MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus cereus AH187 plasmid pAH187_270

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011655	CAAGA	2	10	2092	2101	60 %	0 %	20 %	20 %	217956694
2	NC_011655	GTTTT	2	10	2782	2791	0 %	80 %	20 %	0 %	217956695
3	NC_011655	ATTGT	2	10	3769	3778	20 %	60 %	20 %	0 %	217956695
4	NC_011655	AGCCA	2	10	5792	5801	40 %	0 %	20 %	40 %	217956697
5	NC_011655	AAAAT	2	10	7284	7293	80 %	20 %	0 %	0 %	217956697
6	NC_011655	ATTTC	2	10	10169	10178	20 %	60 %	0 %	20 %	217956702
7	NC_011655	CCTTC	2	10	12878	12887	0 %	40 %	0 %	60 %	217956707
8	NC_011655	AAGAA	2	10	15447	15456	80 %	0 %	20 %	0 %	217956711
9	NC_011655	CTTTT	2	10	22014	22023	0 %	80 %	0 %	20 %	217956720
10	NC_011655	ATAAG	2	10	25481	25490	60 %	20 %	20 %	0 %	217956726
11	NC_011655	TTTGC	2	10	27484	27493	0 %	60 %	20 %	20 %	217956730
12	NC_011655	ACAAA	2	10	29684	29693	80 %	0 %	0 %	20 %	217956732
13	NC_011655	GAAGC	2	10	31684	31693	40 %	0 %	40 %	20 %	217956734
14	NC_011655	ATGGA	2	10	32272	32281	40 %	20 %	40 %	0 %	217956734
15	NC_011655	GAAGT	2	10	33745	33754	40 %	20 %	40 %	0 %	217956735
16	NC_011655	TACGA	2	10	34883	34892	40 %	20 %	20 %	20 %	217956735
17	NC_011655	AGTAA	2	10	35124	35133	60 %	20 %	20 %	0 %	217956735
18	NC_011655	AAAGA	2	10	36714	36723	80 %	0 %	20 %	0 %	217956735
19	NC_011655	CTTCT	2	10	37688	37697	0 %	60 %	0 %	40 %	217956737
20	NC_011655	CTCTT	2	10	39652	39661	0 %	60 %	0 %	40 %	217956738
21	NC_011655	TTGAT	2	10	39739	39748	20 %	60 %	20 %	0 %	217956738
22	NC_011655	AACAA	2	10	41865	41874	80 %	0 %	0 %	20 %	217956740
23	NC_011655	GTGAT	2	10	47441	47450	20 %	40 %	40 %	0 %	217956745
24	NC_011655	ATTTT	2	10	48458	48467	20 %	80 %	0 %	0 %	217956745
25	NC_011655	AAAAG	2	10	48794	48803	80 %	0 %	20 %	0 %	217956745
26	NC_011655	AGTCT	2	10	52712	52721	20 %	40 %	20 %	20 %	217956749
27	NC_011655	TAGAT	2	10	52809	52818	40 %	40 %	20 %	0 %	217956749
28	NC_011655	GAAAA	2	10	52987	52996	80 %	0 %	20 %	0 %	217956749
29	NC_011655	AGAAA	2	10	56865	56874	80 %	0 %	20 %	0 %	217956754
30	NC_011655	AAGAA	2	10	57385	57394	80 %	0 %	20 %	0 %	217956755
31	NC_011655	TAGTA	2	10	59486	59495	40 %	40 %	20 %	0 %	217956757
32	NC_011655	ATTGC	2	10	61018	61027	20 %	40 %	20 %	20 %	217956758
33	NC_011655	GAATG	2	10	62886	62895	40 %	20 %	40 %	0 %	217956762
34	NC_011655	ATGAA	2	10	62981	62990	60 %	20 %	20 %	0 %	217956762
35	NC_011655	AAACC	2	10	63119	63128	60 %	0 %	0 %	40 %	217956762
36	NC_011655	ATTTG	2	10	76591	76600	20 %	60 %	20 %	0 %	217956788
37	NC_011655	CAGTA	2	10	79337	79346	40 %	20 %	20 %	20 %	217956793
38	NC_011655	AAATG	2	10	82936	82945	60 %	20 %	20 %	0 %	217956794
39	NC_011655	ATGGA	2	10	85280	85289	40 %	20 %	40 %	0 %	217956797
40	NC_011655	ATGAA	2	10	87111	87120	60 %	20 %	20 %	0 %	217956798
41	NC_011655	ATTCC	2	10	87170	87179	20 %	40 %	0 %	40 %	217956798
42	NC_011655	ACAAA	2	10	87540	87549	80 %	0 %	0 %	20 %	217956798
43	NC_011655	GAAAT	2	10	89650	89659	60 %	20 %	20 %	0 %	217956801
44	NC_011655	ATTTA	2	10	91199	91208	40 %	60 %	0 %	0 %	217956804
45	NC_011655	GTATG	2	10	92803	92812	20 %	40 %	40 %	0 %	217956806
46	NC_011655	ACTAA	2	10	93259	93268	60 %	20 %	0 %	20 %	217956807
47	NC_011655	ATTAG	2	10	93379	93388	40 %	40 %	20 %	0 %	217956807
48	NC_011655	TGAAG	2	10	95564	95573	40 %	20 %	40 %	0 %	217956808
49	NC_011655	TAACT	2	10	96143	96152	40 %	40 %	0 %	20 %	217956808
50	NC_011655	GATAA	2	10	96375	96384	60 %	20 %	20 %	0 %	217956809
51	NC_011655	AAACT	2	10	96492	96501	60 %	20 %	0 %	20 %	217956809
52	NC_011655	GTTAT	2	10	104489	104498	20 %	60 %	20 %	0 %	217956815
53	NC_011655	TAAAA	2	10	106108	106117	80 %	20 %	0 %	0 %	217956817
54	NC_011655	GTTTT	2	10	107186	107195	0 %	80 %	20 %	0 %	217956818
55	NC_011655	CCATA	2	10	109555	109564	40 %	20 %	0 %	40 %	217956820
56	NC_011655	TAAAG	2	10	110334	110343	60 %	20 %	20 %	0 %	217956821
57	NC_011655	ACCTG	2	10	111757	111766	20 %	20 %	20 %	40 %	217956822
58	NC_011655	ATTAT	2	10	111984	111993	40 %	60 %	0 %	0 %	217956822
59	NC_011655	TAATT	2	10	113532	113541	40 %	60 %	0 %	0 %	217956826
60	NC_011655	ATTCT	2	10	119707	119716	20 %	60 %	0 %	20 %	217956835
61	NC_011655	TCCTT	2	10	120811	120820	0 %	60 %	0 %	40 %	217956835
62	NC_011655	GGAGC	2	10	121262	121271	20 %	0 %	60 %	20 %	217956836
63	NC_011655	TTAAA	2	10	122090	122099	60 %	40 %	0 %	0 %	217956836
64	NC_011655	TTGGA	2	10	122391	122400	20 %	40 %	40 %	0 %	217956837
65	NC_011655	ATACT	2	10	124336	124345	40 %	40 %	0 %	20 %	217956839
66	NC_011655	GAAAA	2	10	127144	127153	80 %	0 %	20 %	0 %	217956842
67	NC_011655	ATTCC	2	10	129933	129942	20 %	40 %	0 %	40 %	217956844
68	NC_011655	TTCAC	2	10	137273	137282	20 %	40 %	0 %	40 %	217956851
69	NC_011655	ATTAA	2	10	139473	139482	60 %	40 %	0 %	0 %	217956854
70	NC_011655	GCTTA	2	10	140669	140678	20 %	40 %	20 %	20 %	217956856
71	NC_011655	GTTGT	2	10	140964	140973	0 %	60 %	40 %	0 %	217956856
72	NC_011655	CCTGT	2	10	142723	142732	0 %	40 %	20 %	40 %	217956856
73	NC_011655	CGTTT	2	10	143590	143599	0 %	60 %	20 %	20 %	217956857
74	NC_011655	GATGT	2	10	144780	144789	20 %	40 %	40 %	0 %	217956859
75	NC_011655	CGATT	2	10	144883	144892	20 %	40 %	20 %	20 %	217956859
76	NC_011655	CCCAA	2	10	145478	145487	40 %	0 %	0 %	60 %	217956860
77	NC_011655	AAGAA	2	10	145898	145907	80 %	0 %	20 %	0 %	217956862
78	NC_011655	TCAAA	2	10	146066	146075	60 %	20 %	0 %	20 %	217956862
79	NC_011655	TCAAT	2	10	147332	147341	40 %	40 %	0 %	20 %	217956863
80	NC_011655	GCAGA	2	10	147344	147353	40 %	0 %	40 %	20 %	217956863
81	NC_011655	TATGA	2	10	147796	147805	40 %	40 %	20 %	0 %	217956863
82	NC_011655	TTATT	2	10	150937	150946	20 %	80 %	0 %	0 %	217956868
83	NC_011655	AGGTA	2	10	155838	155847	40 %	20 %	40 %	0 %	217956875
84	NC_011655	TGAAA	2	10	156433	156442	60 %	20 %	20 %	0 %	217956876
85	NC_011655	TAGAG	2	10	158270	158279	40 %	20 %	40 %	0 %	217956877
86	NC_011655	TCTTT	2	10	160453	160462	0 %	80 %	0 %	20 %	217956878
87	NC_011655	GGAAT	2	10	161215	161224	40 %	20 %	40 %	0 %	270000253
88	NC_011655	AAAGA	2	10	165879	165888	80 %	0 %	20 %	0 %	217956881
89	NC_011655	TTGAT	2	10	169201	169210	20 %	60 %	20 %	0 %	217956883
90	NC_011655	TTGTT	2	10	171176	171185	0 %	80 %	20 %	0 %	217956885
91	NC_011655	AAAGG	2	10	172130	172139	60 %	0 %	40 %	0 %	217956886
92	NC_011655	TTTCT	2	10	173057	173066	0 %	80 %	0 %	20 %	217956887
93	NC_011655	AAATT	2	10	173208	173217	60 %	40 %	0 %	0 %	217956887
94	NC_011655	AAATG	2	10	173634	173643	60 %	20 %	20 %	0 %	217956888
95	NC_011655	AGCTG	2	10	175598	175607	20 %	20 %	40 %	20 %	217956889
96	NC_011655	GAATA	2	10	176966	176975	60 %	20 %	20 %	0 %	217956889
97	NC_011655	ATTGT	2	10	178149	178158	20 %	60 %	20 %	0 %	217956889
98	NC_011655	GAATC	2	10	179053	179062	40 %	20 %	20 %	20 %	217956889
99	NC_011655	ATTGG	2	10	179148	179157	20 %	40 %	40 %	0 %	217956889
100	NC_011655	AAGGT	2	10	181923	181932	40 %	20 %	40 %	0 %	217956889
101	NC_011655	CCGTT	2	10	183688	183697	0 %	40 %	20 %	40 %	217956889
102	NC_011655	GGATT	2	10	184861	184870	20 %	40 %	40 %	0 %	217956889
103	NC_011655	GGATT	2	10	185653	185662	20 %	40 %	40 %	0 %	217956889
104	NC_011655	GGAAT	2	10	185670	185679	40 %	20 %	40 %	0 %	217956889
105	NC_011655	ACGTT	2	10	186229	186238	20 %	40 %	20 %	20 %	217956889
106	NC_011655	GTATT	2	10	188041	188050	20 %	60 %	20 %	0 %	217956889
107	NC_011655	TGAAA	2	10	188061	188070	60 %	20 %	20 %	0 %	217956889
108	NC_011655	AACAT	2	10	188202	188211	60 %	20 %	0 %	20 %	217956889
109	NC_011655	TGAAA	2	10	188457	188466	60 %	20 %	20 %	0 %	217956889
110	NC_011655	TTTGA	2	10	189778	189787	20 %	60 %	20 %	0 %	217956889
111	NC_011655	ATGAA	2	10	190889	190898	60 %	20 %	20 %	0 %	217956890
112	NC_011655	ATCAA	2	10	196156	196165	60 %	20 %	0 %	20 %	217956895
113	NC_011655	TAATT	2	10	205077	205086	40 %	60 %	0 %	0 %	217956903
114	NC_011655	CTTCA	2	10	205799	205808	20 %	40 %	0 %	40 %	217956905
115	NC_011655	TTACA	2	10	206612	206621	40 %	40 %	0 %	20 %	217956907
116	NC_011655	TTGTA	2	10	207006	207015	20 %	60 %	20 %	0 %	217956908
117	NC_011655	TCCAT	2	10	207251	207260	20 %	40 %	0 %	40 %	217956908
118	NC_011655	ACCGT	2	10	208306	208315	20 %	20 %	20 %	40 %	217956911
119	NC_011655	ACTCT	2	10	209011	209020	20 %	40 %	0 %	40 %	217956912
120	NC_011655	AATCG	2	10	209095	209104	40 %	20 %	20 %	20 %	217956912
121	NC_011655	TCATT	2	10	209699	209708	20 %	60 %	0 %	20 %	217956912
122	NC_011655	TTACA	2	10	212890	212899	40 %	40 %	0 %	20 %	217956915
123	NC_011655	CTTTA	2	10	213015	213024	20 %	60 %	0 %	20 %	217956916
124	NC_011655	TAAAA	2	10	215511	215520	80 %	20 %	0 %	0 %	217956922
125	NC_011655	AAGAA	2	10	216570	216579	80 %	0 %	20 %	0 %	217956924
126	NC_011655	TACAA	2	10	216953	216962	60 %	20 %	0 %	20 %	217956924
127	NC_011655	ATTTG	2	10	217881	217890	20 %	60 %	20 %	0 %	217956926
128	NC_011655	TTCTG	2	10	219052	219061	0 %	60 %	20 %	20 %	217956927
129	NC_011655	ATACG	2	10	219820	219829	40 %	20 %	20 %	20 %	217956928
130	NC_011655	GCATT	2	10	220038	220047	20 %	40 %	20 %	20 %	217956928
131	NC_011655	CATTC	2	10	220998	221007	20 %	40 %	0 %	40 %	217956928
132	NC_011655	TTCCT	2	10	223138	223147	0 %	60 %	0 %	40 %	217956930
133	NC_011655	TTGTT	2	10	225192	225201	0 %	80 %	20 %	0 %	217956931
134	NC_011655	CATTT	2	10	234093	234102	20 %	60 %	0 %	20 %	217956938
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.