MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 7809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011660	GGAA	2	8	649	656	50 %	0 %	50 %	0 %	217963304
2	NC_011660	ATGT	2	8	708	715	25 %	50 %	25 %	0 %	217963304
3	NC_011660	GATT	2	8	748	755	25 %	50 %	25 %	0 %	217963304
4	NC_011660	AGAA	2	8	879	886	75 %	0 %	25 %	0 %	217963304
5	NC_011660	TAAA	2	8	1096	1103	75 %	25 %	0 %	0 %	217963304
6	NC_011660	TTTA	2	8	1494	1501	25 %	75 %	0 %	0 %	217963305
7	NC_011660	TTAC	2	8	1567	1574	25 %	50 %	0 %	25 %	217963305
8	NC_011660	TTTC	2	8	1858	1865	0 %	75 %	0 %	25 %	217963305
9	NC_011660	GCTC	2	8	1892	1899	0 %	25 %	25 %	50 %	217963305
10	NC_011660	TTTG	2	8	1990	1997	0 %	75 %	25 %	0 %	217963305
11	NC_011660	TCAG	2	8	2160	2167	25 %	25 %	25 %	25 %	217963305
12	NC_011660	TGCG	2	8	2606	2613	0 %	25 %	50 %	25 %	217963305
13	NC_011660	TTGA	2	8	2834	2841	25 %	50 %	25 %	0 %	217963306
14	NC_011660	ATGT	2	8	4254	4261	25 %	50 %	25 %	0 %	217963307
15	NC_011660	GATT	2	8	4608	4615	25 %	50 %	25 %	0 %	217963307
16	NC_011660	GTTG	2	8	4912	4919	0 %	50 %	50 %	0 %	217963307
17	NC_011660	TTGG	2	8	5018	5025	0 %	50 %	50 %	0 %	217963307
18	NC_011660	TTTG	2	8	5530	5537	0 %	75 %	25 %	0 %	217963307
19	NC_011660	TATG	2	8	6048	6055	25 %	50 %	25 %	0 %	217963307
20	NC_011660	TCGT	2	8	6719	6726	0 %	50 %	25 %	25 %	217963307
21	NC_011660	AAAC	2	8	6886	6893	75 %	0 %	0 %	25 %	217963307
22	NC_011660	GCGA	2	8	8828	8835	25 %	0 %	50 %	25 %	217963310
23	NC_011660	CGGA	2	8	8959	8966	25 %	0 %	50 %	25 %	217963310
24	NC_011660	AATT	2	8	8982	8989	50 %	50 %	0 %	0 %	217963310
25	NC_011660	GAAG	2	8	9276	9283	50 %	0 %	50 %	0 %	217963311
26	NC_011660	CATC	2	8	9650	9657	25 %	25 %	0 %	50 %	217963311
27	NC_011660	TAAG	2	8	10322	10329	50 %	25 %	25 %	0 %	217963311
28	NC_011660	TTTG	2	8	10680	10687	0 %	75 %	25 %	0 %	217963312
29	NC_011660	TCAA	2	8	11396	11403	50 %	25 %	0 %	25 %	217963312
30	NC_011660	GAAA	2	8	12038	12045	75 %	0 %	25 %	0 %	217963313
31	NC_011660	ATGA	2	8	12153	12160	50 %	25 %	25 %	0 %	217963313
32	NC_011660	ACGA	2	8	12286	12293	50 %	0 %	25 %	25 %	217963313
33	NC_011660	TTGG	2	8	13159	13166	0 %	50 %	50 %	0 %	217963315
34	NC_011660	TGGT	2	8	13370	13377	0 %	50 %	50 %	0 %	217963315
35	NC_011660	AACC	2	8	13543	13550	50 %	0 %	0 %	50 %	217963315
36	NC_011660	TGGT	2	8	13790	13797	0 %	50 %	50 %	0 %	217963315
37	NC_011660	TGCC	2	8	13846	13853	0 %	25 %	25 %	50 %	217963315
38	NC_011660	TGGT	2	8	14000	14007	0 %	50 %	50 %	0 %	217963315
39	NC_011660	TGGT	2	8	14627	14634	0 %	50 %	50 %	0 %	217963315
40	NC_011660	ACAA	2	8	14673	14680	75 %	0 %	0 %	25 %	217963315
41	NC_011660	ATAA	2	8	15019	15026	75 %	25 %	0 %	0 %	217963315
42	NC_011660	GATT	2	8	15715	15722	25 %	50 %	25 %	0 %	217963316
43	NC_011660	CTAT	2	8	16119	16126	25 %	50 %	0 %	25 %	217963316
44	NC_011660	TGAA	2	8	16968	16975	50 %	25 %	25 %	0 %	217963316
45	NC_011660	TCGG	2	8	17597	17604	0 %	25 %	50 %	25 %	217963317
46	NC_011660	GAAC	2	8	17729	17736	50 %	0 %	25 %	25 %	217963317
47	NC_011660	TGTT	2	8	18051	18058	0 %	75 %	25 %	0 %	217963318
48	NC_011660	GTTT	2	8	18137	18144	0 %	75 %	25 %	0 %	217963318
49	NC_011660	CCAT	2	8	18341	18348	25 %	25 %	0 %	50 %	217963318
50	NC_011660	AGTC	2	8	18375	18382	25 %	25 %	25 %	25 %	217963318
51	NC_011660	ATTC	2	8	18546	18553	25 %	50 %	0 %	25 %	217963318
52	NC_011660	AGAA	2	8	18685	18692	75 %	0 %	25 %	0 %	217963318
53	NC_011660	ACCA	2	8	19209	19216	50 %	0 %	0 %	50 %	217963319
54	NC_011660	ATGA	2	8	19444	19451	50 %	25 %	25 %	0 %	217963319
55	NC_011660	TTAG	2	8	20451	20458	25 %	50 %	25 %	0 %	217963320
56	NC_011660	GGAA	2	8	20498	20505	50 %	0 %	50 %	0 %	217963320
57	NC_011660	GAAG	2	8	20564	20571	50 %	0 %	50 %	0 %	217963320
58	NC_011660	ACCA	2	8	21235	21242	50 %	0 %	0 %	50 %	217963322
59	NC_011660	TTTA	2	8	21401	21408	25 %	75 %	0 %	0 %	217963322
60	NC_011660	ATCA	2	8	21753	21760	50 %	25 %	0 %	25 %	217963322
61	NC_011660	TGAA	2	8	21784	21791	50 %	25 %	25 %	0 %	217963322
62	NC_011660	CTCG	2	8	21976	21983	0 %	25 %	25 %	50 %	217963322
63	NC_011660	CTTT	2	8	22302	22309	0 %	75 %	0 %	25 %	217963323
64	NC_011660	GACG	2	8	22335	22342	25 %	0 %	50 %	25 %	217963323
65	NC_011660	TTTA	2	8	23214	23221	25 %	75 %	0 %	0 %	217963324
66	NC_011660	AATC	2	8	24311	24318	50 %	25 %	0 %	25 %	217963327
67	NC_011660	GAAA	2	8	25268	25275	75 %	0 %	25 %	0 %	217963327
68	NC_011660	CAAA	2	8	25331	25338	75 %	0 %	0 %	25 %	217963327
69	NC_011660	AACA	2	8	25511	25518	75 %	0 %	0 %	25 %	217963327
70	NC_011660	TCGG	2	8	26908	26915	0 %	25 %	50 %	25 %	217963330
71	NC_011660	GAAA	2	8	27213	27220	75 %	0 %	25 %	0 %	217963330
72	NC_011660	ATTT	2	8	27322	27329	25 %	75 %	0 %	0 %	217963330
73	NC_011660	GAGT	2	8	28198	28205	25 %	25 %	50 %	0 %	217963331
74	NC_011660	ATGC	2	8	28290	28297	25 %	25 %	25 %	25 %	217963331
75	NC_011660	TGAT	2	8	28699	28706	25 %	50 %	25 %	0 %	217963331
76	NC_011660	AGAA	2	8	28916	28923	75 %	0 %	25 %	0 %	217963331
77	NC_011660	CATT	2	8	28944	28951	25 %	50 %	0 %	25 %	217963331
78	NC_011660	CTAA	2	8	29120	29127	50 %	25 %	0 %	25 %	217963332
79	NC_011660	CTTT	2	8	29130	29137	0 %	75 %	0 %	25 %	217963332
80	NC_011660	TTGG	2	8	29463	29470	0 %	50 %	50 %	0 %	217963333
81	NC_011660	AGTA	2	8	29548	29555	50 %	25 %	25 %	0 %	217963333
82	NC_011660	CCAA	2	8	29996	30003	50 %	0 %	0 %	50 %	217963334
83	NC_011660	GATG	2	8	30051	30058	25 %	25 %	50 %	0 %	217963334
84	NC_011660	GAAT	2	8	30433	30440	50 %	25 %	25 %	0 %	217963334
85	NC_011660	GGTT	2	8	30500	30507	0 %	50 %	50 %	0 %	217963335
86	NC_011660	AATT	2	8	30667	30674	50 %	50 %	0 %	0 %	217963335
87	NC_011660	TTTA	2	8	30712	30719	25 %	75 %	0 %	0 %	217963335
88	NC_011660	GAAA	2	8	32551	32558	75 %	0 %	25 %	0 %	217963336
89	NC_011660	TAAA	2	8	33622	33629	75 %	25 %	0 %	0 %	217963337
90	NC_011660	GATT	2	8	34358	34365	25 %	50 %	25 %	0 %	217963337
91	NC_011660	TAAA	2	8	34489	34496	75 %	25 %	0 %	0 %	217963337
92	NC_011660	CCAA	2	8	35055	35062	50 %	0 %	0 %	50 %	217963338
93	NC_011660	TTTG	2	8	35755	35762	0 %	75 %	25 %	0 %	217963339
94	NC_011660	CCAA	2	8	35792	35799	50 %	0 %	0 %	50 %	217963339
95	NC_011660	ATTA	2	8	36047	36054	50 %	50 %	0 %	0 %	217963339
96	NC_011660	CGAA	2	8	36275	36282	50 %	0 %	25 %	25 %	217963339
97	NC_011660	AGCG	2	8	36301	36308	25 %	0 %	50 %	25 %	217963339
98	NC_011660	TGGA	2	8	36347	36354	25 %	25 %	50 %	0 %	217963339
99	NC_011660	ATGA	2	8	36382	36389	50 %	25 %	25 %	0 %	217963339
100	NC_011660	ATGA	2	8	36464	36471	50 %	25 %	25 %	0 %	217963339
101	NC_011660	GATT	2	8	36707	36714	25 %	50 %	25 %	0 %	217963339
102	NC_011660	GCTT	2	8	37634	37641	0 %	50 %	25 %	25 %	217963340
103	NC_011660	GCAC	2	8	37914	37921	25 %	0 %	25 %	50 %	217963340
104	NC_011660	GACA	2	8	38257	38264	50 %	0 %	25 %	25 %	217963341
105	NC_011660	GAAA	2	8	38821	38828	75 %	0 %	25 %	0 %	217963341
106	NC_011660	GAAT	2	8	39636	39643	50 %	25 %	25 %	0 %	217963342
107	NC_011660	TACC	2	8	39760	39767	25 %	25 %	0 %	50 %	217963342
108	NC_011660	ATGT	2	8	39773	39780	25 %	50 %	25 %	0 %	217963342
109	NC_011660	TTTG	2	8	40267	40274	0 %	75 %	25 %	0 %	217963342
110	NC_011660	TACA	2	8	40540	40547	50 %	25 %	0 %	25 %	217963342
111	NC_011660	TTTG	2	8	41274	41281	0 %	75 %	25 %	0 %	217963343
112	NC_011660	GGCG	2	8	41282	41289	0 %	0 %	75 %	25 %	217963343
113	NC_011660	AATG	2	8	41393	41400	50 %	25 %	25 %	0 %	217963343
114	NC_011660	AGTG	2	8	41722	41729	25 %	25 %	50 %	0 %	217963344
115	NC_011660	TTTA	2	8	41885	41892	25 %	75 %	0 %	0 %	217963344
116	NC_011660	ATTG	2	8	42412	42419	25 %	50 %	25 %	0 %	217963344
117	NC_011660	ATTT	2	8	43345	43352	25 %	75 %	0 %	0 %	217963345
118	NC_011660	ATTT	2	8	43381	43388	25 %	75 %	0 %	0 %	217963345
119	NC_011660	CCCA	2	8	43681	43688	25 %	0 %	0 %	75 %	217963345
120	NC_011660	AATT	2	8	44395	44402	50 %	50 %	0 %	0 %	217963346
121	NC_011660	GAAA	2	8	44606	44613	75 %	0 %	25 %	0 %	217963346
122	NC_011660	AAAG	2	8	44676	44683	75 %	0 %	25 %	0 %	217963346
123	NC_011660	GATT	2	8	44768	44775	25 %	50 %	25 %	0 %	217963346
124	NC_011660	ATTG	2	8	44894	44901	25 %	50 %	25 %	0 %	217963346
125	NC_011660	TTCT	2	8	45859	45866	0 %	75 %	0 %	25 %	217963347
126	NC_011660	TTAT	2	8	45925	45932	25 %	75 %	0 %	0 %	217963347
127	NC_011660	GGTA	2	8	46640	46647	25 %	25 %	50 %	0 %	217963349
128	NC_011660	AAAG	2	8	46718	46725	75 %	0 %	25 %	0 %	217963349
129	NC_011660	AAAC	2	8	47362	47369	75 %	0 %	0 %	25 %	217963349
130	NC_011660	CCTT	2	8	47683	47690	0 %	50 %	0 %	50 %	217963349
131	NC_011660	GGAA	2	8	47962	47969	50 %	0 %	50 %	0 %	217963350
132	NC_011660	GAAG	2	8	49780	49787	50 %	0 %	50 %	0 %	217963351
133	NC_011660	TGGA	2	8	51702	51709	25 %	25 %	50 %	0 %	217963354
134	NC_011660	CATT	2	8	52742	52749	25 %	50 %	0 %	25 %	217963355
135	NC_011660	CTAT	2	8	52780	52787	25 %	50 %	0 %	25 %	217963355
136	NC_011660	CGCC	2	8	52943	52950	0 %	0 %	25 %	75 %	217963355
137	NC_011660	TCCT	2	8	53038	53045	0 %	50 %	0 %	50 %	217963355
138	NC_011660	ATTG	2	8	53292	53299	25 %	50 %	25 %	0 %	217963355
139	NC_011660	ACAA	2	8	53385	53392	75 %	0 %	0 %	25 %	217963355
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