MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 3554

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011660	TA	3	6	666	671	50 %	50 %	0 %	0 %	217963304
2	NC_011660	GA	3	6	820	825	50 %	0 %	50 %	0 %	217963304
3	NC_011660	GC	3	6	907	912	0 %	0 %	50 %	50 %	217963304
4	NC_011660	TG	3	6	1113	1118	0 %	50 %	50 %	0 %	217963304
5	NC_011660	TA	3	6	2126	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	217963305
6	NC_011660	CT	3	6	3876	3881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011660	GA	3	6	3977	3982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011660	TA	3	6	4087	4092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011660	GA	3	6	4618	4623	50 %	0 %	50 %	0 %	217963307
10	NC_011660	TG	3	6	4691	4696	0 %	50 %	50 %	0 %	217963307
11	NC_011660	GT	3	6	4702	4707	0 %	50 %	50 %	0 %	217963307
12	NC_011660	GT	3	6	5001	5006	0 %	50 %	50 %	0 %	217963307
13	NC_011660	AT	3	6	5556	5561	50 %	50 %	0 %	0 %	217963307
14	NC_011660	CA	3	6	5779	5784	50 %	0 %	0 %	50 %	217963307
15	NC_011660	AG	3	6	7612	7617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011660	GC	3	6	8662	8667	0 %	0 %	50 %	50 %	217963310
17	NC_011660	TA	3	6	9146	9151	50 %	50 %	0 %	0 %	217963311
18	NC_011660	GA	3	6	9458	9463	50 %	0 %	50 %	0 %	217963311
19	NC_011660	AT	3	6	9690	9695	50 %	50 %	0 %	0 %	217963311
20	NC_011660	CG	3	6	12080	12085	0 %	0 %	50 %	50 %	217963313
21	NC_011660	TA	3	6	12667	12672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011660	GC	3	6	14709	14714	0 %	0 %	50 %	50 %	217963315
23	NC_011660	AT	3	6	15314	15319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011660	AG	3	6	17542	17547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011660	TG	3	6	18350	18355	0 %	50 %	50 %	0 %	217963318
26	NC_011660	GC	3	6	18696	18701	0 %	0 %	50 %	50 %	217963318
27	NC_011660	TA	3	6	19106	19111	50 %	50 %	0 %	0 %	217963319
28	NC_011660	TA	3	6	19792	19797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011660	TG	3	6	20585	20590	0 %	50 %	50 %	0 %	217963320
30	NC_011660	CG	3	6	21703	21708	0 %	0 %	50 %	50 %	217963322
31	NC_011660	TA	3	6	22203	22208	50 %	50 %	0 %	0 %	217963323
32	NC_011660	AG	3	6	22622	22627	50 %	0 %	50 %	0 %	217963323
33	NC_011660	TG	3	6	23162	23167	0 %	50 %	50 %	0 %	217963324
34	NC_011660	AG	3	6	23580	23585	50 %	0 %	50 %	0 %	217963325
35	NC_011660	TG	4	8	23930	23937	0 %	50 %	50 %	0 %	217963325
36	NC_011660	AC	3	6	25114	25119	50 %	0 %	0 %	50 %	217963327
37	NC_011660	CA	3	6	25530	25535	50 %	0 %	0 %	50 %	217963327
38	NC_011660	CG	3	6	25686	25691	0 %	0 %	50 %	50 %	217963327
39	NC_011660	TG	3	6	26823	26828	0 %	50 %	50 %	0 %	217963330
40	NC_011660	TG	3	6	27925	27930	0 %	50 %	50 %	0 %	217963331
41	NC_011660	GC	3	6	28397	28402	0 %	0 %	50 %	50 %	217963331
42	NC_011660	AC	3	6	28993	28998	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_011660	CT	4	8	29399	29406	0 %	50 %	0 %	50 %	217963333
44	NC_011660	GA	3	6	30926	30931	50 %	0 %	50 %	0 %	217963335
45	NC_011660	CA	3	6	31104	31109	50 %	0 %	0 %	50 %	217963335
46	NC_011660	AC	3	6	31678	31683	50 %	0 %	0 %	50 %	217963335
47	NC_011660	TC	3	6	32871	32876	0 %	50 %	0 %	50 %	217963336
48	NC_011660	CA	3	6	33894	33899	50 %	0 %	0 %	50 %	217963337
49	NC_011660	GC	3	6	34573	34578	0 %	0 %	50 %	50 %	217963337
50	NC_011660	TA	3	6	37172	37177	50 %	50 %	0 %	0 %	217963340
51	NC_011660	TA	3	6	37995	38000	50 %	50 %	0 %	0 %	217963340
52	NC_011660	TA	3	6	39178	39183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011660	AT	3	6	39367	39372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011660	AG	3	6	39398	39403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011660	TA	3	6	39519	39524	50 %	50 %	0 %	0 %	217963342
56	NC_011660	GT	3	6	39573	39578	0 %	50 %	50 %	0 %	217963342
57	NC_011660	CA	4	8	39686	39693	50 %	0 %	0 %	50 %	217963342
58	NC_011660	AC	3	6	40658	40663	50 %	0 %	0 %	50 %	217963342
59	NC_011660	AG	3	6	40675	40680	50 %	0 %	50 %	0 %	217963342
60	NC_011660	CA	3	6	43066	43071	50 %	0 %	0 %	50 %	217963345
61	NC_011660	AT	3	6	44285	44290	50 %	50 %	0 %	0 %	217963346
62	NC_011660	TA	3	6	45887	45892	50 %	50 %	0 %	0 %	217963347
63	NC_011660	TG	3	6	46070	46075	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011660	GT	3	6	46425	46430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011660	GT	3	6	46621	46626	0 %	50 %	50 %	0 %	217963349
66	NC_011660	AT	3	6	48661	48666	50 %	50 %	0 %	0 %	217963350
67	NC_011660	CA	3	6	48913	48918	50 %	0 %	0 %	50 %	217963350
68	NC_011660	TG	3	6	50457	50462	0 %	50 %	50 %	0 %	217963352
69	NC_011660	AT	3	6	52420	52425	50 %	50 %	0 %	0 %	217963354
70	NC_011660	AT	3	6	53377	53382	50 %	50 %	0 %	0 %	217963355
71	NC_011660	CG	3	6	54377	54382	0 %	0 %	50 %	50 %	217963357
72	NC_011660	CG	3	6	54539	54544	0 %	0 %	50 %	50 %	217963357
73	NC_011660	GC	4	8	57470	57477	0 %	0 %	50 %	50 %	217963359
74	NC_011660	AC	3	6	58016	58021	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011660	AC	3	6	58200	58205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011660	TG	3	6	58280	58285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011660	AT	3	6	58500	58505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011660	AG	3	6	58795	58800	50 %	0 %	50 %	0 %	217963361
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80	NC_011660	TA	3	6	60895	60900	50 %	50 %	0 %	0 %	217963365
81	NC_011660	CG	3	6	62647	62652	0 %	0 %	50 %	50 %	217963367
82	NC_011660	CA	3	6	64237	64242	50 %	0 %	0 %	50 %	217963368
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84	NC_011660	AC	3	6	70032	70037	50 %	0 %	0 %	50 %	217963375
85	NC_011660	CG	3	6	71302	71307	0 %	0 %	50 %	50 %	217963377
86	NC_011660	TA	3	6	71342	71347	50 %	50 %	0 %	0 %	217963377
87	NC_011660	GC	3	6	72241	72246	0 %	0 %	50 %	50 %	217963378
88	NC_011660	GT	3	6	72512	72517	0 %	50 %	50 %	0 %	217963378
89	NC_011660	AC	3	6	72694	72699	50 %	0 %	0 %	50 %	217963379
90	NC_011660	AT	3	6	74729	74734	50 %	50 %	0 %	0 %	217963380
91	NC_011660	AG	3	6	76974	76979	50 %	0 %	50 %	0 %	217963383
92	NC_011660	GC	3	6	78000	78005	0 %	0 %	50 %	50 %	217963384
93	NC_011660	TA	3	6	78148	78153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011660	AG	3	6	78268	78273	50 %	0 %	50 %	0 %	217963385
95	NC_011660	AT	3	6	79747	79752	50 %	50 %	0 %	0 %	217963386
96	NC_011660	TA	3	6	79754	79759	50 %	50 %	0 %	0 %	217963386
97	NC_011660	GA	3	6	81239	81244	50 %	0 %	50 %	0 %	217963388
98	NC_011660	GC	3	6	81886	81891	0 %	0 %	50 %	50 %	217963388
99	NC_011660	AT	3	6	84091	84096	50 %	50 %	0 %	0 %	217963389
100	NC_011660	AT	4	8	86024	86031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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102	NC_011660	CA	3	6	91530	91535	50 %	0 %	0 %	50 %	217963395
103	NC_011660	TG	3	6	92899	92904	0 %	50 %	50 %	0 %	217963396
104	NC_011660	CG	3	6	93051	93056	0 %	0 %	50 %	50 %	217963396
105	NC_011660	CG	3	6	93130	93135	0 %	0 %	50 %	50 %	217963396
106	NC_011660	TC	3	6	94825	94830	0 %	50 %	0 %	50 %	217963398
107	NC_011660	GA	3	6	94998	95003	50 %	0 %	50 %	0 %	217963398
108	NC_011660	CG	3	6	95121	95126	0 %	0 %	50 %	50 %	217963398
109	NC_011660	GA	3	6	95163	95168	50 %	0 %	50 %	0 %	217963398
110	NC_011660	AC	3	6	96094	96099	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_011660	TG	3	6	101231	101236	0 %	50 %	50 %	0 %	217963404
112	NC_011660	GT	3	6	101334	101339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011660	AT	3	6	101530	101535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011660	AT	3	6	103240	103245	50 %	50 %	0 %	0 %	217963408
115	NC_011660	AT	3	6	103291	103296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011660	AT	3	6	103854	103859	50 %	50 %	0 %	0 %	217963409
117	NC_011660	GA	3	6	103997	104002	50 %	0 %	50 %	0 %	217963409
118	NC_011660	AG	3	6	104206	104211	50 %	0 %	50 %	0 %	217963409
119	NC_011660	GC	3	6	105704	105709	0 %	0 %	50 %	50 %	217963410
120	NC_011660	AT	3	6	106714	106719	50 %	50 %	0 %	0 %	217963410
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122	NC_011660	CA	3	6	109683	109688	50 %	0 %	0 %	50 %	217963411
123	NC_011660	GC	3	6	109884	109889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_011660	TA	3	6	110082	110087	50 %	50 %	0 %	0 %	217963412
125	NC_011660	GC	3	6	110445	110450	0 %	0 %	50 %	50 %	217963412
126	NC_011660	TA	3	6	110862	110867	50 %	50 %	0 %	0 %	217963412
127	NC_011660	TA	3	6	111170	111175	50 %	50 %	0 %	0 %	217963413
128	NC_011660	TA	3	6	111304	111309	50 %	50 %	0 %	0 %	217963413
129	NC_011660	AT	4	8	112339	112346	50 %	50 %	0 %	0 %	217963415
130	NC_011660	GT	3	6	112354	112359	0 %	50 %	50 %	0 %	217963415
131	NC_011660	GC	3	6	114015	114020	0 %	0 %	50 %	50 %	217963417
132	NC_011660	TA	3	6	116676	116681	50 %	50 %	0 %	0 %	217963420
133	NC_011660	TA	3	6	117623	117628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011660	GA	4	8	117670	117677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011660	GA	3	6	119247	119252	50 %	0 %	50 %	0 %	217963422
136	NC_011660	TA	3	6	119553	119558	50 %	50 %	0 %	0 %	217963422
137	NC_011660	TA	3	6	123712	123717	50 %	50 %	0 %	0 %	217963426
138	NC_011660	GC	3	6	124066	124071	0 %	0 %	50 %	50 %	217963426
139	NC_011660	CG	3	6	125461	125466	0 %	0 %	50 %	50 %	217963427
140	NC_011660	TG	3	6	126924	126929	0 %	50 %	50 %	0 %	217963428
141	NC_011660	AT	3	6	127502	127507	50 %	50 %	0 %	0 %	217963429
142	NC_011660	CA	3	6	128180	128185	50 %	0 %	0 %	50 %	217963430
143	NC_011660	AC	3	6	129107	129112	50 %	0 %	0 %	50 %	217963430
144	NC_011660	TA	3	6	130375	130380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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