MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus cereus AH187 plasmid pAH187_12

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011654	TGA	2	6	243	248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316528
2	NC_011654	GTT	3	9	303	311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316528
3	NC_011654	TCT	2	6	418	423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217316528
4	NC_011654	GAT	2	6	466	471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316528
5	NC_011654	ACT	2	6	529	534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217316528
6	NC_011654	GAA	2	6	589	594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316528
7	NC_011654	TTG	2	6	731	736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316528
8	NC_011654	ATG	2	6	737	742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316528
9	NC_011654	CAA	2	6	746	751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217316528
10	NC_011654	GAT	2	6	955	960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316528
11	NC_011654	ATT	2	6	971	976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316528
12	NC_011654	ATT	2	6	987	992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316528
13	NC_011654	TAT	2	6	1012	1017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316528
14	NC_011654	TTC	2	6	1074	1079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217316528
15	NC_011654	ATG	2	6	1106	1111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316528
16	NC_011654	AGA	2	6	1169	1174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316528
17	NC_011654	AGA	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316528
18	NC_011654	GGA	2	6	1475	1480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	217316519
19	NC_011654	AGA	2	6	1527	1532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316519
20	NC_011654	GAA	2	6	1579	1584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316519
21	NC_011654	TAA	3	9	1609	1617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316519
22	NC_011654	TAT	2	6	1625	1630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316519
23	NC_011654	GAA	2	6	1748	1753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316519
24	NC_011654	AAT	2	6	1763	1768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316519
25	NC_011654	TAT	2	6	1786	1791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316519
26	NC_011654	AGA	2	6	1792	1797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316519
27	NC_011654	GAA	2	6	1814	1819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316519
28	NC_011654	GAA	2	6	2035	2040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316519
29	NC_011654	TCA	2	6	2281	2286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217316530
30	NC_011654	GAA	2	6	2319	2324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316530
31	NC_011654	ATA	2	6	2327	2332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316530
32	NC_011654	ATT	2	6	2482	2487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316518
33	NC_011654	GTT	2	6	2599	2604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316518
34	NC_011654	TGA	2	6	2613	2618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316518
35	NC_011654	TAA	2	6	2731	2736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316518
36	NC_011654	CTT	2	6	3318	3323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217316526
37	NC_011654	TTG	2	6	3436	3441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316526
38	NC_011654	GAT	2	6	3499	3504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316526
39	NC_011654	ATG	2	6	3535	3540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316522
40	NC_011654	GCG	3	9	3631	3639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	217316522
41	NC_011654	TTA	2	6	3668	3673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316522
42	NC_011654	GAA	2	6	3820	3825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316520
43	NC_011654	GTT	2	6	3829	3834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316520
44	NC_011654	TGT	2	6	3966	3971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316520
45	NC_011654	ATG	2	6	4212	4217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316524
46	NC_011654	CAA	2	6	4271	4276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217316524
47	NC_011654	TAA	2	6	4288	4293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316524
48	NC_011654	TGA	2	6	4486	4491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316524
49	NC_011654	TGA	2	6	4558	4563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316524
50	NC_011654	TAA	2	6	4564	4569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316524
51	NC_011654	TGG	2	6	4618	4623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217316524
52	NC_011654	ATA	2	6	4629	4634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316524
53	NC_011654	GTA	2	6	4638	4643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316524
54	NC_011654	ATG	2	6	4677	4682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316524
55	NC_011654	ATA	2	6	4722	4727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316524
56	NC_011654	TAA	2	6	4747	4752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316524
57	NC_011654	ACG	2	6	4820	4825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217316524
58	NC_011654	TGT	2	6	4828	4833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316524
59	NC_011654	AAG	2	6	4914	4919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316524
60	NC_011654	AGA	2	6	4924	4929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316524
61	NC_011654	GAA	2	6	5002	5007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316524
62	NC_011654	ATT	2	6	5498	5503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316516
63	NC_011654	TGT	2	6	5529	5534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316516
64	NC_011654	CTA	2	6	5586	5591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217316516
65	NC_011654	TGA	2	6	6801	6806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316523
66	NC_011654	GTA	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316523
67	NC_011654	GAT	2	6	6880	6885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316523
68	NC_011654	TTA	2	6	6894	6899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316523
69	NC_011654	TTG	2	6	7064	7069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316523
70	NC_011654	TTA	2	6	7078	7083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316523
71	NC_011654	AAT	2	6	7088	7093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316523
72	NC_011654	TAA	2	6	7174	7179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316525
73	NC_011654	TAG	2	6	7189	7194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316525
74	NC_011654	GAA	2	6	7287	7292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316525
75	NC_011654	AGA	2	6	7373	7378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316514
76	NC_011654	GAT	2	6	7392	7397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316514
77	NC_011654	GAA	2	6	7398	7403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316514
78	NC_011654	CAA	2	6	7473	7478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217316514
79	NC_011654	TTA	2	6	7494	7499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316514
80	NC_011654	ATG	2	6	7533	7538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316514
81	NC_011654	CAA	2	6	7704	7709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217316514
82	NC_011654	TTA	2	6	7919	7924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316529
83	NC_011654	TCT	2	6	8001	8006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217316529
84	NC_011654	AAC	2	6	8035	8040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217316529
85	NC_011654	ATT	2	6	8115	8120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316529
86	NC_011654	TAT	2	6	8123	8128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316529
87	NC_011654	TAG	2	6	8133	8138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316529
88	NC_011654	ATT	2	6	8155	8160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316529
89	NC_011654	AAC	2	6	8161	8166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217316529
90	NC_011654	GAA	2	6	8290	8295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316529
91	NC_011654	TAT	2	6	8309	8314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316529
92	NC_011654	TGT	2	6	8457	8462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316531
93	NC_011654	ATT	2	6	8543	8548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316531
94	NC_011654	GTA	2	6	8624	8629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316535
95	NC_011654	AAG	2	6	9122	9127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316527
96	NC_011654	AAT	2	6	9145	9150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316527
97	NC_011654	GAT	2	6	9151	9156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316527
98	NC_011654	GAA	2	6	9194	9199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316527
99	NC_011654	ATG	2	6	9267	9272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316527
100	NC_011654	TAA	2	6	9331	9336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316527
101	NC_011654	TGT	2	6	9343	9348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316527
102	NC_011654	GTA	2	6	9351	9356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316527
103	NC_011654	ATT	2	6	9401	9406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316527
104	NC_011654	ACT	2	6	9416	9421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217316527
105	NC_011654	GAT	3	9	9485	9493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316527
106	NC_011654	TAA	2	6	9526	9531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217316527
107	NC_011654	AAG	2	6	9621	9626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316527
108	NC_011654	ATG	2	6	9633	9638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316527
109	NC_011654	GAT	2	6	9728	9733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316527
110	NC_011654	GAT	3	9	9938	9946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316527
111	NC_011654	GAA	2	6	10001	10006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316527
112	NC_011654	AGA	2	6	10117	10122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316527
113	NC_011654	GAA	2	6	10130	10135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316527
114	NC_011654	CCA	2	6	10136	10141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217316527
115	NC_011654	CTT	2	6	10191	10196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217316527
116	NC_011654	CTA	2	6	10278	10283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217316527
117	NC_011654	TAG	2	6	10309	10314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316527
118	NC_011654	AGC	2	6	10375	10380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	217316527
119	NC_011654	ATG	2	6	10555	10560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316527
120	NC_011654	GAT	2	6	10801	10806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316513
121	NC_011654	TGT	2	6	10818	10823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316513
122	NC_011654	TTG	2	6	10826	10831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316513
123	NC_011654	TTG	2	6	10848	10853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316513
124	NC_011654	TGT	2	6	10869	10874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217316513
125	NC_011654	AAG	2	6	11087	11092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316521
126	NC_011654	CTT	2	6	11105	11110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217316521
127	NC_011654	ATT	2	6	11236	11241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316515
128	NC_011654	AGA	2	6	11597	11602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316534
129	NC_011654	GAA	2	6	11675	11680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316534
130	NC_011654	GAA	2	6	11696	11701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316534
131	NC_011654	GAA	2	6	12238	12243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316517
132	NC_011654	GAA	2	6	12254	12259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	217316517
133	NC_011654	TGG	2	6	12269	12274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217316517
134	NC_011654	ATT	2	6	12410	12415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217316517
135	NC_011654	AGT	2	6	12434	12439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217316517

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.