MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus cereus AH187 plasmid pAH187_270

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011655	ATTTTA	2	12	3639	3650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217956695
2	NC_011655	CATATA	2	12	5357	5368	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_011655	ACTTTA	2	12	9565	9576	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	217956701
4	NC_011655	GAAAAA	2	12	10931	10942	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	217956704
5	NC_011655	TAGGAC	2	12	30119	30130	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	217956733
6	NC_011655	GTTCCT	2	12	40139	40150	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	217956738
7	NC_011655	TTGATA	2	12	42424	42435	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	217956741
8	NC_011655	TTATTC	2	12	43679	43690	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_011655	AACAAA	2	12	45441	45452	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	217956743
10	NC_011655	ATTGAT	2	12	47698	47709	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	217956745
11	NC_011655	GATTTC	2	12	48818	48829	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	217956745
12	NC_011655	ACAGCA	2	12	50009	50020	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	217956748
13	NC_011655	AGGAGC	2	12	50047	50058	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	217956748
14	NC_011655	AGATGC	2	12	50254	50265	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	217956748
15	NC_011655	ATCCAG	2	12	52487	52498	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	217956749
16	NC_011655	AAAAAG	2	12	53956	53967	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	217956750
17	NC_011655	ACGTGT	2	12	56811	56822	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	217956754
18	NC_011655	AACAGG	2	12	58753	58764	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	217956756
19	NC_011655	GTTATT	2	12	61198	61209	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	217956758
20	NC_011655	ATAAGA	2	12	62335	62346	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	217956762
21	NC_011655	AGAACA	2	12	62355	62366	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	217956762
22	NC_011655	GATTGT	2	12	65356	65367	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	217956765
23	NC_011655	TTTAAT	2	12	66862	66873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011655	CAAAAG	2	12	68176	68187	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	217956771
25	NC_011655	GAAATT	2	12	70882	70893	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	217956777
26	NC_011655	AATATT	2	12	73244	73255	50 %	50 %	0 %	0 %	217956782
27	NC_011655	GAATAA	2	12	73530	73541	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011655	CGTAGA	2	12	74444	74455	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_011655	TGTGAT	2	12	74492	74503	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011655	GTTCTT	2	12	75325	75336	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	217956786
31	NC_011655	TATGAA	2	12	76752	76763	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	217956788
32	NC_011655	ATATTT	2	12	78790	78801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011655	TAAAAA	2	12	82992	83003	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011655	GAAAAA	2	12	89470	89481	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	217956801
35	NC_011655	TCAAAT	2	12	89605	89616	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	217956801
36	NC_011655	CAAAAG	2	12	91891	91902	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	217956805
37	NC_011655	TTAGTC	2	12	96576	96587	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	217956809
38	NC_011655	AAGAGA	2	12	98011	98022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217956809
39	NC_011655	ACGCAA	2	12	99075	99086	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	217956809
40	NC_011655	AAATCA	2	12	99893	99904	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	217956809
41	NC_011655	TGGAGA	2	12	101689	101700	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	217956810
42	NC_011655	CAAAAA	2	12	102787	102798	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	217956811
43	NC_011655	AATTAG	2	12	104133	104144	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011655	AAAAGA	2	12	105640	105651	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	217956817
45	NC_011655	TTTAAG	2	12	107956	107967	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011655	TTTAAT	2	12	108632	108643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011655	TTTGCA	2	12	116267	116278	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	217956830
48	NC_011655	AAAAGA	2	12	118995	119006	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	217956834
49	NC_011655	ATTTTT	2	12	119162	119173	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011655	AGATGA	2	12	120378	120389	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	217956835
51	NC_011655	TAAGAT	2	12	121991	122002	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	217956836
52	NC_011655	CAATTT	2	12	124050	124061	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	217956839
53	NC_011655	TGGGAA	2	12	124443	124454	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	217956839
54	NC_011655	TTCATA	2	12	126755	126766	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	217956842
55	NC_011655	TTCATA	2	12	126947	126958	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	217956842
56	NC_011655	TCATTT	2	12	140463	140474	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	217956856
57	NC_011655	CATATT	2	12	143249	143260	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	217956856
58	NC_011655	CCAAGT	2	12	146790	146801	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	217956863
59	NC_011655	GAGAAA	2	12	150133	150144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217956867
60	NC_011655	GAAATC	2	12	154127	154138	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	217956873
61	NC_011655	TTTTTA	2	12	155977	155988	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	217956875
62	NC_011655	GTTTTA	2	12	156579	156590	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	217956876
63	NC_011655	TTATTT	2	12	158953	158964	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	217956877
64	NC_011655	CTCCAT	2	12	160049	160060	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	217956878
65	NC_011655	GGAATG	2	12	162358	162369	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	270000253
66	NC_011655	CTTAAT	2	12	164395	164406	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	217956879
67	NC_011655	CAAAAG	2	12	164715	164726	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	217956880
68	NC_011655	AAGCAA	2	12	165264	165275	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	217956880
69	NC_011655	GCTGGT	2	12	165509	165520	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	217956880
70	NC_011655	GACTGT	2	12	171120	171131	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	217956885
71	NC_011655	GAAGGA	2	12	171622	171633	50 %	0 %	50 %	0 %	217956885
72	NC_011655	AGTTAA	2	12	172739	172750	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	217956886
73	NC_011655	ATGTTC	2	12	174735	174746	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	217956888
74	NC_011655	TGTAAT	2	12	176072	176083	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	217956889
75	NC_011655	TTGTAA	2	12	181483	181494	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	217956889
76	NC_011655	TTTGGA	2	12	187245	187256	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	217956889
77	NC_011655	AGAATT	2	12	187550	187561	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	217956889
78	NC_011655	TACCTG	2	12	188227	188238	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	217956889
79	NC_011655	GGATTT	2	12	188820	188831	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	217956889
80	NC_011655	AAAGAA	2	12	195217	195228	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	217956895
81	NC_011655	ATTTCA	2	12	196131	196142	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	217956895
82	NC_011655	ATTATA	2	12	197154	197165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011655	AGTTAT	2	12	198194	198205	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	217956896
84	NC_011655	GAAAAA	2	12	201459	201470	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	217956900
85	NC_011655	ATAAAA	2	12	201493	201504	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	217956900
86	NC_011655	TTAGTA	2	12	204360	204371	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011655	TTTTAT	2	12	205819	205830	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	217956905
88	NC_011655	TATAAA	2	12	206141	206152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217956906
89	NC_011655	ATATTA	2	12	212387	212398	50 %	50 %	0 %	0 %	217956914
90	NC_011655	AAACGG	2	12	215592	215603	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	217956922
91	NC_011655	AACAGA	2	12	215998	216009	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	217956923
92	NC_011655	TTCATT	2	12	217999	218010	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	217956926
93	NC_011655	TTCAAT	2	12	218017	218028	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	217956926
94	NC_011655	CTTTTT	2	12	219419	219430	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	217956927
95	NC_011655	TTTTCC	2	12	219586	219597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217956928
96	NC_011655	CTCTTG	2	12	227675	227686	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	217956935
97	NC_011655	ATAAAT	2	12	231790	231801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217956938
98	NC_011655	TCTTGC	2	12	232651	232662	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	217956938
99	NC_011655	ATCTTC	2	12	233388	233399	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	217956938
100	NC_011655	AGCAAA	2	12	237339	237350	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	217956938
101	NC_011655	CCTTCA	2	12	238244	238255	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	217956938
102	NC_011655	GTAATG	2	12	239454	239465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217956939
103	NC_011655	ATTCAT	3	18	239946	239963	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	217956939
104	NC_011655	GTACGA	2	12	244910	244921	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	217956939
105	NC_011655	TCCACA	2	12	250225	250236	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	217956941
106	NC_011655	ACGCCA	2	12	253216	253227	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	217956943
107	NC_011655	CAGGTT	2	12	256028	256039	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	217956947
108	NC_011655	ACATCT	2	12	256484	256495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217956948
109	NC_011655	AAAAAT	2	12	260078	260089	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	217956952
110	NC_011655	TATAAA	2	12	262922	262933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011655	TCCATA	2	12	263936	263947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217956957
112	NC_011655	TTTAAT	2	12	267961	267972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.