MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 1186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011660	AAGG	2	8	57	64	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011660	ATTT	2	8	3713	3720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011660	CTTA	2	8	3802	3809	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011660	TAAG	2	8	4040	4047	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011660	TTAT	2	8	12392	12399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011660	AATA	2	8	12597	12604	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011660	ATTA	2	8	12661	12668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011660	GAAA	2	8	25818	25825	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011660	ATCA	2	8	26630	26637	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011660	TAAA	2	8	32432	32439	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011660	AGAT	2	8	33024	33031	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011660	GTCT	2	8	33054	33061	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011660	AGGA	2	8	33352	33359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011660	AGTT	2	8	35622	35629	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011660	TAAA	2	8	36870	36877	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011660	ACAA	2	8	37082	37089	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011660	TGTT	2	8	38135	38142	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011660	GAGG	2	8	38222	38229	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011660	TAGT	2	8	39324	39331	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011660	TATT	2	8	44259	44266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011660	AGAA	2	8	45577	45584	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011660	CTTG	2	8	46032	46039	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011660	TGTA	2	8	46381	46388	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011660	ACGA	2	8	46389	46396	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011660	TGCT	2	8	54220	54227	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011660	GAAA	2	8	57982	57989	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011660	GTTG	2	8	58058	58065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011660	AGAT	2	8	58111	58118	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011660	ATGG	2	8	58161	58168	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011660	GAAA	2	8	58368	58375	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011660	AAAG	2	8	58387	58394	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011660	ATCT	2	8	58859	58866	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011660	GAAG	2	8	59823	59830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011660	AAAG	2	8	68994	69001	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011660	GGTG	2	8	76173	76180	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011660	TAAA	2	8	80251	80258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011660	GTAA	2	8	83749	83756	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011660	ATGG	2	8	84823	84830	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011660	TCAG	2	8	85772	85779	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011660	AAAG	2	8	92086	92093	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011660	AATG	2	8	92105	92112	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011660	TGTA	2	8	92164	92171	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011660	TATT	2	8	92240	92247	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011660	GAAA	2	8	95976	95983	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011660	AGTA	2	8	101933	101940	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011660	CAAA	2	8	108458	108465	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011660	AAGC	2	8	108551	108558	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011660	AAGG	2	8	111145	111152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011660	GAAA	2	8	111795	111802	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011660	TGAA	2	8	119751	119758	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011660	AGTT	2	8	125594	125601	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011660	TAAA	2	8	129534	129541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011660	TGAA	2	8	129910	129917	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011660	ATGA	2	8	130431	130438	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011660	AATA	2	8	142579	142586	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011660	TTGA	2	8	143968	143975	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011660	AAAC	2	8	146032	146039	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011660	TGAA	2	8	146360	146367	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011660	ACCA	2	8	146553	146560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011660	TACA	2	8	151484	151491	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_011660	AATA	2	8	161561	161568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011660	AATG	2	8	161641	161648	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011660	ATTA	2	8	161787	161794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011660	TTAA	2	8	163279	163286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011660	TTTC	2	8	163356	163363	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011660	AATT	2	8	166978	166985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011660	AGAA	2	8	173845	173852	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011660	ACCA	2	8	175199	175206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_011660	TGAA	2	8	176447	176454	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011660	GGAG	2	8	176541	176548	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011660	TTTC	2	8	180687	180694	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011660	TAAG	2	8	180941	180948	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011660	GAAG	2	8	181158	181165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011660	TTTA	2	8	190534	190541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011660	TTTC	2	8	190560	190567	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011660	AATA	2	8	195553	195560	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011660	TGTA	2	8	197908	197915	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011660	TTGG	2	8	201079	201086	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011660	TGGA	2	8	201437	201444	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011660	TTTG	2	8	201508	201515	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011660	TGGA	2	8	201586	201593	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011660	GCAT	2	8	201663	201670	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_011660	CAAA	2	8	201705	201712	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011660	ACAA	2	8	209130	209137	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011660	ATTT	2	8	218599	218606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011660	AATA	2	8	218616	218623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011660	TGTT	2	8	218658	218665	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011660	CATA	2	8	218843	218850	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011660	TTAA	2	8	218972	218979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011660	AAAG	2	8	224763	224770	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011660	TAGT	2	8	226571	226578	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011660	TATT	2	8	226589	226596	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011660	TGAT	2	8	227087	227094	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011660	GTTT	2	8	228535	228542	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011660	TTTA	2	8	229412	229419	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011660	CGAA	2	8	229767	229774	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011660	CCTG	2	8	229834	229841	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_011660	AGCC	2	8	231169	231176	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_011660	TTTC	2	8	231463	231470	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011660	ATAA	2	8	231484	231491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011660	AAGG	2	8	231926	231933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011660	AGAA	2	8	231974	231981	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011660	AAAG	2	8	232077	232084	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011660	TACT	2	8	232516	232523	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011660	CACG	2	8	232537	232544	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_011660	AGTG	2	8	233276	233283	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011660	GGAA	2	8	233330	233337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011660	TAGG	2	8	233905	233912	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011660	ATGG	2	8	234088	234095	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011660	ATCG	2	8	234666	234673	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011660	CCTG	2	8	234950	234957	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_011660	TGCC	2	8	235425	235432	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011660	TTGA	2	8	235508	235515	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011660	TAAT	2	8	236104	236111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011660	TGAA	2	8	236447	236454	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011660	TAAA	2	8	236582	236589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011660	TAAA	2	8	236748	236755	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011660	AAAT	2	8	236903	236910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011660	GATA	2	8	239034	239041	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011660	TTAA	2	8	243599	243606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011660	TTGT	2	8	243668	243675	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011660	TTGT	2	8	244055	244062	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011660	TAAT	2	8	244106	244113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011660	ATTA	2	8	245139	245146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011660	CATT	2	8	245267	245274	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_011660	AGAA	2	8	245883	245890	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011660	AAGT	2	8	258027	258034	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011660	GAGG	2	8	259988	259995	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011660	AAAG	2	8	265621	265628	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011660	AAAT	2	8	267772	267779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011660	TGAA	2	8	269647	269654	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011660	ATGA	2	8	269692	269699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011660	TGAA	2	8	269723	269730	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011660	GAAA	2	8	269744	269751	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011660	TGGA	2	8	269770	269777	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011660	TTCT	2	8	273418	273425	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011660	TTTA	2	8	273851	273858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011660	AGTT	2	8	274570	274577	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011660	TAAA	2	8	275080	275087	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011660	TATT	2	8	288426	288433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011660	TCAT	2	8	288631	288638	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_011660	AATA	2	8	297268	297275	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011660	ATCC	2	8	301000	301007	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_011660	TAAT	2	8	301019	301026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011660	ATTT	2	8	301541	301548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011660	AATG	2	8	305310	305317	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011660	GAAT	2	8	307459	307466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011660	GATA	2	8	310609	310616	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011660	ATAA	2	8	312930	312937	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011660	CTAT	2	8	312951	312958	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_011660	TCCC	2	8	313066	313073	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
152	NC_011660	TATG	2	8	314001	314008	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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