MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS223 plasmid pS22301

Total Repeats: 241

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011664	TCAA	2	8	112	119	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011664	AGCA	2	8	450	457	50 %	0 %	25 %	25 %	217975548
3	NC_011664	GATC	2	8	969	976	25 %	25 %	25 %	25 %	217975549
4	NC_011664	ATGG	2	8	1176	1183	25 %	25 %	50 %	0 %	217975549
5	NC_011664	CCCA	2	8	1408	1415	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_011664	GGAA	2	8	2144	2151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011664	TCAG	2	8	2192	2199	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011664	CAAC	2	8	2303	2310	50 %	0 %	0 %	50 %	217975552
9	NC_011664	AAAC	2	8	3509	3516	75 %	0 %	0 %	25 %	217975553
10	NC_011664	TCAA	2	8	3817	3824	50 %	25 %	0 %	25 %	217975553
11	NC_011664	AGCG	2	8	3836	3843	25 %	0 %	50 %	25 %	217975553
12	NC_011664	GATC	2	8	4201	4208	25 %	25 %	25 %	25 %	217975553
13	NC_011664	ACGA	2	8	6397	6404	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011664	CCTT	2	8	6425	6432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011664	TTTC	2	8	6689	6696	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011664	TTCC	2	8	6792	6799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011664	ATCA	2	8	7818	7825	50 %	25 %	0 %	25 %	217975554
18	NC_011664	AAGC	2	8	7838	7845	50 %	0 %	25 %	25 %	217975554
19	NC_011664	GGGT	2	8	7914	7921	0 %	25 %	75 %	0 %	217975554
20	NC_011664	TGAA	2	8	8199	8206	50 %	25 %	25 %	0 %	217975554
21	NC_011664	AAGA	2	8	8311	8318	75 %	0 %	25 %	0 %	217975554
22	NC_011664	ACTT	2	8	8837	8844	25 %	50 %	0 %	25 %	217975555
23	NC_011664	TGGG	2	8	9275	9282	0 %	25 %	75 %	0 %	217975555
24	NC_011664	AATA	2	8	9489	9496	75 %	25 %	0 %	0 %	217975555
25	NC_011664	AGCG	2	8	9609	9616	25 %	0 %	50 %	25 %	217975555
26	NC_011664	CAAC	2	8	9769	9776	50 %	0 %	0 %	50 %	217975555
27	NC_011664	GCAT	2	8	10375	10382	25 %	25 %	25 %	25 %	217975555
28	NC_011664	TTAG	2	8	10507	10514	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011664	GGTG	2	8	11474	11481	0 %	25 %	75 %	0 %	217975556
30	NC_011664	CAAC	2	8	11691	11698	50 %	0 %	0 %	50 %	217975556
31	NC_011664	ATAG	2	8	12354	12361	50 %	25 %	25 %	0 %	217975557
32	NC_011664	TAAT	2	8	13006	13013	50 %	50 %	0 %	0 %	217975557
33	NC_011664	CAAA	2	8	13357	13364	75 %	0 %	0 %	25 %	217975558
34	NC_011664	GAAT	2	8	13396	13403	50 %	25 %	25 %	0 %	217975558
35	NC_011664	GATT	2	8	13567	13574	25 %	50 %	25 %	0 %	217975558
36	NC_011664	TGAA	2	8	13943	13950	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011664	GTTG	2	8	14788	14795	0 %	50 %	50 %	0 %	217975560
38	NC_011664	CACC	2	8	15005	15012	25 %	0 %	0 %	75 %	217975560
39	NC_011664	TAAT	2	8	15635	15642	50 %	50 %	0 %	0 %	217975562
40	NC_011664	TAGC	2	8	15903	15910	25 %	25 %	25 %	25 %	217975563
41	NC_011664	TTCA	2	8	15925	15932	25 %	50 %	0 %	25 %	217975563
42	NC_011664	TCAA	2	8	16413	16420	50 %	25 %	0 %	25 %	217975564
43	NC_011664	CTTG	2	8	16552	16559	0 %	50 %	25 %	25 %	217975564
44	NC_011664	TCAA	2	8	16755	16762	50 %	25 %	0 %	25 %	217975564
45	NC_011664	ATCA	2	8	16826	16833	50 %	25 %	0 %	25 %	217975564
46	NC_011664	TAGC	2	8	16974	16981	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011664	CTAG	2	8	17015	17022	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011664	TAGC	2	8	17039	17046	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011664	TAGC	2	8	17063	17070	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011664	ATTA	2	8	18332	18339	50 %	50 %	0 %	0 %	217975565
51	NC_011664	ATCG	2	8	18352	18359	25 %	25 %	25 %	25 %	217975565
52	NC_011664	ACCT	2	8	19683	19690	25 %	25 %	0 %	50 %	217975565
53	NC_011664	AGCT	2	8	19800	19807	25 %	25 %	25 %	25 %	217975565
54	NC_011664	GGCA	2	8	20232	20239	25 %	0 %	50 %	25 %	217975565
55	NC_011664	TAAT	2	8	21204	21211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011664	GTCA	2	8	21595	21602	25 %	25 %	25 %	25 %	217975566
57	NC_011664	CGAG	2	8	21622	21629	25 %	0 %	50 %	25 %	217975566
58	NC_011664	AGCG	2	8	21851	21858	25 %	0 %	50 %	25 %	217975567
59	NC_011664	CAGC	2	8	22153	22160	25 %	0 %	25 %	50 %	217975567
60	NC_011664	CAAG	2	8	22477	22484	50 %	0 %	25 %	25 %	217975567
61	NC_011664	TTTG	2	8	23050	23057	0 %	75 %	25 %	0 %	217975567
62	NC_011664	TGGC	2	8	23096	23103	0 %	25 %	50 %	25 %	217975567
63	NC_011664	GGCA	2	8	23469	23476	25 %	0 %	50 %	25 %	217975567
64	NC_011664	CCAG	2	8	24295	24302	25 %	0 %	25 %	50 %	217975567
65	NC_011664	ATAG	2	8	24311	24318	50 %	25 %	25 %	0 %	217975567
66	NC_011664	AAGA	2	8	24593	24600	75 %	0 %	25 %	0 %	217975567
67	NC_011664	TAAA	2	8	24984	24991	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011664	CCTA	2	8	25334	25341	25 %	25 %	0 %	50 %	217975568
69	NC_011664	ACTG	2	8	25677	25684	25 %	25 %	25 %	25 %	217975568
70	NC_011664	TGAT	2	8	25691	25698	25 %	50 %	25 %	0 %	217975568
71	NC_011664	CAAT	2	8	26199	26206	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011664	GAAA	2	8	26252	26259	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011664	TCCA	2	8	26302	26309	25 %	25 %	0 %	50 %	217975569
74	NC_011664	TTCA	2	8	26858	26865	25 %	50 %	0 %	25 %	217975569
75	NC_011664	TAAA	2	8	26977	26984	75 %	25 %	0 %	0 %	217975569
76	NC_011664	TGTC	2	8	27300	27307	0 %	50 %	25 %	25 %	217975570
77	NC_011664	GCGA	2	8	27498	27505	25 %	0 %	50 %	25 %	217975570
78	NC_011664	AATC	2	8	27845	27852	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011664	ATTC	2	8	27986	27993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011664	GAAG	2	8	28017	28024	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011664	CCTG	2	8	28295	28302	0 %	25 %	25 %	50 %	217975571
82	NC_011664	TGAA	2	8	28801	28808	50 %	25 %	25 %	0 %	217975571
83	NC_011664	TGAG	2	8	28961	28968	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011664	TTTG	2	8	29203	29210	0 %	75 %	25 %	0 %	217975572
85	NC_011664	GCCA	2	8	29707	29714	25 %	0 %	25 %	50 %	217975572
86	NC_011664	TTGT	2	8	29972	29979	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011664	GAAG	2	8	30108	30115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011664	AAAG	2	8	30237	30244	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011664	AGCG	2	8	30413	30420	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_011664	GTTT	2	8	30620	30627	0 %	75 %	25 %	0 %	217975573
91	NC_011664	AAGC	2	8	30968	30975	50 %	0 %	25 %	25 %	217975573
92	NC_011664	TTGC	2	8	31860	31867	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011664	TGCT	2	8	33251	33258	0 %	50 %	25 %	25 %	217975576
94	NC_011664	TTTA	2	8	33999	34006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011664	TCAT	2	8	34046	34053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011664	ATTT	2	8	34253	34260	25 %	75 %	0 %	0 %	217975578
97	NC_011664	ACTA	2	8	34404	34411	50 %	25 %	0 %	25 %	217975578
98	NC_011664	ACTT	2	8	35196	35203	25 %	50 %	0 %	25 %	217975578
99	NC_011664	ATTT	2	8	35259	35266	25 %	75 %	0 %	0 %	217975578
100	NC_011664	TGCT	2	8	35330	35337	0 %	50 %	25 %	25 %	217975579
101	NC_011664	TGAC	2	8	35480	35487	25 %	25 %	25 %	25 %	217975579
102	NC_011664	GAGG	2	8	35769	35776	25 %	0 %	75 %	0 %	217975579
103	NC_011664	AACC	2	8	35880	35887	50 %	0 %	0 %	50 %	217975579
104	NC_011664	CCAT	2	8	36084	36091	25 %	25 %	0 %	50 %	217975579
105	NC_011664	CTTA	2	8	36996	37003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_011664	ATAC	2	8	37402	37409	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011664	TTAT	2	8	37524	37531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011664	AGCA	2	8	37928	37935	50 %	0 %	25 %	25 %	217975581
109	NC_011664	ATCG	2	8	38508	38515	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011664	TAAA	2	8	39070	39077	75 %	25 %	0 %	0 %	217975583
111	NC_011664	CACG	2	8	39196	39203	25 %	0 %	25 %	50 %	217975583
112	NC_011664	TAAA	2	8	39280	39287	75 %	25 %	0 %	0 %	217975583
113	NC_011664	CTAA	2	8	39345	39352	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011664	TAAT	2	8	39626	39633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011664	GATT	2	8	41134	41141	25 %	50 %	25 %	0 %	217975588
116	NC_011664	AACA	2	8	41730	41737	75 %	0 %	0 %	25 %	217975588
117	NC_011664	TGTT	2	8	41745	41752	0 %	75 %	25 %	0 %	217975588
118	NC_011664	CGGG	2	8	41757	41764	0 %	0 %	75 %	25 %	217975588
119	NC_011664	TGAT	2	8	41990	41997	25 %	50 %	25 %	0 %	217975589
120	NC_011664	AATT	2	8	43297	43304	50 %	50 %	0 %	0 %	217975589
121	NC_011664	AGTG	2	8	43388	43395	25 %	25 %	50 %	0 %	217975590
122	NC_011664	AGTC	2	8	43645	43652	25 %	25 %	25 %	25 %	217975590
123	NC_011664	CTAT	2	8	44128	44135	25 %	50 %	0 %	25 %	217975591
124	NC_011664	AATC	2	8	44519	44526	50 %	25 %	0 %	25 %	217975591
125	NC_011664	GGCA	2	8	44894	44901	25 %	0 %	50 %	25 %	217975591
126	NC_011664	CTCA	2	8	45273	45280	25 %	25 %	0 %	50 %	217975591
127	NC_011664	GCGG	2	8	46149	46156	0 %	0 %	75 %	25 %	217975591
128	NC_011664	AAGC	2	8	47355	47362	50 %	0 %	25 %	25 %	217975593
129	NC_011664	AACA	2	8	47423	47430	75 %	0 %	0 %	25 %	217975593
130	NC_011664	AGAT	2	8	47942	47949	50 %	25 %	25 %	0 %	217975594
131	NC_011664	CATT	2	8	48545	48552	25 %	50 %	0 %	25 %	217975595
132	NC_011664	TGCC	2	8	48834	48841	0 %	25 %	25 %	50 %	217975595
133	NC_011664	ACTT	2	8	49140	49147	25 %	50 %	0 %	25 %	217975595
134	NC_011664	TTAC	2	8	49967	49974	25 %	50 %	0 %	25 %	217975596
135	NC_011664	AGAC	2	8	51479	51486	50 %	0 %	25 %	25 %	217975597
136	NC_011664	GCCA	2	8	51698	51705	25 %	0 %	25 %	50 %	217975597
137	NC_011664	GTTA	2	8	51764	51771	25 %	50 %	25 %	0 %	217975597
138	NC_011664	CGCT	2	8	51796	51803	0 %	25 %	25 %	50 %	217975597
139	NC_011664	TTTC	2	8	52005	52012	0 %	75 %	0 %	25 %	217975598
140	NC_011664	TTCC	2	8	52136	52143	0 %	50 %	0 %	50 %	217975598
141	NC_011664	TGCA	2	8	52408	52415	25 %	25 %	25 %	25 %	217975599
142	NC_011664	TTGC	2	8	52430	52437	0 %	50 %	25 %	25 %	217975599
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.