MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Thauera sp. MZ1T chromosome

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011662	TTTCAT	2	12	26750	26761	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_011662	CACCTT	2	12	36407	36418	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011662	CCGAAC	2	12	58976	58987	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011662	CACCCG	2	12	68708	68719	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_011662	CCGGCA	2	12	109830	109841	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011662	AGCCGC	2	12	109842	109853	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011662	GCGCCC	2	12	121118	121129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_011662	CGCCGG	2	12	209853	209864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011662	GGCCGG	2	12	228703	228714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011662	CGGGGC	2	12	228738	228749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011662	CGGGCG	2	12	270079	270090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011662	AGCGCC	2	12	279705	279716	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011662	GGCAGG	2	12	298538	298549	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_011662	TGCGGG	5	30	379976	380005	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011662	GTCACC	2	12	402611	402622	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011662	GCCCGC	2	12	414837	414848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_011662	TGCAGG	2	12	429308	429319	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_011662	CCTCGA	2	12	474904	474915	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011662	CCTCGA	2	12	475300	475311	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011662	GGAGAC	2	12	484383	484394	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_011662	CCCGCA	2	12	511409	511420	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_011662	GCGCAC	2	12	516251	516262	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011662	CGGGAT	2	12	524538	524549	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_011662	GTCCGC	2	12	538758	538769	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011662	CCCGCA	2	12	539445	539456	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_011662	CCGCGA	2	12	577410	577421	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011662	CGCCCA	2	12	588004	588015	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_011662	TCGTGT	2	12	588641	588652	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_011662	TCCGCG	2	12	590818	590829	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011662	TGCGCC	2	12	594713	594724	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011662	AACGCA	2	12	604849	604860	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011662	TCCACC	2	12	610007	610018	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_011662	CGGGGG	2	12	616107	616118	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_011662	GCGCGG	2	12	622591	622602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011662	GTGGTT	2	12	643713	643724	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011662	GCGGCC	2	12	668641	668652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011662	GGCGCA	2	12	693373	693384	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011662	CCGCGC	2	12	720155	720166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_011662	CACGGA	2	12	721178	721189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011662	TGGGGG	2	12	740500	740511	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011662	TGCTGT	2	12	785234	785245	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_011662	ACGTTA	2	12	815442	815453	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_011662	TCCCCC	2	12	815976	815987	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
44	NC_011662	CACCGG	2	12	819784	819795	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011662	GCGCCT	2	12	834834	834845	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011662	GAGGCA	2	12	844737	844748	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_011662	GGCCTG	2	12	855507	855518	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011662	GGCCGG	2	12	855746	855757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011662	GATGAC	2	12	861908	861919	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_011662	CGGTGG	2	12	938382	938393	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_011662	TGCGCC	2	12	950703	950714	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011662	GAAACC	2	12	1036885	1036896	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011662	GCATCG	2	12	1094830	1094841	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011662	ACTGCA	2	12	1100822	1100833	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011662	GCTGGT	2	12	1106493	1106504	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_011662	CCTGAT	2	12	1122551	1122562	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011662	TGCGAA	2	12	1139714	1139725	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_011662	CAATTT	2	12	1153399	1153410	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_011662	CCGAAC	2	12	1181174	1181185	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011662	CCGCAA	2	12	1181956	1181967	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011662	GAAAAA	2	12	1188092	1188103	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011662	CGCAGC	2	12	1198461	1198472	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011662	CGGTGG	2	12	1215685	1215696	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_011662	CGCCCA	2	12	1220461	1220472	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_011662	CAAAAC	2	12	1220521	1220532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011662	CAAAGC	2	12	1224427	1224438	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011662	TGTGGG	2	12	1256400	1256411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011662	CGGCCG	2	12	1324641	1324652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_011662	CGGATG	2	12	1328058	1328069	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_011662	AAAAGG	2	12	1359831	1359842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011662	CGTGCC	2	12	1365716	1365727	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_011662	CGTTCG	2	12	1399622	1399633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011662	GTTGGG	2	12	1410801	1410812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011662	GGCGAG	2	12	1447395	1447406	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_011662	CCTGCT	2	12	1448987	1448998	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011662	CGGTGG	2	12	1458622	1458633	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_011662	GGGGAG	2	12	1487001	1487012	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011662	CCTGAC	2	12	1564482	1564493	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011662	GCTTTT	2	12	1564518	1564529	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_011662	CGGAAG	2	12	1610472	1610483	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_011662	GCAGGC	2	12	1619495	1619506	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011662	CCGCGA	2	12	1664507	1664518	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011662	GGGCGA	2	12	1674347	1674358	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_011662	AGGGGG	2	12	1705384	1705395	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011662	GGTAGG	2	12	1752305	1752316	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011662	CGTCGC	2	12	1766297	1766308	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011662	GCCCGT	2	12	1784828	1784839	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011662	CGCAGG	2	12	1785702	1785713	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011662	GGCATC	2	12	1786020	1786031	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011662	TCGCCG	2	12	1792258	1792269	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_011662	ATGCGC	2	12	1792825	1792836	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011662	ATGCGG	2	12	1794603	1794614	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_011662	GCGCGT	2	12	1862848	1862859	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011662	TGTGGA	2	12	1897132	1897143	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011662	GCGCAG	2	12	1913598	1913609	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011662	TGGTGC	2	12	1922002	1922013	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_011662	CAATAA	2	12	1962733	1962744	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_011662	CAGAAC	2	12	1989800	1989811	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011662	ACGTTA	2	12	2013317	2013328	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_011662	GGGGGC	2	12	2059571	2059582	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_011662	CGTGTG	2	12	2064842	2064853	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_011662	CAGCGG	2	12	2165050	2165061	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011662	GCGGGC	2	12	2197208	2197219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011662	GGCACA	2	12	2290386	2290397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011662	CGCGGG	2	12	2317332	2317343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011662	CACCGA	2	12	2325519	2325530	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_011662	CGTCCC	2	12	2452139	2452150	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_011662	GCCGGA	2	12	2452152	2452163	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011662	TGATCG	2	12	2518287	2518298	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_011662	GCGCGA	2	12	2521763	2521774	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011662	CGGCCG	2	12	2539199	2539210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_011662	GACCGC	2	12	2543792	2543803	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011662	TGCGGG	2	12	2543805	2543816	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_011662	CGAACA	2	12	2548659	2548670	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011662	GAAATG	2	12	2563614	2563625	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011662	GCACCG	2	12	2623506	2623517	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011662	CGCAGC	2	12	2643720	2643731	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
118	NC_011662	GCACGA	2	12	2651552	2651563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011662	CCCGCG	2	12	2651672	2651683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_011662	ACGTCG	2	12	2663215	2663226	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011662	CCTGCC	2	12	2699052	2699063	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_011662	CCCTCC	2	12	2707604	2707615	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
123	NC_011662	GCACGC	2	12	2711862	2711873	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
124	NC_011662	CGCCTC	2	12	2721557	2721568	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_011662	CGTCCG	2	12	2722510	2722521	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
126	NC_011662	CGCGCA	2	12	2746859	2746870	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011662	CCGTCA	2	12	2746877	2746888	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_011662	CCGGGA	2	12	2902088	2902099	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011662	AGGTCG	2	12	2949882	2949893	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_011662	TGCCCG	2	12	2993777	2993788	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_011662	GGGATC	2	12	3002755	3002766	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_011662	CAAAAA	2	12	3027065	3027076	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_011662	CTTCGA	2	12	3042468	3042479	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011662	CACGCC	2	12	3044008	3044019	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_011662	GCCCGC	2	12	3050371	3050382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_011662	TACGTA	2	12	3071963	3071974	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_011662	TGCGGG	5	30	3098501	3098530	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_011662	CGGCAG	2	12	3221227	3221238	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011662	AACGTC	2	12	3242519	3242530	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011662	CGCGGG	2	12	3299052	3299063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_011662	GCCTAC	2	12	3331671	3331682	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
142	NC_011662	CGGAGG	2	12	3391193	3391204	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_011662	GCCTGG	2	12	3418352	3418363	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_011662	CATGGC	2	12	3422326	3422337	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_011662	TGGCGG	2	12	3424467	3424478	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_011662	CCGCAC	6	36	3452378	3452413	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_011662	CGGGCA	2	12	3518726	3518737	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_011662	CGCCCG	2	12	3564737	3564748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_011662	GCCTTG	2	12	3626004	3626015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_011662	GAGGTT	2	12	3671172	3671183	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011662	CCTTGC	2	12	3671219	3671230	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
152	NC_011662	GCCCCA	2	12	3671544	3671555	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_011662	CGCGCC	2	12	3690297	3690308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_011662	TTCGTT	2	12	3724274	3724285	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_011662	CTGCCG	2	12	3777508	3777519	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
156	NC_011662	GCTTGC	2	12	3816928	3816939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_011662	TGTTCC	2	12	3886431	3886442	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_011662	CCGCGC	2	12	3902488	3902499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_011662	TTCGGG	2	12	3918231	3918242	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_011662	AGCCGA	2	12	3932982	3932993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_011662	TGCGGC	2	12	3937743	3937754	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_011662	CGGCCG	2	12	3941721	3941732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
163	NC_011662	CCGCGC	2	12	3959258	3959269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
164	NC_011662	CGCGGC	2	12	3964278	3964289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
165	NC_011662	ACGCCG	2	12	4039148	4039159	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
166	NC_011662	CCACGC	2	12	4105329	4105340	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
167	NC_011662	AGGCCA	2	12	4105347	4105358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_011662	ACCGGC	2	12	4105403	4105414	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
169	NC_011662	CGCTGC	2	12	4105431	4105442	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
170	NC_011662	CACCCG	2	12	4105465	4105476	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
171	NC_011662	CAGAAG	2	12	4105945	4105956	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
172	NC_011662	ACCCGC	2	12	4107226	4107237	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
173	NC_011662	CGCGCC	2	12	4261222	4261233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
174	NC_011662	CGCGCA	2	12	4288114	4288125	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
175	NC_011662	CCGCGC	2	12	4310758	4310769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
176	NC_011662	GCCCCC	2	12	4323161	4323172	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
177	NC_011662	CGCCCC	2	12	4364357	4364368	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
178	NC_011662	GGGGTC	2	12	4387354	4387365	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
179	NC_011662	TGGGGT	2	12	4430727	4430738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
180	NC_011662	TTTGCG	2	12	4435237	4435248	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
181	NC_011662	GAGTCG	2	12	4435553	4435564	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.