MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 1834

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011660	ACGAT	2	10	3449	3458	40 %	20 %	20 %	20 %	217963306
2	NC_011660	TGGCG	2	10	4134	4143	0 %	20 %	60 %	20 %	217963307
3	NC_011660	GAAAA	2	10	12707	12716	80 %	0 %	20 %	0 %	217963315
4	NC_011660	AAAAT	2	10	13108	13117	80 %	20 %	0 %	0 %	217963315
5	NC_011660	AAGAT	2	10	13417	13426	60 %	20 %	20 %	0 %	217963315
6	NC_011660	AACAA	2	10	14906	14915	80 %	0 %	0 %	20 %	217963315
7	NC_011660	GAAAA	2	10	15436	15445	80 %	0 %	20 %	0 %	217963316
8	NC_011660	AAAAC	2	10	16292	16301	80 %	0 %	0 %	20 %	217963316
9	NC_011660	TGAAT	2	10	19242	19251	40 %	40 %	20 %	0 %	217963319
10	NC_011660	ATTTT	2	10	21814	21823	20 %	80 %	0 %	0 %	217963322
11	NC_011660	GAAAA	2	10	23561	23570	80 %	0 %	20 %	0 %	217963325
12	NC_011660	TGGAA	2	10	24786	24795	40 %	20 %	40 %	0 %	217963327
13	NC_011660	TACAA	2	10	24909	24918	60 %	20 %	0 %	20 %	217963327
14	NC_011660	CCAAG	2	10	26204	26213	40 %	0 %	20 %	40 %	217963328
15	NC_011660	AGCAA	2	10	27396	27405	60 %	0 %	20 %	20 %	217963330
16	NC_011660	GAGAG	2	10	27626	27635	40 %	0 %	60 %	0 %	217963330
17	NC_011660	ATTAT	2	10	28862	28871	40 %	60 %	0 %	0 %	217963331
18	NC_011660	TTAAA	2	10	29496	29505	60 %	40 %	0 %	0 %	217963333
19	NC_011660	CCGTT	2	10	31124	31133	0 %	40 %	20 %	40 %	217963335
20	NC_011660	AATCA	2	10	31355	31364	60 %	20 %	0 %	20 %	217963335
21	NC_011660	ATCGT	2	10	31921	31930	20 %	40 %	20 %	20 %	217963335
22	NC_011660	ATTTT	2	10	32532	32541	20 %	80 %	0 %	0 %	217963336
23	NC_011660	CAACA	2	10	33946	33955	60 %	0 %	0 %	40 %	217963337
24	NC_011660	AAACA	2	10	34600	34609	80 %	0 %	0 %	20 %	217963337
25	NC_011660	GCGCT	2	10	34951	34960	0 %	20 %	40 %	40 %	217963337
26	NC_011660	TGCTT	2	10	35258	35267	0 %	60 %	20 %	20 %	217963338
27	NC_011660	CAACC	2	10	35294	35303	40 %	0 %	0 %	60 %	217963338
28	NC_011660	AATGC	2	10	40091	40100	40 %	20 %	20 %	20 %	217963342
29	NC_011660	TAAAG	2	10	40594	40603	60 %	20 %	20 %	0 %	217963342
30	NC_011660	ATCGA	2	10	43607	43616	40 %	20 %	20 %	20 %	217963345
31	NC_011660	AAGAA	2	10	45380	45389	80 %	0 %	20 %	0 %	217963346
32	NC_011660	ACGAA	2	10	47605	47614	60 %	0 %	20 %	20 %	217963349
33	NC_011660	CTTCA	2	10	50025	50034	20 %	40 %	0 %	40 %	217963352
34	NC_011660	AAAAG	2	10	50773	50782	80 %	0 %	20 %	0 %	217963353
35	NC_011660	ATCAA	2	10	52769	52778	60 %	20 %	0 %	20 %	217963355
36	NC_011660	CCATT	2	10	55335	55344	20 %	40 %	0 %	40 %	217963357
37	NC_011660	ATCTT	2	10	57268	57277	20 %	60 %	0 %	20 %	217963359
38	NC_011660	TATGG	2	10	58618	58627	20 %	40 %	40 %	0 %	217963361
39	NC_011660	AACAA	2	10	60818	60827	80 %	0 %	0 %	20 %	217963365
40	NC_011660	TGAAA	2	10	64066	64075	60 %	20 %	20 %	0 %	217963368
41	NC_011660	TGGTT	2	10	66990	66999	0 %	60 %	40 %	0 %	217963371
42	NC_011660	TTAAG	2	10	73839	73848	40 %	40 %	20 %	0 %	217963380
43	NC_011660	GTTTT	2	10	74586	74595	0 %	80 %	20 %	0 %	217963380
44	NC_011660	TGGAC	2	10	76658	76667	20 %	20 %	40 %	20 %	217963383
45	NC_011660	ATAAA	2	10	77631	77640	80 %	20 %	0 %	0 %	217963384
46	NC_011660	CAAAA	2	10	77849	77858	80 %	0 %	0 %	20 %	217963384
47	NC_011660	ATAAA	2	10	78023	78032	80 %	20 %	0 %	0 %	217963384
48	NC_011660	GGTGG	2	10	79258	79267	0 %	20 %	80 %	0 %	217963385
49	NC_011660	AGAAA	2	10	80451	80460	80 %	0 %	20 %	0 %	217963387
50	NC_011660	AACAA	2	10	80790	80799	80 %	0 %	0 %	20 %	217963387
51	NC_011660	TGGCA	2	10	82864	82873	20 %	20 %	40 %	20 %	217963388
52	NC_011660	CGATG	2	10	83365	83374	20 %	20 %	40 %	20 %	217963388
53	NC_011660	AAAAC	2	10	84650	84659	80 %	0 %	0 %	20 %	217963389
54	NC_011660	ATTTG	2	10	86441	86450	20 %	60 %	20 %	0 %	217963391
55	NC_011660	TGCAA	2	10	88212	88221	40 %	20 %	20 %	20 %	217963393
56	NC_011660	ACAAA	2	10	88372	88381	80 %	0 %	0 %	20 %	217963393
57	NC_011660	ATTTA	2	10	90934	90943	40 %	60 %	0 %	0 %	217963395
58	NC_011660	GTTAC	2	10	93471	93480	20 %	40 %	20 %	20 %	217963397
59	NC_011660	TAAAA	2	10	97074	97083	80 %	20 %	0 %	0 %	217963399
60	NC_011660	AAAAG	2	10	97186	97195	80 %	0 %	20 %	0 %	217963400
61	NC_011660	TAGAT	2	10	100277	100286	40 %	40 %	20 %	0 %	217963403
62	NC_011660	TACTG	2	10	100877	100886	20 %	40 %	20 %	20 %	217963404
63	NC_011660	AAAGT	2	10	100960	100969	60 %	20 %	20 %	0 %	217963404
64	NC_011660	TTCAT	2	10	101134	101143	20 %	60 %	0 %	20 %	217963404
65	NC_011660	GCTTT	2	10	103124	103133	0 %	60 %	20 %	20 %	217963408
66	NC_011660	GTGAT	2	10	103934	103943	20 %	40 %	40 %	0 %	217963409
67	NC_011660	ATGAA	2	10	105422	105431	60 %	20 %	20 %	0 %	217963409
68	NC_011660	TGGAA	2	10	114636	114645	40 %	20 %	40 %	0 %	217963418
69	NC_011660	CGGTG	2	10	114861	114870	0 %	20 %	60 %	20 %	217963418
70	NC_011660	TATGA	2	10	118157	118166	40 %	40 %	20 %	0 %	217963421
71	NC_011660	TCGAT	2	10	121817	121826	20 %	40 %	20 %	20 %	217963424
72	NC_011660	GAAAC	2	10	122495	122504	60 %	0 %	20 %	20 %	217963425
73	NC_011660	TGATT	2	10	123028	123037	20 %	60 %	20 %	0 %	217963425
74	NC_011660	AACAA	2	10	128307	128316	80 %	0 %	0 %	20 %	217963430
75	NC_011660	AGCAA	2	10	131239	131248	60 %	0 %	20 %	20 %	217963434
76	NC_011660	AATGA	2	10	131332	131341	60 %	20 %	20 %	0 %	217963434
77	NC_011660	TTTAG	2	10	132685	132694	20 %	60 %	20 %	0 %	217963435
78	NC_011660	ACACT	2	10	134781	134790	40 %	20 %	0 %	40 %	217963436
79	NC_011660	AAATT	2	10	139549	139558	60 %	40 %	0 %	0 %	217963440
80	NC_011660	TAAAA	2	10	140998	141007	80 %	20 %	0 %	0 %	217963441
81	NC_011660	GACGT	2	10	141461	141470	20 %	20 %	40 %	20 %	217963442
82	NC_011660	TGAAA	2	10	141936	141945	60 %	20 %	20 %	0 %	217963442
83	NC_011660	TCAAA	2	10	143834	143843	60 %	20 %	0 %	20 %	217963443
84	NC_011660	AACCG	2	10	144688	144697	40 %	0 %	20 %	40 %	217963445
85	NC_011660	GTCGC	2	10	144769	144778	0 %	20 %	40 %	40 %	217963445
86	NC_011660	TTTCT	2	10	145058	145067	0 %	80 %	0 %	20 %	217963445
87	NC_011660	CTAAA	2	10	147085	147094	60 %	20 %	0 %	20 %	217963448
88	NC_011660	GAGCG	2	10	147185	147194	20 %	0 %	60 %	20 %	217963448
89	NC_011660	GTCAT	2	10	147256	147265	20 %	40 %	20 %	20 %	217963448
90	NC_011660	GCCGT	2	10	149191	149200	0 %	20 %	40 %	40 %	217963449
91	NC_011660	GAAAC	2	10	149631	149640	60 %	0 %	20 %	20 %	217963449
92	NC_011660	GAAAT	2	10	150870	150879	60 %	20 %	20 %	0 %	217963451
93	NC_011660	AGTTT	2	10	151611	151620	20 %	60 %	20 %	0 %	217963452
94	NC_011660	TGGAA	2	10	155390	155399	40 %	20 %	40 %	0 %	217963453
95	NC_011660	TCAGT	2	10	158795	158804	20 %	40 %	20 %	20 %	217963454
96	NC_011660	GGACA	2	10	159416	159425	40 %	0 %	40 %	20 %	217963454
97	NC_011660	GGGTT	2	10	160096	160105	0 %	40 %	60 %	0 %	217963455
98	NC_011660	AAGTG	2	10	160272	160281	40 %	20 %	40 %	0 %	217963455
99	NC_011660	CAGAA	2	10	160500	160509	60 %	0 %	20 %	20 %	217963455
100	NC_011660	GCATT	2	10	161894	161903	20 %	40 %	20 %	20 %	217963456
101	NC_011660	AAAAT	2	10	162080	162089	80 %	20 %	0 %	0 %	217963456
102	NC_011660	TAAAA	2	10	163221	163230	80 %	20 %	0 %	0 %	217963457
103	NC_011660	ATTTA	2	10	163810	163819	40 %	60 %	0 %	0 %	217963458
104	NC_011660	TATGG	2	10	167627	167636	20 %	40 %	40 %	0 %	217963464
105	NC_011660	AACGA	2	10	169785	169794	60 %	0 %	20 %	20 %	217963466
106	NC_011660	GGTTC	2	10	172952	172961	0 %	40 %	40 %	20 %	217963470
107	NC_011660	TGGTA	2	10	174515	174524	20 %	40 %	40 %	0 %	217963472
108	NC_011660	ATTTT	2	10	174808	174817	20 %	80 %	0 %	0 %	217963472
109	NC_011660	GGAAA	2	10	175129	175138	60 %	0 %	40 %	0 %	217963472
110	NC_011660	TGTCG	2	10	175380	175389	0 %	40 %	40 %	20 %	217963473
111	NC_011660	TAAAA	2	10	176398	176407	80 %	20 %	0 %	0 %	217963473
112	NC_011660	GTTAT	2	10	177014	177023	20 %	60 %	20 %	0 %	217963475
113	NC_011660	ATTTT	2	10	179331	179340	20 %	80 %	0 %	0 %	217963478
114	NC_011660	AGTTT	2	10	183041	183050	20 %	60 %	20 %	0 %	217963483
115	NC_011660	AGAAA	2	10	183721	183730	80 %	0 %	20 %	0 %	217963483
116	NC_011660	ATTTC	2	10	183948	183957	20 %	60 %	0 %	20 %	217963484
117	NC_011660	GAAGT	2	10	184332	184341	40 %	20 %	40 %	0 %	217963484
118	NC_011660	TTTGT	2	10	184505	184514	0 %	80 %	20 %	0 %	217963484
119	NC_011660	AAATG	2	10	185858	185867	60 %	20 %	20 %	0 %	217963485
120	NC_011660	AATGG	2	10	189935	189944	40 %	20 %	40 %	0 %	217963489
121	NC_011660	ACGTA	2	10	190144	190153	40 %	20 %	20 %	20 %	217963489
122	NC_011660	AGTTT	2	10	192523	192532	20 %	60 %	20 %	0 %	217963492
123	NC_011660	ATGGA	2	10	195754	195763	40 %	20 %	40 %	0 %	217963496
124	NC_011660	ATTAT	2	10	197121	197130	40 %	60 %	0 %	0 %	217963497
125	NC_011660	CTTTA	2	10	197522	197531	20 %	60 %	0 %	20 %	217963498
126	NC_011660	CATCA	2	10	197672	197681	40 %	20 %	0 %	40 %	217963498
127	NC_011660	GTTTT	2	10	198581	198590	0 %	80 %	20 %	0 %	217963500
128	NC_011660	AAGTT	2	10	200253	200262	40 %	40 %	20 %	0 %	217963500
129	NC_011660	GTTTG	2	10	200690	200699	0 %	60 %	40 %	0 %	217963500
130	NC_011660	TTTAC	2	10	203493	203502	20 %	60 %	0 %	20 %	217963504
131	NC_011660	CTTTT	2	10	206305	206314	0 %	80 %	0 %	20 %	217963506
132	NC_011660	TCAAT	2	10	208186	208195	40 %	40 %	0 %	20 %	217963508
133	NC_011660	ATTTT	2	10	208281	208290	20 %	80 %	0 %	0 %	217963508
134	NC_011660	CATTC	2	10	210350	210359	20 %	40 %	0 %	40 %	217963511
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