MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS223 plasmid pS22301

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011664	AAAGC	2	10	386	395	60 %	0 %	20 %	20 %	217975548
2	NC_011664	AAGCA	2	10	570	579	60 %	0 %	20 %	20 %	217975548
3	NC_011664	TCGAC	2	10	2639	2648	20 %	20 %	20 %	40 %	217975552
4	NC_011664	GTGAT	2	10	3325	3334	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011664	GGTCT	2	10	4745	4754	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011664	ACGTC	2	10	5142	5151	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_011664	CCACA	2	10	5153	5162	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_011664	CTTCA	2	10	5389	5398	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_011664	TTTTC	2	10	5429	5438	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011664	GTCAC	2	10	6245	6254	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_011664	TGGTC	2	10	10176	10185	0 %	40 %	40 %	20 %	217975555
12	NC_011664	AAAAG	2	10	11009	11018	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011664	AGTGA	2	10	11051	11060	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011664	GCGTT	2	10	11377	11386	0 %	40 %	40 %	20 %	217975556
15	NC_011664	CTTGG	2	10	11897	11906	0 %	40 %	40 %	20 %	217975556
16	NC_011664	ATAAA	2	10	12109	12118	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011664	ATCAT	2	10	12172	12181	40 %	40 %	0 %	20 %	217975557
18	NC_011664	CCAAG	2	10	14580	14589	40 %	0 %	20 %	40 %	217975560
19	NC_011664	ATTGT	2	10	17644	17653	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011664	TGATT	2	10	17742	17751	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011664	GATAC	2	10	18598	18607	40 %	20 %	20 %	20 %	217975565
22	NC_011664	CATCG	2	10	19476	19485	20 %	20 %	20 %	40 %	217975565
23	NC_011664	CTCCC	2	10	19828	19837	0 %	20 %	0 %	80 %	217975565
24	NC_011664	GAGAG	2	10	20904	20913	40 %	0 %	60 %	0 %	217975565
25	NC_011664	GCTGA	2	10	22277	22286	20 %	20 %	40 %	20 %	217975567
26	NC_011664	CGATG	2	10	22735	22744	20 %	20 %	40 %	20 %	217975567
27	NC_011664	GCGCA	2	10	22955	22964	20 %	0 %	40 %	40 %	217975567
28	NC_011664	GCCAA	2	10	23016	23025	40 %	0 %	20 %	40 %	217975567
29	NC_011664	ACGCT	2	10	24485	24494	20 %	20 %	20 %	40 %	217975567
30	NC_011664	AACGT	2	10	24516	24525	40 %	20 %	20 %	20 %	217975567
31	NC_011664	CACAT	2	10	25225	25234	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_011664	TCCAG	2	10	28167	28176	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_011664	TCAAA	2	10	29192	29201	60 %	20 %	0 %	20 %	217975572
34	NC_011664	AAAGC	2	10	31025	31034	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011664	CCCAG	2	10	33687	33696	20 %	0 %	20 %	60 %	217975577
36	NC_011664	TTTCA	2	10	39322	39331	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_011664	TCGTC	2	10	40811	40820	0 %	40 %	20 %	40 %	217975587
38	NC_011664	GCCAT	2	10	41216	41225	20 %	20 %	20 %	40 %	217975588
39	NC_011664	ATGCA	2	10	42212	42221	40 %	20 %	20 %	20 %	217975589
40	NC_011664	TGGCA	2	10	45523	45532	20 %	20 %	40 %	20 %	217975591
41	NC_011664	CATTT	2	10	47637	47646	20 %	60 %	0 %	20 %	217975594
42	NC_011664	GCAAA	2	10	48730	48739	60 %	0 %	20 %	20 %	217975595
43	NC_011664	CATAC	2	10	49556	49565	40 %	20 %	0 %	40 %	217975596
44	NC_011664	CGCAA	2	10	51644	51653	40 %	0 %	20 %	40 %	217975597
45	NC_011664	ACAAA	2	10	54807	54816	80 %	0 %	0 %	20 %	217975601
46	NC_011664	AACCA	2	10	58183	58192	60 %	0 %	0 %	40 %	217975603
47	NC_011664	AGCGC	2	10	59190	59199	20 %	0 %	40 %	40 %	217975603
48	NC_011664	CACGA	2	10	59437	59446	40 %	0 %	20 %	40 %	217975604
49	NC_011664	AGAGC	2	10	59801	59810	40 %	0 %	40 %	20 %	217975605
50	NC_011664	ACAGC	2	10	62063	62072	40 %	0 %	20 %	40 %	217975605
51	NC_011664	AACAG	2	10	63286	63295	60 %	0 %	20 %	20 %	217975605
52	NC_011664	AATAA	2	10	65496	65505	80 %	20 %	0 %	0 %	217975605
53	NC_011664	CTTCT	2	10	65921	65930	0 %	60 %	0 %	40 %	217975606
54	NC_011664	GCTAC	2	10	67820	67829	20 %	20 %	20 %	40 %	217975607
55	NC_011664	TGCGG	2	10	69864	69873	0 %	20 %	60 %	20 %	217975608
56	NC_011664	GCAAA	2	10	71181	71190	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_011664	TGGTT	2	10	71567	71576	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011664	TTTTG	2	10	73804	73813	0 %	80 %	20 %	0 %	217975610
59	NC_011664	TAACG	2	10	75260	75269	40 %	20 %	20 %	20 %	217975611
60	NC_011664	TGTGG	2	10	75452	75461	0 %	40 %	60 %	0 %	217975611
61	NC_011664	TTGAT	2	10	76867	76876	20 %	60 %	20 %	0 %	217975613
62	NC_011664	AGCGA	2	10	77536	77545	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_011664	CATAT	2	10	79672	79681	40 %	40 %	0 %	20 %	217975617
64	NC_011664	AGCGA	2	10	80629	80638	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_011664	TTGGC	2	10	81408	81417	0 %	40 %	40 %	20 %	217975620
66	NC_011664	ACAAG	2	10	82468	82477	60 %	0 %	20 %	20 %	217975622
67	NC_011664	TTTGG	2	10	84434	84443	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011664	AGCGA	2	10	84531	84540	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_011664	GTCAC	2	10	85486	85495	20 %	20 %	20 %	40 %	217975624
70	NC_011664	TTGCA	2	10	86434	86443	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.