MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS223 plasmid pS22301

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011664	GTTTGT	2	12	3456	3467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217975553
2	NC_011664	ACGTTT	2	12	16096	16107	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	217975563
3	NC_011664	CCCAGC	2	12	19595	19606	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	217975565
4	NC_011664	TGCACC	2	12	19756	19767	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	217975565
5	NC_011664	AGCGCA	2	12	20402	20413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217975565
6	NC_011664	GAGATC	2	12	24623	24634	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	217975567
7	NC_011664	CCGAGT	2	12	32975	32986	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011664	ATGCGC	2	12	33826	33837	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011664	GTAGCA	2	12	35104	35115	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	217975578
10	NC_011664	CGCTAT	2	12	48286	48297	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	217975594
11	NC_011664	ACCTAT	2	12	52078	52089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217975598
12	NC_011664	TTTCTA	2	12	58444	58455	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	217975603
13	NC_011664	TCAAAA	2	12	62768	62779	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	217975605
14	NC_011664	CGGGTA	2	12	62857	62868	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	217975605
15	NC_011664	TGTAGA	2	12	68215	68226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217975607
16	NC_011664	TGCGTG	2	12	74209	74220	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	217975610
17	NC_011664	ACGCTA	2	12	76047	76058	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	217975612
18	NC_011664	ACTTTT	2	12	77083	77094	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	217975613
19	NC_011664	TAAATT	2	12	78094	78105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011664	CACGTT	2	12	82990	83001	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	217975622
21	NC_011664	TCATTA	2	12	84856	84867	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_011664	CAAACT	2	12	87987	87998	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.