MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylocella silvestris BL2 chromosome

Total Repeats: 1795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011666	GCGG	2	8	4203	4210	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011666	GGCG	2	8	4261	4268	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011666	GGCG	2	8	4522	4529	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011666	GGCG	2	8	5117	5124	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011666	GCCG	2	8	5225	5232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011666	TTCC	2	8	10438	10445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011666	TGAA	2	8	10481	10488	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011666	TCGC	2	8	10509	10516	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011666	AGCG	2	8	10570	10577	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011666	CGGC	2	8	42473	42480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011666	TATG	2	8	43297	43304	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011666	CCAG	2	8	44270	44277	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011666	AAAT	2	8	44420	44427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011666	GATC	2	8	48348	48355	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011666	GCCG	2	8	52084	52091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011666	CAAT	2	8	52105	52112	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011666	GGGA	2	8	60596	60603	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011666	AATC	2	8	60661	60668	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011666	CGAA	2	8	61610	61617	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011666	GCGG	2	8	67319	67326	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011666	ATCG	2	8	72404	72411	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011666	AAAC	2	8	72528	72535	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011666	CGTT	2	8	72585	72592	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011666	TCCG	2	8	72616	72623	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011666	CAAG	2	8	78781	78788	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011666	GATG	2	8	81329	81336	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011666	CCGC	2	8	81492	81499	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_011666	ATCG	2	8	84605	84612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011666	GCAT	2	8	84665	84672	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011666	CATC	2	8	86518	86525	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011666	GATC	2	8	86542	86549	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011666	AGCC	2	8	90598	90605	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011666	TCGT	2	8	90622	90629	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011666	CGGC	2	8	91459	91466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011666	CCGT	2	8	91490	91497	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011666	CGGC	2	8	91633	91640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011666	GATC	2	8	91691	91698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011666	CGGA	2	8	92573	92580	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011666	ATCG	2	8	97177	97184	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011666	TTGC	2	8	100213	100220	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011666	CGGG	2	8	101552	101559	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011666	CTGG	2	8	101655	101662	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011666	GGGC	2	8	103913	103920	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011666	CTTT	2	8	105683	105690	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011666	GGCC	2	8	109335	109342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011666	GGCG	2	8	112729	112736	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011666	ACAA	2	8	114925	114932	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011666	CTTT	2	8	117642	117649	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011666	GAAC	2	8	124181	124188	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011666	GCTG	2	8	130297	130304	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011666	GTTC	2	8	130376	130383	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011666	GCCG	2	8	135729	135736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011666	CGAT	2	8	139281	139288	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011666	GATC	2	8	139472	139479	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011666	TCAA	2	8	141435	141442	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011666	CCGG	2	8	141531	141538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011666	CCAG	2	8	148585	148592	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011666	CAGC	2	8	149117	149124	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011666	AGTT	2	8	149438	149445	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011666	TGAA	2	8	150447	150454	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011666	CTTG	3	12	151744	151755	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011666	CGGC	2	8	154460	154467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011666	TGCT	2	8	154542	154549	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011666	GGCG	2	8	156856	156863	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011666	TAAA	2	8	163717	163724	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011666	GGCC	2	8	163920	163927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011666	GCCG	2	8	164034	164041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011666	GGCA	2	8	173201	173208	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011666	GCGA	2	8	174939	174946	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011666	AATC	2	8	175104	175111	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_011666	ATAG	2	8	176540	176547	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011666	GATG	2	8	177804	177811	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011666	TCGG	2	8	178509	178516	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011666	GTCT	2	8	179225	179232	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_011666	CCGA	2	8	179604	179611	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011666	GCCG	2	8	179839	179846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011666	TTAT	2	8	181004	181011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011666	GCCG	2	8	181143	181150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011666	CCGG	2	8	182559	182566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_011666	ATCA	2	8	183939	183946	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011666	GAAT	2	8	184356	184363	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011666	CTGA	2	8	192271	192278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_011666	CGGC	2	8	192323	192330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011666	AATG	2	8	201682	201689	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011666	GCCC	2	8	201868	201875	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_011666	GGCG	2	8	209771	209778	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
87	NC_011666	AGGC	2	8	209779	209786	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011666	GGAA	2	8	209797	209804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011666	TCGC	2	8	211522	211529	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_011666	ATCG	2	8	214006	214013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011666	GCCG	2	8	222156	222163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_011666	GCTC	2	8	224304	224311	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_011666	GGCC	2	8	241520	241527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_011666	GCCC	2	8	241554	241561	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
95	NC_011666	CGCC	2	8	241908	241915	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_011666	CAAG	2	8	246249	246256	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011666	GCGG	2	8	249118	249125	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011666	CAAT	2	8	249179	249186	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011666	GCGG	2	8	249256	249263	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011666	CTGT	2	8	254870	254877	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011666	GCTC	2	8	264424	264431	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_011666	GCCG	2	8	264441	264448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_011666	GCCG	2	8	264650	264657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_011666	CGAT	2	8	264687	264694	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011666	GATC	2	8	265733	265740	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_011666	GAAG	2	8	282979	282986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011666	GCGA	2	8	284261	284268	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_011666	CGGG	2	8	285514	285521	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_011666	GGAG	2	8	285622	285629	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011666	CTTC	2	8	285773	285780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_011666	TCGC	2	8	285957	285964	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_011666	AGCC	2	8	287049	287056	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011666	GCCA	2	8	287353	287360	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_011666	ACCA	2	8	287432	287439	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_011666	TATT	2	8	288722	288729	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011666	CCGG	2	8	289175	289182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011666	TCGC	2	8	290937	290944	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_011666	AAAG	2	8	291034	291041	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011666	ATCA	2	8	293610	293617	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_011666	CGGC	2	8	294365	294372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_011666	GAGC	2	8	294460	294467	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_011666	GGCG	2	8	294567	294574	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011666	GGCC	2	8	294650	294657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_011666	TTTG	2	8	296637	296644	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011666	ATCC	2	8	296810	296817	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_011666	CCGG	2	8	297704	297711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011666	TCGA	2	8	297826	297833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_011666	GCCG	2	8	298331	298338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_011666	CGAG	2	8	298520	298527	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_011666	GGGC	2	8	298780	298787	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_011666	AGCC	2	8	298984	298991	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_011666	CGGT	2	8	299176	299183	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_011666	ATCG	2	8	300934	300941	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_011666	ATGA	2	8	301497	301504	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011666	GGCC	2	8	308450	308457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_011666	GTCG	2	8	308652	308659	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011666	TCTT	2	8	311243	311250	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_011666	GCCC	2	8	311589	311596	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
139	NC_011666	TAAT	2	8	312345	312352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011666	TGAA	2	8	314722	314729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011666	GGAA	2	8	316721	316728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011666	CGGG	2	8	316745	316752	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_011666	GCAA	2	8	320979	320986	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_011666	ACAG	2	8	322568	322575	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_011666	GAAC	2	8	322592	322599	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_011666	CGCA	2	8	328229	328236	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_011666	GTTG	2	8	330318	330325	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011666	CGGG	2	8	330461	330468	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
149	NC_011666	CGGC	2	8	332780	332787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_011666	CGGG	2	8	334038	334045	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
151	NC_011666	CGGC	2	8	358707	358714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_011666	AAAC	2	8	368808	368815	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_011666	CGCT	2	8	372083	372090	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_011666	GGCG	2	8	373150	373157	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
155	NC_011666	TCGG	2	8	377926	377933	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
156	NC_011666	TGCG	2	8	379258	379265	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
157	NC_011666	CCGC	2	8	384995	385002	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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172	NC_011666	TCGT	2	8	405471	405478	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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186	NC_011666	TTCG	2	8	468902	468909	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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191	NC_011666	CGGC	2	8	483209	483216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
192	NC_011666	GACT	2	8	483280	483287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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195	NC_011666	CGGG	2	8	493242	493249	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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445	NC_011666	CGCC	2	8	1088318	1088325	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
446	NC_011666	CAGA	2	8	1093109	1093116	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
447	NC_011666	CAGC	2	8	1094812	1094819	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
448	NC_011666	CGCC	2	8	1095370	1095377	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
449	NC_011666	TTCC	2	8	1095388	1095395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
450	NC_011666	GAAA	2	8	1099106	1099113	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
451	NC_011666	CTTG	2	8	1100032	1100039	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
452	NC_011666	GTCG	2	8	1105079	1105086	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
453	NC_011666	ATCC	2	8	1106963	1106970	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
454	NC_011666	ATCG	2	8	1109182	1109189	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
455	NC_011666	CGGC	2	8	1109825	1109832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
456	NC_011666	GCCG	2	8	1111771	1111778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
457	NC_011666	CCCG	2	8	1112569	1112576	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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459	NC_011666	CTTG	2	8	1116220	1116227	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
460	NC_011666	CGGC	2	8	1116499	1116506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
461	NC_011666	CTGG	2	8	1128738	1128745	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
462	NC_011666	GGCG	2	8	1131712	1131719	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
463	NC_011666	GTCG	2	8	1138677	1138684	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
464	NC_011666	GCTT	2	8	1139163	1139170	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
465	NC_011666	GCCG	2	8	1139500	1139507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
466	NC_011666	GACA	2	8	1141195	1141202	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
467	NC_011666	ACGG	2	8	1141237	1141244	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
468	NC_011666	GCAT	2	8	1141247	1141254	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
469	NC_011666	TCGC	2	8	1141403	1141410	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
470	NC_011666	GCCC	2	8	1141921	1141928	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
471	NC_011666	CCCG	2	8	1142131	1142138	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
472	NC_011666	GCCA	2	8	1144376	1144383	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
473	NC_011666	AAAT	2	8	1144398	1144405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_011666	CCGA	2	8	1144935	1144942	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
475	NC_011666	TTTG	2	8	1145014	1145021	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
476	NC_011666	GGGA	2	8	1145050	1145057	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
477	NC_011666	GGCG	2	8	1145324	1145331	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
478	NC_011666	AGCG	2	8	1150346	1150353	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
479	NC_011666	CCTG	2	8	1150385	1150392	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
480	NC_011666	ACGG	2	8	1151769	1151776	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
481	NC_011666	GCCC	2	8	1151846	1151853	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
482	NC_011666	TCGG	2	8	1154626	1154633	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
483	NC_011666	CGGG	2	8	1156254	1156261	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
484	NC_011666	TCCA	2	8	1165909	1165916	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
485	NC_011666	GCAG	2	8	1166287	1166294	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
486	NC_011666	TTGA	2	8	1183634	1183641	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
487	NC_011666	CCGC	2	8	1183863	1183870	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
488	NC_011666	GTCC	2	8	1188963	1188970	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
489	NC_011666	GCCA	2	8	1192704	1192711	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
490	NC_011666	CGAG	2	8	1200390	1200397	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
491	NC_011666	GGGC	2	8	1201982	1201989	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
492	NC_011666	GCCA	2	8	1208505	1208512	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
493	NC_011666	TGGT	2	8	1209830	1209837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
494	NC_011666	GCAA	2	8	1209867	1209874	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
495	NC_011666	GGCG	2	8	1210567	1210574	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
496	NC_011666	CGCC	2	8	1214031	1214038	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
497	NC_011666	GATT	2	8	1216645	1216652	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
498	NC_011666	CGCC	2	8	1216702	1216709	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
499	NC_011666	AATC	2	8	1223884	1223891	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
500	NC_011666	GACT	2	8	1230850	1230857	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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