148	NC_011666	ATTCC	2	10	966026	966035	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
149	NC_011666	GCCGC	3	15	977373	977387	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
150	NC_011666	AGCGC	2	10	982364	982373	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
151	NC_011666	GGGCA	2	10	985435	985444	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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153	NC_011666	GTGTT	2	10	991348	991357	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011666	TGTGT	2	10	992779	992788	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011666	ACCGA	2	10	997145	997154	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
156	NC_011666	AGCTT	2	10	1010579	1010588	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
157	NC_011666	GCCAA	2	10	1012315	1012324	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
158	NC_011666	GCCAA	2	10	1018089	1018098	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
159	NC_011666	TTTTG	2	10	1027983	1027992	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_011666	GCAAC	2	10	1056954	1056963	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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165	NC_011666	CGCGC	2	10	1082475	1082484	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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171	NC_011666	TCCCG	2	10	1098818	1098827	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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189	NC_011666	CGCGG	2	10	1191152	1191161	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
190	NC_011666	CGCGG	2	10	1192085	1192094	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
191	NC_011666	GGTGT	2	10	1193638	1193647	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
192	NC_011666	CGGTT	2	10	1200286	1200295	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
193	NC_011666	CGGCG	2	10	1212472	1212481	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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197	NC_011666	CGCCC	2	10	1253729	1253738	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
198	NC_011666	GCCGC	2	10	1256474	1256483	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
199	NC_011666	GCCGC	2	10	1259373	1259382	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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263	NC_011666	CGGCG	2	10	1715788	1715797	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
264	NC_011666	GAGCG	2	10	1722109	1722118	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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267	NC_011666	CGAGG	2	10	1728546	1728555	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
268	NC_011666	GGCCA	2	10	1728597	1728606	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
269	NC_011666	ATCGA	2	10	1728730	1728739	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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271	NC_011666	TCCGC	2	10	1729494	1729503	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
272	NC_011666	GGCGC	2	10	1735927	1735936	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
273	NC_011666	GGCGC	2	10	1736057	1736066	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
274	NC_011666	CGGCG	2	10	1751894	1751903	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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277	NC_011666	CTGCG	2	10	1767597	1767606	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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281	NC_011666	TGCGT	2	10	1802281	1802290	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
282	NC_011666	CCGCG	2	10	1803927	1803936	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
283	NC_011666	TTTCG	2	10	1806462	1806471	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
284	NC_011666	GATCA	2	10	1810649	1810658	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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286	NC_011666	GACCG	2	10	1814345	1814354	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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399	NC_011666	CGCGC	2	10	2464137	2464146	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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423	NC_011666	TGTAC	2	10	2662559	2662568	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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453	NC_011666	GCCGC	2	10	2832090	2832099	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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462	NC_011666	TCCAA	2	10	2893281	2893290	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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470	NC_011666	CTCGC	2	10	3015759	3015768	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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477	NC_011666	CGGAA	2	10	3053479	3053488	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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479	NC_011666	AGCGC	2	10	3067294	3067303	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
480	NC_011666	GCCCG	2	10	3069473	3069482	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
481	NC_011666	GCCGC	2	10	3071667	3071676	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
482	NC_011666	TTCAG	2	10	3080527	3080536	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
483	NC_011666	ACGTA	2	10	3085147	3085156	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
484	NC_011666	ACTTG	2	10	3123020	3123029	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
485	NC_011666	GGACG	2	10	3130327	3130336	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
486	NC_011666	ATTCG	2	10	3130377	3130386	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
487	NC_011666	TTCCG	2	10	3135121	3135130	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
488	NC_011666	GCCCG	2	10	3143434	3143443	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
489	NC_011666	CCGCG	2	10	3143498	3143507	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
490	NC_011666	CCTGC	2	10	3148145	3148154	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
491	NC_011666	TTTGC	2	10	3148271	3148280	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
492	NC_011666	GAGCG	2	10	3154178	3154187	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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494	NC_011666	CGCGC	2	10	3187233	3187242	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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499	NC_011666	TTTCG	2	10	3209339	3209348	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
500	NC_011666	CTTTT	2	10	3213549	3213558	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

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