MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus cereus AH187 plasmid pAH187_270

Total Repeats: 207

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011655	ATAA	2	8	379	386	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011655	AGTA	2	8	1085	1092	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011655	TTTC	2	8	1804	1811	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011655	CATT	2	8	1851	1858	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011655	AACT	2	8	1889	1896	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011655	ACAT	2	8	2650	2657	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011655	ATGT	2	8	2659	2666	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011655	TCTT	2	8	4517	4524	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011655	CTTT	2	8	4638	4645	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011655	CTTT	2	8	4799	4806	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011655	TTTC	2	8	4894	4901	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011655	ATTT	2	8	4918	4925	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011655	TACA	2	8	4981	4988	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011655	ACTT	2	8	5080	5087	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011655	TTCT	2	8	7821	7828	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011655	ATAA	2	8	9924	9931	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011655	TAGA	2	8	12398	12405	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011655	TAAT	2	8	24682	24689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011655	AATA	2	8	24911	24918	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011655	CTTA	2	8	25668	25675	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011655	AATA	2	8	26659	26666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011655	AACA	2	8	27281	27288	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011655	TTTA	2	8	29333	29340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011655	AATA	2	8	38807	38814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011655	CGGA	2	8	38994	39001	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011655	ATTT	2	8	39072	39079	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011655	TGTA	2	8	41020	41027	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011655	TAAT	2	8	41106	41113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011655	TAAA	2	8	41321	41328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011655	ATTC	2	8	42154	42161	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011655	TCAT	2	8	43731	43738	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011655	CTTA	2	8	43990	43997	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011655	TTAT	2	8	44050	44057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011655	TGTA	2	8	45950	45957	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011655	TAAT	2	8	46044	46051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011655	AGAA	2	8	46155	46162	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011655	AATA	2	8	46165	46172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011655	TAAT	2	8	46189	46196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011655	AAAT	2	8	49793	49800	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011655	TAAA	2	8	49806	49813	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011655	ATTT	2	8	51392	51399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011655	GTTA	2	8	55734	55741	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011655	ATTA	2	8	56013	56020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011655	AAAT	2	8	61528	61535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011655	CTCC	2	8	62077	62084	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_011655	GATA	2	8	62157	62164	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011655	AAAC	2	8	63550	63557	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011655	GTAT	2	8	68842	68849	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011655	CGAA	2	8	68965	68972	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011655	AAAG	2	8	69709	69716	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011655	GGAG	2	8	69908	69915	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011655	CGGA	2	8	70499	70506	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011655	TAAC	2	8	70703	70710	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011655	GTAT	2	8	71035	71042	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011655	GATT	2	8	71051	71058	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011655	ATAA	2	8	71207	71214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011655	TAAA	2	8	71957	71964	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011655	ATTT	2	8	72614	72621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011655	GAAA	2	8	72980	72987	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011655	TTGT	2	8	73886	73893	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011655	CAAA	2	8	74295	74302	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011655	ACGA	2	8	74677	74684	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011655	TGGT	2	8	77134	77141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011655	TTAG	2	8	77531	77538	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011655	AATT	2	8	79130	79137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011655	TTTC	2	8	83050	83057	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011655	ACAT	2	8	83108	83115	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011655	GAAG	2	8	83433	83440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011655	ACAG	2	8	83536	83543	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011655	GGAG	2	8	83785	83792	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011655	TATT	2	8	83917	83924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011655	ATTT	2	8	84157	84164	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011655	ACAG	2	8	84747	84754	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011655	AAAG	2	8	87949	87956	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011655	CTTT	2	8	87996	88003	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011655	AAAG	2	8	88044	88051	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011655	AAGT	2	8	89325	89332	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011655	GAAG	2	8	89343	89350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011655	GCTT	2	8	93028	93035	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011655	ACTG	2	8	93163	93170	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011655	AAGA	2	8	95343	95350	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011655	AAGG	2	8	96354	96361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011655	ATTT	2	8	104005	104012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011655	AACA	2	8	104196	104203	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011655	GATG	2	8	106328	106335	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011655	CATC	2	8	106351	106358	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011655	GATG	2	8	107989	107996	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011655	GGAA	2	8	108181	108188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011655	TGTT	2	8	108565	108572	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011655	TCTA	2	8	110518	110525	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011655	GAAA	2	8	110568	110575	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011655	GAAA	2	8	112640	112647	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011655	TTAT	2	8	113689	113696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011655	CATT	2	8	114878	114885	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011655	ATAA	2	8	114891	114898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011655	ATAA	2	8	114937	114944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011655	AACG	2	8	114957	114964	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011655	AATT	2	8	115079	115086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011655	AATA	2	8	116924	116931	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011655	AGAA	2	8	117966	117973	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011655	ATAA	2	8	118606	118613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011655	AATG	2	8	118719	118726	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011655	GGAA	2	8	118831	118838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011655	CTTT	2	8	123599	123606	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011655	ATAA	2	8	125508	125515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011655	ATCT	2	8	127281	127288	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011655	CATT	2	8	133045	133052	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_011655	TATG	2	8	133774	133781	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011655	AAGA	2	8	133857	133864	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011655	CATA	2	8	133950	133957	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011655	TTTA	2	8	138223	138230	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011655	ATAA	2	8	144250	144257	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011655	CATC	2	8	148202	148209	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_011655	TTCA	2	8	149714	149721	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011655	CAAG	2	8	152438	152445	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011655	TACA	2	8	155161	155168	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011655	GAAT	2	8	163565	163572	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011655	AAAT	2	8	163573	163580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011655	TTGG	2	8	163955	163962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011655	AAAT	2	8	166739	166746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011655	TAAT	2	8	169452	169459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011655	TCAA	2	8	169601	169608	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011655	TTTG	2	8	169711	169718	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011655	CGTT	2	8	169751	169758	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_011655	CAAG	2	8	169812	169819	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_011655	TTTA	2	8	170214	170221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011655	GCAT	2	8	172930	172937	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_011655	CTTT	2	8	173520	173527	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011655	TTTC	2	8	174952	174959	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_011655	TTCC	2	8	190243	190250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_011655	GGAA	2	8	190260	190267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011655	TATC	2	8	190603	190610	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_011655	AGTG	2	8	191866	191873	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011655	AACT	2	8	192042	192049	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011655	ACAA	2	8	192244	192251	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_011655	AACT	2	8	192279	192286	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011655	TAAA	2	8	192640	192647	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011655	TATT	2	8	192922	192929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011655	ATAA	2	8	193147	193154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011655	AACG	2	8	194395	194402	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_011655	GTAA	2	8	197400	197407	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011655	ATCT	2	8	197561	197568	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_011655	ATAA	2	8	197641	197648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011655	TAAA	2	8	198002	198009	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011655	TAAA	2	8	199460	199467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011655	TAAT	2	8	199851	199858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011655	CTAT	2	8	199996	200003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_011655	ATAG	2	8	200047	200054	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011655	ATAA	2	8	200076	200083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011655	TAGA	2	8	200596	200603	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011655	TAAA	2	8	201053	201060	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011655	TTAA	2	8	201402	201409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011655	ACAA	2	8	203220	203227	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_011655	CTCC	2	8	204323	204330	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.