MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus cereus AH187 plasmid pAH187_270

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011655	AAAAG	2	10	106	115	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011655	CAATC	2	10	1599	1608	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_011655	CAATC	2	10	1902	1911	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_011655	ATTTA	2	10	4479	4488	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011655	GCTTT	2	10	4597	4606	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011655	GCTTT	2	10	4677	4686	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011655	GCTTT	2	10	4758	4767	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011655	GCTTT	2	10	4839	4848	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011655	CACAA	2	10	24867	24876	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_011655	CATTC	2	10	25704	25713	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_011655	CACAA	2	10	26616	26625	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_011655	AAAAT	2	10	29829	29838	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011655	TTATT	2	10	33310	33319	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011655	ATTTA	2	10	33368	33377	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011655	TGATT	2	10	37387	37396	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011655	AGTTC	2	10	41216	41225	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011655	TTATT	2	10	42375	42384	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011655	ATAAA	2	10	55956	55965	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011655	GAAAG	2	10	55969	55978	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011655	AAATC	2	10	56189	56198	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_011655	AATTC	2	10	62120	62129	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011655	AAAAG	2	10	70603	70612	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011655	ATTTG	2	10	71695	71704	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011655	TAATT	2	10	71717	71726	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011655	AAACA	2	10	71775	71784	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011655	CTTAC	2	10	71851	71860	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_011655	AAATG	2	10	72403	72412	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011655	AAACA	2	10	74200	74209	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_011655	AAGCT	2	10	75713	75722	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_011655	GGAGC	2	10	77725	77734	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011655	TTTTA	2	10	78802	78811	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011655	TAAAT	2	10	83767	83776	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011655	TTGTG	2	10	83957	83966	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011655	TTTTA	2	10	84802	84811	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011655	TATAA	2	10	89732	89741	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011655	AATAA	2	10	89759	89768	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011655	GAACT	2	10	92656	92665	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_011655	AAATT	2	10	112785	112794	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011655	TAAGT	2	10	114991	115000	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011655	CATTT	2	10	115214	115223	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_011655	TATTG	2	10	118048	118057	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011655	TCTAA	2	10	125698	125707	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_011655	ACTAC	2	10	125832	125841	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_011655	CTAAA	2	10	127414	127423	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_011655	TAAAT	2	10	144113	144122	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011655	TTTTA	2	10	144161	144170	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011655	AAAAG	2	10	150516	150525	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011655	TTCTT	2	10	153514	153523	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_011655	TTAAT	2	10	169671	169680	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011655	AAGAT	2	10	170768	170777	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011655	GTTAA	2	10	173346	173355	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011655	TTTTC	2	10	174986	174995	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_011655	CTAAA	2	10	193241	193250	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_011655	TCTTT	2	10	197631	197640	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_011655	CTAAA	2	10	197766	197775	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_011655	TTATT	2	10	197918	197927	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011655	ATTTT	2	10	199437	199446	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011655	GTACA	2	10	200219	200228	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_011655	TAAGA	2	10	200230	200239	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011655	TGTTA	2	10	200311	200320	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011655	AAATA	2	10	206373	206382	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011655	TTATT	2	10	206406	206415	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011655	TTTTA	2	10	206770	206779	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011655	AATTT	2	10	214593	214602	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011655	ATGAT	2	10	215912	215921	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011655	TAAAA	2	10	222844	222853	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011655	TTTTC	2	10	224333	224342	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_011655	CGTTC	2	10	226584	226593	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_011655	CACAA	2	10	227995	228004	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_011655	TAACT	2	10	261566	261575	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011655	CATAT	2	10	265257	265266	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_011655	ATTTT	2	10	267146	267155	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011655	GATTA	2	10	267999	268008	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011655	AGAGC	2	10	269947	269956	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.