MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus cereus AH187 plasmid pAH187_270

Total Repeats: 227

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011655	AAAAG	2	10	106	115	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011655	CAATC	2	10	1599	1608	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_011655	CAATC	2	10	1902	1911	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_011655	CAAGA	2	10	2092	2101	60 %	0 %	20 %	20 %	217956694
5	NC_011655	GTTTT	2	10	2782	2791	0 %	80 %	20 %	0 %	217956695
6	NC_011655	ATTGT	2	10	3769	3778	20 %	60 %	20 %	0 %	217956695
7	NC_011655	ATTTA	2	10	4479	4488	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011655	GCTTT	2	10	4597	4606	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011655	GCTTT	2	10	4677	4686	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011655	GCTTT	2	10	4758	4767	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011655	GCTTT	2	10	4839	4848	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011655	AGCCA	2	10	5792	5801	40 %	0 %	20 %	40 %	217956697
13	NC_011655	AAAAT	2	10	7284	7293	80 %	20 %	0 %	0 %	217956697
14	NC_011655	ATTTC	2	10	10169	10178	20 %	60 %	0 %	20 %	217956702
15	NC_011655	CCTTC	2	10	12878	12887	0 %	40 %	0 %	60 %	217956707
16	NC_011655	AAGAA	2	10	15447	15456	80 %	0 %	20 %	0 %	217956711
17	NC_011655	CTTTT	2	10	22014	22023	0 %	80 %	0 %	20 %	217956720
18	NC_011655	CACAA	2	10	24867	24876	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_011655	ATAAG	2	10	25481	25490	60 %	20 %	20 %	0 %	217956726
20	NC_011655	CATTC	2	10	25704	25713	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_011655	CACAA	2	10	26616	26625	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_011655	TTTGC	2	10	27484	27493	0 %	60 %	20 %	20 %	217956730
23	NC_011655	ACAAA	2	10	29684	29693	80 %	0 %	0 %	20 %	217956732
24	NC_011655	AAAAT	2	10	29829	29838	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011655	GAAGC	2	10	31684	31693	40 %	0 %	40 %	20 %	217956734
26	NC_011655	ATGGA	2	10	32272	32281	40 %	20 %	40 %	0 %	217956734
27	NC_011655	TTATT	2	10	33310	33319	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011655	ATTTA	2	10	33368	33377	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011655	GAAGT	2	10	33745	33754	40 %	20 %	40 %	0 %	217956735
30	NC_011655	TACGA	2	10	34883	34892	40 %	20 %	20 %	20 %	217956735
31	NC_011655	AGTAA	2	10	35124	35133	60 %	20 %	20 %	0 %	217956735
32	NC_011655	AAAGA	2	10	36714	36723	80 %	0 %	20 %	0 %	217956735
33	NC_011655	TGATT	2	10	37387	37396	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011655	CTTCT	2	10	37688	37697	0 %	60 %	0 %	40 %	217956737
35	NC_011655	CTCTT	2	10	39652	39661	0 %	60 %	0 %	40 %	217956738
36	NC_011655	TTGAT	2	10	39739	39748	20 %	60 %	20 %	0 %	217956738
37	NC_011655	AGTTC	2	10	41216	41225	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_011655	AACAA	2	10	41865	41874	80 %	0 %	0 %	20 %	217956740
39	NC_011655	TTATT	2	10	42375	42384	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011655	GTGAT	2	10	47441	47450	20 %	40 %	40 %	0 %	217956745
41	NC_011655	ATTTT	2	10	48458	48467	20 %	80 %	0 %	0 %	217956745
42	NC_011655	AAAAG	2	10	48794	48803	80 %	0 %	20 %	0 %	217956745
43	NC_011655	AGTCT	2	10	52712	52721	20 %	40 %	20 %	20 %	217956749
44	NC_011655	TAGAT	2	10	52809	52818	40 %	40 %	20 %	0 %	217956749
45	NC_011655	GAAAA	2	10	52987	52996	80 %	0 %	20 %	0 %	217956749
46	NC_011655	ATAAA	2	10	55956	55965	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011655	GAAAG	2	10	55969	55978	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011655	AAATC	2	10	56189	56198	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_011655	AGAAA	2	10	56865	56874	80 %	0 %	20 %	0 %	217956754
50	NC_011655	AAGAA	2	10	57385	57394	80 %	0 %	20 %	0 %	217956755
51	NC_011655	TAGTA	2	10	59486	59495	40 %	40 %	20 %	0 %	217956757
52	NC_011655	ATTGC	2	10	61018	61027	20 %	40 %	20 %	20 %	217956758
53	NC_011655	AATTC	2	10	62120	62129	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_011655	GAATG	2	10	62886	62895	40 %	20 %	40 %	0 %	217956762
55	NC_011655	ATGAA	2	10	62981	62990	60 %	20 %	20 %	0 %	217956762
56	NC_011655	AAACC	2	10	63119	63128	60 %	0 %	0 %	40 %	217956762
57	NC_011655	AAAAG	2	10	70603	70612	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011655	ATTTG	2	10	71695	71704	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011655	TAATT	2	10	71717	71726	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011655	AAACA	2	10	71775	71784	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_011655	CTTAC	2	10	71851	71860	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_011655	AAATG	2	10	72403	72412	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011655	AAACA	2	10	74200	74209	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_011655	AAGCT	2	10	75713	75722	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_011655	ATTTG	2	10	76591	76600	20 %	60 %	20 %	0 %	217956788
66	NC_011655	GGAGC	2	10	77725	77734	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_011655	TTTTA	2	10	78802	78811	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011655	CAGTA	2	10	79337	79346	40 %	20 %	20 %	20 %	217956793
69	NC_011655	AAATG	2	10	82936	82945	60 %	20 %	20 %	0 %	217956794
70	NC_011655	TAAAT	2	10	83767	83776	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011655	TTGTG	2	10	83957	83966	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011655	TTTTA	2	10	84802	84811	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011655	ATGGA	2	10	85280	85289	40 %	20 %	40 %	0 %	217956797
74	NC_011655	ATGAA	2	10	87111	87120	60 %	20 %	20 %	0 %	217956798
75	NC_011655	ATTCC	2	10	87170	87179	20 %	40 %	0 %	40 %	217956798
76	NC_011655	ACAAA	2	10	87540	87549	80 %	0 %	0 %	20 %	217956798
77	NC_011655	GAAAT	2	10	89650	89659	60 %	20 %	20 %	0 %	217956801
78	NC_011655	TATAA	2	10	89732	89741	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011655	AATAA	2	10	89759	89768	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011655	ATTTA	2	10	91199	91208	40 %	60 %	0 %	0 %	217956804
81	NC_011655	GAACT	2	10	92656	92665	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_011655	GTATG	2	10	92803	92812	20 %	40 %	40 %	0 %	217956806
83	NC_011655	ACTAA	2	10	93259	93268	60 %	20 %	0 %	20 %	217956807
84	NC_011655	ATTAG	2	10	93379	93388	40 %	40 %	20 %	0 %	217956807
85	NC_011655	TGAAG	2	10	95564	95573	40 %	20 %	40 %	0 %	217956808
86	NC_011655	TAACT	2	10	96143	96152	40 %	40 %	0 %	20 %	217956808
87	NC_011655	GATAA	2	10	96375	96384	60 %	20 %	20 %	0 %	217956809
88	NC_011655	AAACT	2	10	96492	96501	60 %	20 %	0 %	20 %	217956809
89	NC_011655	GTTAT	2	10	104489	104498	20 %	60 %	20 %	0 %	217956815
90	NC_011655	TAAAA	2	10	106108	106117	80 %	20 %	0 %	0 %	217956817
91	NC_011655	GTTTT	2	10	107186	107195	0 %	80 %	20 %	0 %	217956818
92	NC_011655	CCATA	2	10	109555	109564	40 %	20 %	0 %	40 %	217956820
93	NC_011655	TAAAG	2	10	110334	110343	60 %	20 %	20 %	0 %	217956821
94	NC_011655	ACCTG	2	10	111757	111766	20 %	20 %	20 %	40 %	217956822
95	NC_011655	ATTAT	2	10	111984	111993	40 %	60 %	0 %	0 %	217956822
96	NC_011655	AAATT	2	10	112785	112794	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011655	TAATT	2	10	113532	113541	40 %	60 %	0 %	0 %	217956826
98	NC_011655	TAAGT	2	10	114991	115000	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011655	CATTT	2	10	115214	115223	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_011655	TATTG	2	10	118048	118057	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011655	ATTCT	2	10	119707	119716	20 %	60 %	0 %	20 %	217956835
102	NC_011655	TCCTT	2	10	120811	120820	0 %	60 %	0 %	40 %	217956835
103	NC_011655	GGAGC	2	10	121262	121271	20 %	0 %	60 %	20 %	217956836
104	NC_011655	TTAAA	2	10	122090	122099	60 %	40 %	0 %	0 %	217956836
105	NC_011655	TTGGA	2	10	122391	122400	20 %	40 %	40 %	0 %	217956837
106	NC_011655	ATACT	2	10	124336	124345	40 %	40 %	0 %	20 %	217956839
107	NC_011655	TCTAA	2	10	125698	125707	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_011655	ACTAC	2	10	125832	125841	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_011655	GAAAA	2	10	127144	127153	80 %	0 %	20 %	0 %	217956842
110	NC_011655	CTAAA	2	10	127414	127423	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_011655	ATTCC	2	10	129933	129942	20 %	40 %	0 %	40 %	217956844
112	NC_011655	TTCAC	2	10	137273	137282	20 %	40 %	0 %	40 %	217956851
113	NC_011655	ATTAA	2	10	139473	139482	60 %	40 %	0 %	0 %	217956854
114	NC_011655	GCTTA	2	10	140669	140678	20 %	40 %	20 %	20 %	217956856
115	NC_011655	GTTGT	2	10	140964	140973	0 %	60 %	40 %	0 %	217956856
116	NC_011655	CCTGT	2	10	142723	142732	0 %	40 %	20 %	40 %	217956856
117	NC_011655	CGTTT	2	10	143590	143599	0 %	60 %	20 %	20 %	217956857
118	NC_011655	TAAAT	2	10	144113	144122	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011655	TTTTA	2	10	144161	144170	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011655	GATGT	2	10	144780	144789	20 %	40 %	40 %	0 %	217956859
121	NC_011655	CGATT	2	10	144883	144892	20 %	40 %	20 %	20 %	217956859
122	NC_011655	CCCAA	2	10	145478	145487	40 %	0 %	0 %	60 %	217956860
123	NC_011655	AAGAA	2	10	145898	145907	80 %	0 %	20 %	0 %	217956862
124	NC_011655	TCAAA	2	10	146066	146075	60 %	20 %	0 %	20 %	217956862
125	NC_011655	TCAAT	2	10	147332	147341	40 %	40 %	0 %	20 %	217956863
126	NC_011655	GCAGA	2	10	147344	147353	40 %	0 %	40 %	20 %	217956863
127	NC_011655	TATGA	2	10	147796	147805	40 %	40 %	20 %	0 %	217956863
128	NC_011655	AAAAG	2	10	150516	150525	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011655	TTATT	2	10	150937	150946	20 %	80 %	0 %	0 %	217956868
130	NC_011655	TTCTT	2	10	153514	153523	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_011655	AGGTA	2	10	155838	155847	40 %	20 %	40 %	0 %	217956875
132	NC_011655	TGAAA	2	10	156433	156442	60 %	20 %	20 %	0 %	217956876
133	NC_011655	TAGAG	2	10	158270	158279	40 %	20 %	40 %	0 %	217956877
134	NC_011655	TCTTT	2	10	160453	160462	0 %	80 %	0 %	20 %	217956878
135	NC_011655	GGAAT	2	10	161215	161224	40 %	20 %	40 %	0 %	270000253
136	NC_011655	AAAGA	2	10	165879	165888	80 %	0 %	20 %	0 %	217956881
137	NC_011655	TTGAT	2	10	169201	169210	20 %	60 %	20 %	0 %	217956883
138	NC_011655	TTAAT	2	10	169671	169680	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011655	AAGAT	2	10	170768	170777	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011655	TTGTT	2	10	171176	171185	0 %	80 %	20 %	0 %	217956885
141	NC_011655	AAAGG	2	10	172130	172139	60 %	0 %	40 %	0 %	217956886
142	NC_011655	TTTCT	2	10	173057	173066	0 %	80 %	0 %	20 %	217956887
143	NC_011655	AAATT	2	10	173208	173217	60 %	40 %	0 %	0 %	217956887
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166	NC_011655	TCTTT	2	10	197631	197640	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
167	NC_011655	CTAAA	2	10	197766	197775	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
168	NC_011655	TTATT	2	10	197918	197927	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_011655	ATTTT	2	10	199437	199446	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_011655	TGTTA	2	10	200311	200320	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_011655	TTATT	2	10	206406	206415	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_011655	TTACA	2	10	206612	206621	40 %	40 %	0 %	20 %	217956907
178	NC_011655	TTTTA	2	10	206770	206779	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_011655	ATGAT	2	10	215912	215921	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_011655	TTTTC	2	10	224333	224342	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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227	NC_011655	AGAGC	2	10	269947	269956	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.