MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 38348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011660	GAA	2	6	254	259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963304
2	NC_011660	ATT	2	6	267	272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963304
3	NC_011660	ATT	2	6	370	375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963304
4	NC_011660	GAA	2	6	470	475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963304
5	NC_011660	ATT	3	9	501	509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963304
6	NC_011660	GAT	2	6	560	565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963304
7	NC_011660	TGA	3	9	566	574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963304
8	NC_011660	GTT	2	6	632	637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963304
9	NC_011660	GGC	2	6	701	706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963304
10	NC_011660	GGA	2	6	914	919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217963304
11	NC_011660	TGA	2	6	950	955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963304
12	NC_011660	TTG	2	6	994	999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963304
13	NC_011660	AAT	2	6	1011	1016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963304
14	NC_011660	TGT	2	6	1051	1056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963304
15	NC_011660	ACA	2	6	1064	1069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963304
16	NC_011660	TAA	2	6	1131	1136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963304
17	NC_011660	CAG	2	6	1244	1249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963305
18	NC_011660	TAG	2	6	1284	1289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963305
19	NC_011660	TAG	2	6	1298	1303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963305
20	NC_011660	ATT	2	6	1312	1317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963305
21	NC_011660	GAT	2	6	1368	1373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963305
22	NC_011660	GAT	2	6	1378	1383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963305
23	NC_011660	CAG	2	6	1394	1399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963305
24	NC_011660	GAC	2	6	1416	1421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963305
25	NC_011660	ATT	2	6	1534	1539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963305
26	NC_011660	AGC	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963305
27	NC_011660	ATG	2	6	1609	1614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963305
28	NC_011660	TCT	2	6	1631	1636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963305
29	NC_011660	TAT	2	6	1760	1765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963305
30	NC_011660	CAG	2	6	1916	1921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963305
31	NC_011660	ATG	2	6	1925	1930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963305
32	NC_011660	TTG	2	6	1964	1969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963305
33	NC_011660	GAT	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963305
34	NC_011660	ATT	2	6	2191	2196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963305
35	NC_011660	TAT	2	6	2223	2228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963305
36	NC_011660	GTA	2	6	2338	2343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963305
37	NC_011660	TTC	2	6	2359	2364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963305
38	NC_011660	GAT	2	6	2379	2384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963305
39	NC_011660	CGG	2	6	2441	2446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963305
40	NC_011660	ATA	2	6	2450	2455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963305
41	NC_011660	CGG	2	6	2486	2491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217963305
42	NC_011660	TTA	2	6	2495	2500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963305
43	NC_011660	ATA	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963305
44	NC_011660	GTG	2	6	2951	2956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963306
45	NC_011660	TGA	2	6	2959	2964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963306
46	NC_011660	AAT	2	6	3053	3058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963306
47	NC_011660	GCT	2	6	3135	3140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963306
48	NC_011660	CTT	2	6	3274	3279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963306
49	NC_011660	TAA	2	6	3328	3333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963306
50	NC_011660	TCT	2	6	3345	3350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963306
51	NC_011660	TAA	2	6	3443	3448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963306
52	NC_011660	AGT	2	6	3591	3596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963306
53	NC_011660	TGG	2	6	4151	4156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963307
54	NC_011660	GCA	2	6	4292	4297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963307
55	NC_011660	ATA	3	9	4412	4420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963307
56	NC_011660	ATA	2	6	4439	4444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963307
57	NC_011660	CAA	2	6	4579	4584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963307
58	NC_011660	GAT	3	9	4645	4653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963307
59	NC_011660	GAT	2	6	4788	4793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963307
60	NC_011660	AGC	2	6	4854	4859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963307
61	NC_011660	GAA	2	6	4878	4883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963307
62	NC_011660	TTC	2	6	5181	5186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963307
63	NC_011660	AAC	2	6	5190	5195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963307
64	NC_011660	AAT	2	6	5248	5253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963307
65	NC_011660	ATT	2	6	5368	5373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963307
66	NC_011660	AGA	2	6	5432	5437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963307
67	NC_011660	TTG	2	6	5739	5744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963307
68	NC_011660	CTT	2	6	5806	5811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217963307
69	NC_011660	ATA	2	6	5864	5869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963307
70	NC_011660	ATG	2	6	5936	5941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963307
71	NC_011660	GAA	2	6	5959	5964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963307
72	NC_011660	TGT	2	6	6177	6182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963307
73	NC_011660	AAG	2	6	6209	6214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963307
74	NC_011660	TGG	2	6	6292	6297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963307
75	NC_011660	ATT	2	6	6298	6303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963307
76	NC_011660	AAG	2	6	6305	6310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963307
77	NC_011660	GAA	2	6	6326	6331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963307
78	NC_011660	ATC	2	6	6347	6352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963307
79	NC_011660	GAA	2	6	6484	6489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963307
80	NC_011660	GAA	2	6	6559	6564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963307
81	NC_011660	AAT	2	6	6580	6585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963307
82	NC_011660	AGA	2	6	7011	7016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963307
83	NC_011660	TGG	2	6	7050	7055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963307
84	NC_011660	GTG	2	6	7067	7072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963307
85	NC_011660	GGA	2	6	7079	7084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217963307
86	NC_011660	GAA	2	6	7137	7142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963308
87	NC_011660	TAG	2	6	7210	7215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963308
88	NC_011660	TAA	2	6	7340	7345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217963308
89	NC_011660	TGC	2	6	7421	7426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963308
90	NC_011660	GAT	2	6	7478	7483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963308
91	NC_011660	AAG	2	6	7543	7548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963308
92	NC_011660	CGT	2	6	7657	7662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963309
93	NC_011660	CAT	2	6	7812	7817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963309
94	NC_011660	ATC	2	6	7849	7854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963309
95	NC_011660	AAC	2	6	8022	8027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963309
96	NC_011660	TCA	2	6	8079	8084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963309
97	NC_011660	CAG	2	6	8120	8125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963309
98	NC_011660	CAG	2	6	8136	8141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963309
99	NC_011660	ATT	2	6	8224	8229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963309
100	NC_011660	ATT	2	6	8287	8292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963309
101	NC_011660	GAA	2	6	8335	8340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963309
102	NC_011660	GTG	2	6	8369	8374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963309
103	NC_011660	TAG	3	9	8475	8483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963310
104	NC_011660	ATG	2	6	8484	8489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963310
105	NC_011660	TGA	2	6	8619	8624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963310
106	NC_011660	TTA	2	6	8688	8693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963310
107	NC_011660	GAT	2	6	8750	8755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963310
108	NC_011660	AGA	2	6	8779	8784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963310
109	NC_011660	ATG	2	6	9012	9017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963310
110	NC_011660	TGA	2	6	9067	9072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963310
111	NC_011660	GGA	2	6	9124	9129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217963310
112	NC_011660	GTT	2	6	9160	9165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963311
113	NC_011660	GTC	2	6	9175	9180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963311
114	NC_011660	AGT	2	6	9190	9195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963311
115	NC_011660	TTA	2	6	9222	9227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963311
116	NC_011660	ACG	2	6	9251	9256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217963311
117	NC_011660	CAA	2	6	9286	9291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963311
118	NC_011660	TGG	2	6	9399	9404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963311
119	NC_011660	TCA	2	6	9500	9505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963311
120	NC_011660	ATG	2	6	9521	9526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963311
121	NC_011660	AAC	2	6	9566	9571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963311
122	NC_011660	AAC	2	6	9599	9604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963311
123	NC_011660	GAT	2	6	9633	9638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963311
124	NC_011660	ACA	2	6	9988	9993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963311
125	NC_011660	ACT	2	6	10017	10022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217963311
126	NC_011660	CAC	2	6	10238	10243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217963311
127	NC_011660	GAA	2	6	10273	10278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963311
128	NC_011660	TTG	2	6	10292	10297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217963311
129	NC_011660	GAA	2	6	10387	10392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963311
130	NC_011660	TTA	2	6	10752	10757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963312
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250	NC_011660	AAC	2	6	19290	19295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963319
251	NC_011660	CAA	2	6	19514	19519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217963319
252	NC_011660	ATG	2	6	19541	19546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217963319
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254	NC_011660	TGG	2	6	19644	19649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963319
255	NC_011660	AAG	2	6	19667	19672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217963319
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257	NC_011660	ATT	2	6	19919	19924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217963320
258	NC_011660	TGG	2	6	19970	19975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217963320
259	NC_011660	GCT	2	6	19997	20002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	217963320
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