MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermosipho africanus TCF52B chromosome

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011653	TAAAAA	2	12	11259	11270	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011653	AAAATT	2	12	24872	24883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011653	AATGTA	2	12	72913	72924	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011653	GTTTTT	2	12	89907	89918	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011653	TAAAGT	2	12	118939	118950	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011653	AATTAT	2	12	124320	124331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011653	TTTATT	2	12	190324	190335	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011653	TAAAAA	2	12	228409	228420	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011653	TTTCTT	2	12	229438	229449	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_011653	AAAGAT	2	12	259391	259402	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011653	CAAAAG	2	12	259633	259644	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011653	TGTTAT	2	12	284284	284295	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011653	AAATTA	2	12	309637	309648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011653	TTATAG	2	12	309970	309981	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011653	ATTATC	2	12	311212	311223	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_011653	CATTTA	2	12	324681	324692	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_011653	ACTTCG	2	12	327470	327481	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011653	CTAAAC	2	12	328230	328241	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011653	TTAAAT	2	12	329560	329571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011653	ATAAAA	2	12	402840	402851	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011653	TCATTT	2	12	404642	404653	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_011653	AATAGT	2	12	489893	489904	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011653	AACAAA	2	12	492250	492261	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_011653	ACTTTT	2	12	492436	492447	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_011653	AATAAA	2	12	502275	502286	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011653	AATTAA	2	12	503999	504010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011653	TAAAGT	2	12	587945	587956	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011653	CATTTT	2	12	588246	588257	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_011653	AAGAAA	2	12	590544	590555	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011653	AATAGA	2	12	616496	616507	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011653	ATTTGA	2	12	660374	660385	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011653	TTATTT	2	12	671952	671963	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011653	AGGTGA	2	12	685138	685149	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011653	AAGCGA	2	12	685808	685819	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_011653	AAAAAT	2	12	707929	707940	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011653	AGTTAT	2	12	719283	719294	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011653	AATTTT	2	12	723241	723252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011653	ATTTGC	2	12	736017	736028	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_011653	TTAATC	2	12	739245	739256	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_011653	ATCATT	2	12	746899	746910	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_011653	GTTTTC	2	12	752691	752702	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_011653	AAAACC	2	12	781251	781262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011653	ATTACA	2	12	790046	790057	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_011653	ATATTT	2	12	824989	825000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011653	AAATTG	2	12	827810	827821	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011653	CAAATA	2	12	876249	876260	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_011653	AAAACT	2	12	876404	876415	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_011653	AATTTT	2	12	876728	876739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011653	TAAAAA	2	12	887302	887313	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011653	TAAAAA	2	12	901104	901115	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011653	TTTAAA	2	12	907944	907955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011653	AAAAAC	2	12	917883	917894	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_011653	GGGGTA	2	12	918121	918132	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011653	TTTCTT	2	12	952193	952204	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_011653	AGAATT	2	12	1002724	1002735	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011653	AAATAA	2	12	1031242	1031253	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011653	GAAAAA	2	12	1031466	1031477	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011653	AAAAAC	2	12	1048777	1048788	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_011653	AGGTGA	2	12	1123160	1123171	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011653	AAGCGA	2	12	1123830	1123841	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_011653	CAGATG	2	12	1135220	1135231	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_011653	AGCACT	2	12	1135281	1135292	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011653	ATTATA	2	12	1184398	1184409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011653	ATAAAG	2	12	1192319	1192330	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011653	TTCGCT	2	12	1225680	1225691	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011653	TTTTTC	2	12	1262776	1262787	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_011653	AGATAA	2	12	1271290	1271301	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011653	TATAAA	2	12	1293636	1293647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011653	AAAGTC	2	12	1312394	1312405	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_011653	AAAGAT	2	12	1477821	1477832	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011653	CAAAAG	2	12	1478063	1478074	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_011653	AAAATT	2	12	1493155	1493166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011653	CTTTTT	2	12	1543460	1543471	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_011653	GTAGCA	2	12	1548295	1548306	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_011653	ATTCAT	2	12	1549061	1549072	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_011653	TTACTA	2	12	1564041	1564052	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_011653	AAAATT	2	12	1595849	1595860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011653	TGAATA	2	12	1603496	1603507	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011653	AAAGAT	2	12	1667631	1667642	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011653	CAAAAG	2	12	1667873	1667884	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_011653	ATTTTT	2	12	1688546	1688557	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011653	AGGGGT	2	12	1841322	1841333	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011653	TAAAAT	2	12	1848886	1848897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011653	AGGTGA	2	12	1851966	1851977	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011653	AAGCGA	2	12	1852636	1852647	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_011653	AATTTT	2	12	1904787	1904798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011653	GTTGAA	2	12	1914722	1914733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011653	CCAATC	2	12	1960462	1960473	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_011653	TCAATT	2	12	1960558	1960569	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_011653	AATTAA	2	12	1972037	1972048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011653	AAATGT	2	12	1972092	1972103	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011653	AGTTTT	2	12	1972917	1972928	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011653	CAAATT	2	12	1973411	1973422	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_011653	GTTCTT	2	12	1973813	1973824	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_011653	AATTTT	2	12	1974783	1974794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011653	TTAAAA	2	12	1993435	1993446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011653	AGTTGA	2	12	1996723	1996734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011653	TTACAA	2	12	2003801	2003812	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_011653	TAAAAA	2	12	2011057	2011068	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.