MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS223 plasmid pS22301

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011664	TG	3	6	878	883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011664	CG	3	6	2575	2580	0 %	0 %	50 %	50 %	217975552
3	NC_011664	GA	3	6	3984	3989	50 %	0 %	50 %	0 %	217975553
4	NC_011664	AT	3	6	4600	4605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011664	AT	3	6	4652	4657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011664	AT	3	6	4978	4983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011664	AG	3	6	5558	5563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011664	TC	3	6	6655	6660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011664	TG	3	6	7505	7510	0 %	50 %	50 %	0 %	217975554
10	NC_011664	AT	5	10	9197	9206	50 %	50 %	0 %	0 %	217975555
11	NC_011664	TA	3	6	9888	9893	50 %	50 %	0 %	0 %	217975555
12	NC_011664	CT	3	6	10888	10893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011664	CT	3	6	12151	12156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011664	CT	3	6	13023	13028	0 %	50 %	0 %	50 %	217975557
15	NC_011664	AT	3	6	13927	13932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011664	AT	3	6	17389	17394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011664	AT	3	6	18298	18303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011664	GC	3	6	18993	18998	0 %	0 %	50 %	50 %	217975565
19	NC_011664	TG	3	6	19305	19310	0 %	50 %	50 %	0 %	217975565
20	NC_011664	GA	3	6	19886	19891	50 %	0 %	50 %	0 %	217975565
21	NC_011664	CT	3	6	20590	20595	0 %	50 %	0 %	50 %	217975565
22	NC_011664	AG	3	6	22517	22522	50 %	0 %	50 %	0 %	217975567
23	NC_011664	TC	3	6	22590	22595	0 %	50 %	0 %	50 %	217975567
24	NC_011664	AC	3	6	23507	23512	50 %	0 %	0 %	50 %	217975567
25	NC_011664	GC	3	6	23975	23980	0 %	0 %	50 %	50 %	217975567
26	NC_011664	TG	3	6	24257	24262	0 %	50 %	50 %	0 %	217975567
27	NC_011664	TA	3	6	25250	25255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011664	CT	4	8	26062	26069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011664	TC	4	8	26076	26083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011664	TA	3	6	26107	26112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011664	AC	3	6	26732	26737	50 %	0 %	0 %	50 %	217975569
32	NC_011664	AG	3	6	27026	27031	50 %	0 %	50 %	0 %	217975570
33	NC_011664	CT	3	6	29441	29446	0 %	50 %	0 %	50 %	217975572
34	NC_011664	CA	3	6	30522	30527	50 %	0 %	0 %	50 %	217975573
35	NC_011664	CT	3	6	30748	30753	0 %	50 %	0 %	50 %	217975573
36	NC_011664	AG	3	6	30901	30906	50 %	0 %	50 %	0 %	217975573
37	NC_011664	TA	4	8	31307	31314	50 %	50 %	0 %	0 %	217975574
38	NC_011664	AT	3	6	31499	31504	50 %	50 %	0 %	0 %	217975574
39	NC_011664	TC	3	6	32026	32031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011664	AG	4	8	32185	32192	50 %	0 %	50 %	0 %	217975575
41	NC_011664	AT	3	6	32193	32198	50 %	50 %	0 %	0 %	217975575
42	NC_011664	AT	3	6	32271	32276	50 %	50 %	0 %	0 %	217975575
43	NC_011664	TA	3	6	33991	33996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011664	GT	3	6	34603	34608	0 %	50 %	50 %	0 %	217975578
45	NC_011664	AT	3	6	34868	34873	50 %	50 %	0 %	0 %	217975578
46	NC_011664	TC	3	6	34948	34953	0 %	50 %	0 %	50 %	217975578
47	NC_011664	AG	3	6	35835	35840	50 %	0 %	50 %	0 %	217975579
48	NC_011664	AG	3	6	36928	36933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011664	TA	3	6	37049	37054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011664	AG	3	6	37472	37477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011664	GC	3	6	38120	38125	0 %	0 %	50 %	50 %	217975581
52	NC_011664	AC	3	6	38623	38628	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011664	AT	3	6	39652	39657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011664	AC	3	6	40444	40449	50 %	0 %	0 %	50 %	217975587
55	NC_011664	CG	3	6	40857	40862	0 %	0 %	50 %	50 %	217975587
56	NC_011664	GC	3	6	40995	41000	0 %	0 %	50 %	50 %	217975588
57	NC_011664	GC	3	6	41195	41200	0 %	0 %	50 %	50 %	217975588
58	NC_011664	CA	3	6	44478	44483	50 %	0 %	0 %	50 %	217975591
59	NC_011664	TG	3	6	45831	45836	0 %	50 %	50 %	0 %	217975591
60	NC_011664	CG	3	6	46195	46200	0 %	0 %	50 %	50 %	217975591
61	NC_011664	CG	3	6	46442	46447	0 %	0 %	50 %	50 %	217975592
62	NC_011664	CG	3	6	47068	47073	0 %	0 %	50 %	50 %	217975593
63	NC_011664	CA	3	6	47221	47226	50 %	0 %	0 %	50 %	217975593
64	NC_011664	GC	3	6	47283	47288	0 %	0 %	50 %	50 %	217975593
65	NC_011664	CG	3	6	47726	47731	0 %	0 %	50 %	50 %	217975594
66	NC_011664	CA	3	6	48665	48670	50 %	0 %	0 %	50 %	217975595
67	NC_011664	GT	3	6	50734	50739	0 %	50 %	50 %	0 %	217975596
68	NC_011664	CG	3	6	50781	50786	0 %	0 %	50 %	50 %	217975596
69	NC_011664	CG	3	6	50806	50811	0 %	0 %	50 %	50 %	217975596
70	NC_011664	CG	3	6	51069	51074	0 %	0 %	50 %	50 %	217975597
71	NC_011664	GC	3	6	51542	51547	0 %	0 %	50 %	50 %	217975597
72	NC_011664	TC	3	6	51814	51819	0 %	50 %	0 %	50 %	217975597
73	NC_011664	CA	3	6	53044	53049	50 %	0 %	0 %	50 %	217975600
74	NC_011664	GC	3	6	53285	53290	0 %	0 %	50 %	50 %	217975600
75	NC_011664	GC	3	6	54856	54861	0 %	0 %	50 %	50 %	217975601
76	NC_011664	CG	3	6	55263	55268	0 %	0 %	50 %	50 %	217975601
77	NC_011664	TA	3	6	55783	55788	50 %	50 %	0 %	0 %	217975601
78	NC_011664	AG	3	6	56206	56211	50 %	0 %	50 %	0 %	217975601
79	NC_011664	TG	3	6	57643	57648	0 %	50 %	50 %	0 %	217975603
80	NC_011664	TC	3	6	57663	57668	0 %	50 %	0 %	50 %	217975603
81	NC_011664	TG	3	6	58032	58037	0 %	50 %	50 %	0 %	217975603
82	NC_011664	GC	3	6	58079	58084	0 %	0 %	50 %	50 %	217975603
83	NC_011664	CG	3	6	59628	59633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011664	GC	4	8	60251	60258	0 %	0 %	50 %	50 %	217975605
85	NC_011664	CG	3	6	60708	60713	0 %	0 %	50 %	50 %	217975605
86	NC_011664	AG	3	6	60926	60931	50 %	0 %	50 %	0 %	217975605
87	NC_011664	CA	6	12	61239	61250	50 %	0 %	0 %	50 %	217975605
88	NC_011664	AC	3	6	61577	61582	50 %	0 %	0 %	50 %	217975605
89	NC_011664	AT	3	6	62236	62241	50 %	50 %	0 %	0 %	217975605
90	NC_011664	GC	3	6	62611	62616	0 %	0 %	50 %	50 %	217975605
91	NC_011664	AC	3	6	62926	62931	50 %	0 %	0 %	50 %	217975605
92	NC_011664	AC	3	6	62973	62978	50 %	0 %	0 %	50 %	217975605
93	NC_011664	GC	5	10	63163	63172	0 %	0 %	50 %	50 %	217975605
94	NC_011664	CA	3	6	64041	64046	50 %	0 %	0 %	50 %	217975605
95	NC_011664	GC	3	6	64184	64189	0 %	0 %	50 %	50 %	217975605
96	NC_011664	GC	4	8	64761	64768	0 %	0 %	50 %	50 %	217975605
97	NC_011664	AT	3	6	65622	65627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011664	GT	3	6	65778	65783	0 %	50 %	50 %	0 %	217975606
99	NC_011664	CG	3	6	65892	65897	0 %	0 %	50 %	50 %	217975606
100	NC_011664	TA	3	6	66648	66653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011664	TA	3	6	67072	67077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011664	AT	3	6	68312	68317	50 %	50 %	0 %	0 %	217975607
103	NC_011664	GA	3	6	68782	68787	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011664	AT	3	6	69301	69306	50 %	50 %	0 %	0 %	217975608
105	NC_011664	GA	3	6	69328	69333	50 %	0 %	50 %	0 %	217975608
106	NC_011664	CG	3	6	69633	69638	0 %	0 %	50 %	50 %	217975608
107	NC_011664	TG	3	6	70106	70111	0 %	50 %	50 %	0 %	217975608
108	NC_011664	CA	3	6	71532	71537	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_011664	CG	3	6	73058	73063	0 %	0 %	50 %	50 %	217975610
110	NC_011664	GT	4	8	74446	74453	0 %	50 %	50 %	0 %	217975611
111	NC_011664	AG	3	6	75230	75235	50 %	0 %	50 %	0 %	217975611
112	NC_011664	TA	3	6	76107	76112	50 %	50 %	0 %	0 %	217975612
113	NC_011664	AC	3	6	76993	76998	50 %	0 %	0 %	50 %	217975613
114	NC_011664	GT	3	6	77197	77202	0 %	50 %	50 %	0 %	217975613
115	NC_011664	GC	3	6	77288	77293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_011664	TG	3	6	78470	78475	0 %	50 %	50 %	0 %	217975615
117	NC_011664	CG	3	6	78653	78658	0 %	0 %	50 %	50 %	217975616
118	NC_011664	TG	3	6	78752	78757	0 %	50 %	50 %	0 %	217975616
119	NC_011664	CT	3	6	79328	79333	0 %	50 %	0 %	50 %	217975617
120	NC_011664	GT	3	6	80291	80296	0 %	50 %	50 %	0 %	217975618
121	NC_011664	GC	3	6	80381	80386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_011664	AC	3	6	82207	82212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011664	AC	3	6	82217	82222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_011664	CG	3	6	83234	83239	0 %	0 %	50 %	50 %	217975622
125	NC_011664	GC	3	6	83702	83707	0 %	0 %	50 %	50 %	217975622
126	NC_011664	GC	3	6	84257	84262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011664	TC	3	6	84651	84656	0 %	50 %	0 %	50 %	217975623
128	NC_011664	TC	3	6	85896	85901	0 %	50 %	0 %	50 %	217975624
129	NC_011664	CT	3	6	87142	87147	0 %	50 %	0 %	50 %	217975626
130	NC_011664	AT	3	6	87194	87199	50 %	50 %	0 %	0 %	217975626
131	NC_011664	GA	3	6	87206	87211	50 %	0 %	50 %	0 %	217975626
132	NC_011664	AT	3	6	87241	87246	50 %	50 %	0 %	0 %	217975626
133	NC_011664	TA	3	6	87911	87916	50 %	50 %	0 %	0 %	217975626

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.