MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica OS223 plasmid pS22301

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011664	AAAGC	2	10	386	395	60 %	0 %	20 %	20 %	217975548
2	NC_011664	AAGCA	2	10	570	579	60 %	0 %	20 %	20 %	217975548
3	NC_011664	TCGAC	2	10	2639	2648	20 %	20 %	20 %	40 %	217975552
4	NC_011664	TGGTC	2	10	10176	10185	0 %	40 %	40 %	20 %	217975555
5	NC_011664	GCGTT	2	10	11377	11386	0 %	40 %	40 %	20 %	217975556
6	NC_011664	CTTGG	2	10	11897	11906	0 %	40 %	40 %	20 %	217975556
7	NC_011664	ATCAT	2	10	12172	12181	40 %	40 %	0 %	20 %	217975557
8	NC_011664	CCAAG	2	10	14580	14589	40 %	0 %	20 %	40 %	217975560
9	NC_011664	GATAC	2	10	18598	18607	40 %	20 %	20 %	20 %	217975565
10	NC_011664	CATCG	2	10	19476	19485	20 %	20 %	20 %	40 %	217975565
11	NC_011664	CTCCC	2	10	19828	19837	0 %	20 %	0 %	80 %	217975565
12	NC_011664	GAGAG	2	10	20904	20913	40 %	0 %	60 %	0 %	217975565
13	NC_011664	GCTGA	2	10	22277	22286	20 %	20 %	40 %	20 %	217975567
14	NC_011664	CGATG	2	10	22735	22744	20 %	20 %	40 %	20 %	217975567
15	NC_011664	GCGCA	2	10	22955	22964	20 %	0 %	40 %	40 %	217975567
16	NC_011664	GCCAA	2	10	23016	23025	40 %	0 %	20 %	40 %	217975567
17	NC_011664	ACGCT	2	10	24485	24494	20 %	20 %	20 %	40 %	217975567
18	NC_011664	AACGT	2	10	24516	24525	40 %	20 %	20 %	20 %	217975567
19	NC_011664	TCAAA	2	10	29192	29201	60 %	20 %	0 %	20 %	217975572
20	NC_011664	CCCAG	2	10	33687	33696	20 %	0 %	20 %	60 %	217975577
21	NC_011664	TCGTC	2	10	40811	40820	0 %	40 %	20 %	40 %	217975587
22	NC_011664	GCCAT	2	10	41216	41225	20 %	20 %	20 %	40 %	217975588
23	NC_011664	ATGCA	2	10	42212	42221	40 %	20 %	20 %	20 %	217975589
24	NC_011664	TGGCA	2	10	45523	45532	20 %	20 %	40 %	20 %	217975591
25	NC_011664	CATTT	2	10	47637	47646	20 %	60 %	0 %	20 %	217975594
26	NC_011664	GCAAA	2	10	48730	48739	60 %	0 %	20 %	20 %	217975595
27	NC_011664	CATAC	2	10	49556	49565	40 %	20 %	0 %	40 %	217975596
28	NC_011664	CGCAA	2	10	51644	51653	40 %	0 %	20 %	40 %	217975597
29	NC_011664	ACAAA	2	10	54807	54816	80 %	0 %	0 %	20 %	217975601
30	NC_011664	AACCA	2	10	58183	58192	60 %	0 %	0 %	40 %	217975603
31	NC_011664	AGCGC	2	10	59190	59199	20 %	0 %	40 %	40 %	217975603
32	NC_011664	CACGA	2	10	59437	59446	40 %	0 %	20 %	40 %	217975604
33	NC_011664	AGAGC	2	10	59801	59810	40 %	0 %	40 %	20 %	217975605
34	NC_011664	ACAGC	2	10	62063	62072	40 %	0 %	20 %	40 %	217975605
35	NC_011664	AACAG	2	10	63286	63295	60 %	0 %	20 %	20 %	217975605
36	NC_011664	AATAA	2	10	65496	65505	80 %	20 %	0 %	0 %	217975605
37	NC_011664	CTTCT	2	10	65921	65930	0 %	60 %	0 %	40 %	217975606
38	NC_011664	GCTAC	2	10	67820	67829	20 %	20 %	20 %	40 %	217975607
39	NC_011664	TGCGG	2	10	69864	69873	0 %	20 %	60 %	20 %	217975608
40	NC_011664	TTTTG	2	10	73804	73813	0 %	80 %	20 %	0 %	217975610
41	NC_011664	TAACG	2	10	75260	75269	40 %	20 %	20 %	20 %	217975611
42	NC_011664	TGTGG	2	10	75452	75461	0 %	40 %	60 %	0 %	217975611
43	NC_011664	TTGAT	2	10	76867	76876	20 %	60 %	20 %	0 %	217975613
44	NC_011664	CATAT	2	10	79672	79681	40 %	40 %	0 %	20 %	217975617
45	NC_011664	TTGGC	2	10	81408	81417	0 %	40 %	40 %	20 %	217975620
46	NC_011664	ACAAG	2	10	82468	82477	60 %	0 %	20 %	20 %	217975622
47	NC_011664	GTCAC	2	10	85486	85495	20 %	20 %	20 %	40 %	217975624

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.