MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS223 plasmid pS22301

Total Repeats: 215

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011664	AAT	2	6	185	190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011664	GGC	2	6	1259	1264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011664	CGC	2	6	1267	1272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_011664	ATG	2	6	3215	3220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011664	TTG	2	6	3313	3318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011664	TAT	2	6	3361	3366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011664	TGA	2	6	4470	4475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011664	CAT	2	6	4563	4568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011664	CCA	2	6	4727	4732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_011664	CAA	2	6	4880	4885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011664	AAC	2	6	5101	5106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011664	GCT	2	6	5253	5258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011664	TAA	2	6	5266	5271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011664	CTC	2	6	5592	5597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_011664	CTT	2	6	5613	5618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011664	GAT	2	6	5751	5756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011664	GCT	2	6	5785	5790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011664	TAA	2	6	5864	5869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011664	CAA	2	6	5964	5969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011664	TTA	2	6	6120	6125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011664	CAC	2	6	6202	6207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_011664	TTC	2	6	6440	6445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011664	TGA	2	6	6630	6635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011664	AAG	2	6	6664	6669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011664	TCA	2	6	6739	6744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011664	TTC	2	6	6922	6927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011664	GAT	2	6	7067	7072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011664	AGA	2	6	7256	7261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011664	GTT	2	6	7418	7423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011664	CGG	2	6	7437	7442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011664	TTA	2	6	7449	7454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011664	ATT	2	6	10581	10586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011664	CAT	2	6	10694	10699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011664	GAA	2	6	10832	10837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011664	GAG	2	6	10854	10859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011664	ATA	2	6	11185	11190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011664	AGA	2	6	11215	11220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011664	CTG	2	6	11227	11232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011664	TGT	2	6	12098	12103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011664	GGT	2	6	13270	13275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011664	ACC	2	6	14388	14393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_011664	TTA	2	6	15362	15367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011664	AGT	2	6	15400	15405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011664	TGA	2	6	15826	15831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011664	CAT	3	9	15839	15847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011664	TAG	2	6	17056	17061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011664	TAT	2	6	17092	17097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011664	ACT	2	6	17214	17219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011664	AGC	2	6	17252	17257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011664	TGA	2	6	17268	17273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011664	AAT	2	6	17507	17512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011664	AAT	2	6	17523	17528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011664	TAA	2	6	17607	17612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011664	ATC	2	6	17654	17659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011664	GCA	2	6	17840	17845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011664	GCT	2	6	17887	17892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011664	TCA	2	6	17926	17931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011664	CCG	2	6	18002	18007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_011664	CTT	2	6	18214	18219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011664	AAG	2	6	18287	18292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011664	TCA	2	6	21020	21025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011664	TGT	2	6	21116	21121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011664	TTC	2	6	21239	21244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011664	AGG	2	6	21262	21267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011664	CGG	2	6	24878	24883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011664	CAA	2	6	25012	25017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011664	ATC	2	6	25055	25060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011664	CAA	2	6	25138	25143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011664	ATT	2	6	25939	25944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011664	GCT	2	6	26058	26063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011664	TAA	2	6	26241	26246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011664	ACG	2	6	27692	27697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011664	TGT	2	6	27724	27729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011664	AAT	2	6	27874	27879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011664	AGC	2	6	27933	27938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011664	ATT	2	6	28182	28187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011664	TTA	2	6	28940	28945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011664	TTA	2	6	30053	30058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011664	ACT	2	6	30066	30071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011664	TGA	2	6	30136	30141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011664	CAT	2	6	30149	30154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011664	GAC	2	6	30187	30192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011664	ATG	2	6	30222	30227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011664	CTG	2	6	30228	30233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011664	GAC	2	6	30441	30446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011664	CGA	2	6	31042	31047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011664	CTT	2	6	31875	31880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011664	AAC	2	6	31973	31978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011664	CGA	2	6	32925	32930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011664	TGC	2	6	32949	32954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011664	GCA	2	6	32987	32992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011664	CAA	2	6	33314	33319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011664	CAA	2	6	34176	34181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011664	TCC	2	6	36531	36536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_011664	AAT	2	6	36540	36545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011664	TAC	2	6	36600	36605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011664	AAC	2	6	36653	36658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011664	ATT	2	6	37075	37080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011664	TTC	2	6	37096	37101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011664	TAA	2	6	37303	37308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011664	TAA	2	6	37321	37326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011664	TAA	2	6	37392	37397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011664	GCC	2	6	37551	37556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_011664	GAT	2	6	38344	38349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011664	TGC	2	6	38401	38406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011664	AAT	2	6	38426	38431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011664	ACC	2	6	38613	38618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_011664	GTA	2	6	38664	38669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011664	TCA	2	6	38722	38727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011664	CTT	2	6	38875	38880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011664	AGG	2	6	38920	38925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011664	ATA	2	6	38942	38947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011664	ACC	2	6	38963	38968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_011664	TTA	2	6	39372	39377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011664	CGC	2	6	39382	39387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_011664	ATG	2	6	40355	40360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011664	AAC	2	6	66031	66036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011664	ATA	2	6	66141	66146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011664	TAT	2	6	66212	66217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011664	TTA	2	6	66219	66224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011664	AAC	2	6	66330	66335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011664	ATT	2	6	66425	66430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011664	AGT	2	6	66719	66724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011664	CAA	2	6	66731	66736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011664	GCG	2	6	66799	66804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011664	GTG	2	6	66811	66816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011664	ATT	2	6	67009	67014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011664	CCT	2	6	67046	67051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_011664	TAG	2	6	67157	67162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011664	AAG	2	6	67284	67289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011664	ATG	2	6	67353	67358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011664	GAA	2	6	67426	67431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011664	TAT	2	6	67475	67480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011664	TAT	2	6	68369	68374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011664	TTG	2	6	68451	68456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011664	TCA	2	6	68536	68541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011664	GCA	2	6	68613	68618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011664	CTA	2	6	68794	68799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011664	GAA	2	6	68825	68830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011664	TAT	2	6	68914	68919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011664	CTT	2	6	70449	70454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.