MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Thermosipho africanus TCF52B chromosome

Total Repeats: 1578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011653	AATCA	2	10	1480	1489	60 %	20 %	0 %	20 %	254555126
2	NC_011653	TCTCT	2	10	2575	2584	0 %	60 %	0 %	40 %	217076135
3	NC_011653	ATTTT	2	10	2632	2641	20 %	80 %	0 %	0 %	217076135
4	NC_011653	AATTT	2	10	2718	2727	40 %	60 %	0 %	0 %	217076135
5	NC_011653	GATCT	2	10	3350	3359	20 %	40 %	20 %	20 %	217076135
6	NC_011653	CCTTT	2	10	4350	4359	0 %	60 %	0 %	40 %	217076137
7	NC_011653	ATAAC	2	10	5963	5972	60 %	20 %	0 %	20 %	217076137
8	NC_011653	AGAAT	2	10	6097	6106	60 %	20 %	20 %	0 %	217076137
9	NC_011653	AAATC	2	10	6356	6365	60 %	20 %	0 %	20 %	217076137
10	NC_011653	TTGTT	2	10	7042	7051	0 %	80 %	20 %	0 %	217076139
11	NC_011653	AGAAA	2	10	7070	7079	80 %	0 %	20 %	0 %	217076139
12	NC_011653	ATTAT	2	10	8595	8604	40 %	60 %	0 %	0 %	217076139
13	NC_011653	AAAAT	2	10	9109	9118	80 %	20 %	0 %	0 %	217076139
14	NC_011653	TTAAA	2	10	9319	9328	60 %	40 %	0 %	0 %	217076139
15	NC_011653	AAGCA	2	10	11071	11080	60 %	0 %	20 %	20 %	217076140
16	NC_011653	ATTAT	2	10	11210	11219	40 %	60 %	0 %	0 %	217076140
17	NC_011653	CCAAA	2	10	12280	12289	60 %	0 %	0 %	40 %	217076141
18	NC_011653	ACAAA	2	10	12661	12670	80 %	0 %	0 %	20 %	217076142
19	NC_011653	AAATT	2	10	14558	14567	60 %	40 %	0 %	0 %	217076144
20	NC_011653	ATTTT	2	10	15037	15046	20 %	80 %	0 %	0 %	217076146
21	NC_011653	TAAAT	2	10	19025	19034	60 %	40 %	0 %	0 %	217076151
22	NC_011653	AAAAC	2	10	19096	19105	80 %	0 %	0 %	20 %	217076151
23	NC_011653	AAAAG	2	10	19141	19150	80 %	0 %	20 %	0 %	217076151
24	NC_011653	TTTTA	2	10	21995	22004	20 %	80 %	0 %	0 %	217076155
25	NC_011653	AACCA	2	10	22058	22067	60 %	0 %	0 %	40 %	217076155
26	NC_011653	CGCTT	2	10	23893	23902	0 %	40 %	20 %	40 %	217076156
27	NC_011653	AACCA	2	10	25527	25536	60 %	0 %	0 %	40 %	217076158
28	NC_011653	AATTC	2	10	26833	26842	40 %	40 %	0 %	20 %	217076159
29	NC_011653	GTTGC	2	10	28192	28201	0 %	40 %	40 %	20 %	217076160
30	NC_011653	CATTA	2	10	28628	28637	40 %	40 %	0 %	20 %	217076160
31	NC_011653	TTCAT	2	10	30990	30999	20 %	60 %	0 %	20 %	217076161
32	NC_011653	CTTTT	2	10	33335	33344	0 %	80 %	0 %	20 %	217076163
33	NC_011653	TCTCT	2	10	33875	33884	0 %	60 %	0 %	40 %	217076163
34	NC_011653	GAATT	2	10	34538	34547	40 %	40 %	20 %	0 %	217076164
35	NC_011653	GTATA	2	10	36298	36307	40 %	40 %	20 %	0 %	217076166
36	NC_011653	TATTT	2	10	38166	38175	20 %	80 %	0 %	0 %	217076167
37	NC_011653	CAAAT	2	10	39234	39243	60 %	20 %	0 %	20 %	217076168
38	NC_011653	CCAAT	2	10	39520	39529	40 %	20 %	0 %	40 %	217076168
39	NC_011653	ATATA	2	10	41534	41543	60 %	40 %	0 %	0 %	217076171
40	NC_011653	ATGTA	2	10	42231	42240	40 %	40 %	20 %	0 %	217076171
41	NC_011653	TTTCC	2	10	42241	42250	0 %	60 %	0 %	40 %	217076171
42	NC_011653	TGGAA	2	10	43080	43089	40 %	20 %	40 %	0 %	217076173
43	NC_011653	TATCA	2	10	45553	45562	40 %	40 %	0 %	20 %	217076176
44	NC_011653	TTTTC	2	10	47183	47192	0 %	80 %	0 %	20 %	217076176
45	NC_011653	TAATC	2	10	47491	47500	40 %	40 %	0 %	20 %	217076176
46	NC_011653	CAATC	2	10	48288	48297	40 %	20 %	0 %	40 %	217076176
47	NC_011653	AAAAT	2	10	48579	48588	80 %	20 %	0 %	0 %	217076176
48	NC_011653	TTAAT	2	10	48640	48649	40 %	60 %	0 %	0 %	217076177
49	NC_011653	TTTTA	2	10	48926	48935	20 %	80 %	0 %	0 %	217076177
50	NC_011653	ATTTA	2	10	49149	49158	40 %	60 %	0 %	0 %	217076178
51	NC_011653	TCTTT	2	10	50008	50017	0 %	80 %	0 %	20 %	217076179
52	NC_011653	AATCA	2	10	50805	50814	60 %	20 %	0 %	20 %	217076180
53	NC_011653	GTTCT	2	10	51812	51821	0 %	60 %	20 %	20 %	217076182
54	NC_011653	CTTTA	2	10	52383	52392	20 %	60 %	0 %	20 %	217076182
55	NC_011653	ATTTT	2	10	53959	53968	20 %	80 %	0 %	0 %	217076185
56	NC_011653	AAATA	2	10	56725	56734	80 %	20 %	0 %	0 %	217076187
57	NC_011653	CTTTT	2	10	56910	56919	0 %	80 %	0 %	20 %	217076187
58	NC_011653	TGCTC	2	10	60700	60709	0 %	40 %	20 %	40 %	217076191
59	NC_011653	TATAC	2	10	61314	61323	40 %	40 %	0 %	20 %	217076193
60	NC_011653	TATAA	2	10	62668	62677	60 %	40 %	0 %	0 %	217076195
61	NC_011653	ATTTA	2	10	62920	62929	40 %	60 %	0 %	0 %	217076195
62	NC_011653	TTGTT	2	10	62983	62992	0 %	80 %	20 %	0 %	217076195
63	NC_011653	ATTTT	2	10	65392	65401	20 %	80 %	0 %	0 %	217076199
64	NC_011653	TTTTA	2	10	66569	66578	20 %	80 %	0 %	0 %	217076200
65	NC_011653	TATCT	2	10	69367	69376	20 %	60 %	0 %	20 %	217076203
66	NC_011653	CTAAG	2	10	70923	70932	40 %	20 %	20 %	20 %	217076203
67	NC_011653	TTTTA	2	10	72334	72343	20 %	80 %	0 %	0 %	217076204
68	NC_011653	AATTA	2	10	75485	75494	60 %	40 %	0 %	0 %	217076208
69	NC_011653	TCATT	2	10	77169	77178	20 %	60 %	0 %	20 %	217076209
70	NC_011653	AAATA	2	10	79130	79139	80 %	20 %	0 %	0 %	217076211
71	NC_011653	AATTT	2	10	79803	79812	40 %	60 %	0 %	0 %	217076212
72	NC_011653	TACAA	2	10	80120	80129	60 %	20 %	0 %	20 %	217076213
73	NC_011653	TTATT	2	10	80479	80488	20 %	80 %	0 %	0 %	217076214
74	NC_011653	AAAAG	2	10	82924	82933	80 %	0 %	20 %	0 %	217076218
75	NC_011653	TCTAT	2	10	84676	84685	20 %	60 %	0 %	20 %	217076221
76	NC_011653	AAAAC	2	10	85863	85872	80 %	0 %	0 %	20 %	217076223
77	NC_011653	AAGAA	2	10	86246	86255	80 %	0 %	20 %	0 %	217076223
78	NC_011653	AAAAT	2	10	86461	86470	80 %	20 %	0 %	0 %	217076224
79	NC_011653	AAAAG	2	10	86921	86930	80 %	0 %	20 %	0 %	217076224
80	NC_011653	TGGAA	2	10	89089	89098	40 %	20 %	40 %	0 %	217076225
81	NC_011653	ATTTT	2	10	90581	90590	20 %	80 %	0 %	0 %	217076226
82	NC_011653	AGTAA	2	10	91166	91175	60 %	20 %	20 %	0 %	217076226
83	NC_011653	GTTTT	2	10	92105	92114	0 %	80 %	20 %	0 %	217076227
84	NC_011653	ACCTT	2	10	96807	96816	20 %	40 %	0 %	40 %	217076233
85	NC_011653	AATCA	2	10	97133	97142	60 %	20 %	0 %	20 %	217076233
86	NC_011653	AGTTG	2	10	97556	97565	20 %	40 %	40 %	0 %	217076234
87	NC_011653	AAAAG	2	10	98562	98571	80 %	0 %	20 %	0 %	217076234
88	NC_011653	TTTAA	2	10	99866	99875	40 %	60 %	0 %	0 %	217076235
89	NC_011653	ATTAC	2	10	100000	100009	40 %	40 %	0 %	20 %	217076236
90	NC_011653	ATTTA	2	10	100462	100471	40 %	60 %	0 %	0 %	217076237
91	NC_011653	AATTT	2	10	100607	100616	40 %	60 %	0 %	0 %	217076237
92	NC_011653	AGAAA	2	10	100810	100819	80 %	0 %	20 %	0 %	217076238
93	NC_011653	AAATT	2	10	102154	102163	60 %	40 %	0 %	0 %	217076239
94	NC_011653	TTTTA	2	10	105007	105016	20 %	80 %	0 %	0 %	217076244
95	NC_011653	GTTTT	2	10	109048	109057	0 %	80 %	20 %	0 %	217076247
96	NC_011653	ATCCA	2	10	111060	111069	40 %	20 %	0 %	40 %	217076248
97	NC_011653	AGAAC	2	10	111808	111817	60 %	0 %	20 %	20 %	217076249
98	NC_011653	AAGTA	2	10	113944	113953	60 %	20 %	20 %	0 %	217076251
99	NC_011653	TTTAA	2	10	114443	114452	40 %	60 %	0 %	0 %	217076252
100	NC_011653	TTTCC	2	10	114892	114901	0 %	60 %	0 %	40 %	217076253
101	NC_011653	ATTCT	2	10	115728	115737	20 %	60 %	0 %	20 %	217076254
102	NC_011653	GTTTC	2	10	116583	116592	0 %	60 %	20 %	20 %	217076255
103	NC_011653	AAGTA	2	10	117732	117741	60 %	20 %	20 %	0 %	217076256
104	NC_011653	ACTTT	2	10	120548	120557	20 %	60 %	0 %	20 %	217076259
105	NC_011653	AAAAT	2	10	120577	120586	80 %	20 %	0 %	0 %	217076259
106	NC_011653	ACTAT	2	10	121436	121445	40 %	40 %	0 %	20 %	217076260
107	NC_011653	TAAAA	2	10	124377	124386	80 %	20 %	0 %	0 %	217076264
108	NC_011653	ATGCC	2	10	126066	126075	20 %	20 %	20 %	40 %	217076265
109	NC_011653	TAACT	2	10	126113	126122	40 %	40 %	0 %	20 %	217076265
110	NC_011653	GAAAT	2	10	130405	130414	60 %	20 %	20 %	0 %	217076269
111	NC_011653	TTTTC	2	10	131164	131173	0 %	80 %	0 %	20 %	217076270
112	NC_011653	ATTGC	2	10	131575	131584	20 %	40 %	20 %	20 %	217076270
113	NC_011653	TAAAA	2	10	132370	132379	80 %	20 %	0 %	0 %	217076270
114	NC_011653	AAAAT	2	10	133022	133031	80 %	20 %	0 %	0 %	217076272
115	NC_011653	AAATC	2	10	133032	133041	60 %	20 %	0 %	20 %	217076272
116	NC_011653	ATCTT	2	10	133439	133448	20 %	60 %	0 %	20 %	217076272
117	NC_011653	ATAAA	2	10	134255	134264	80 %	20 %	0 %	0 %	217076272
118	NC_011653	AAAAT	2	10	134819	134828	80 %	20 %	0 %	0 %	217076274
119	NC_011653	ATTAT	2	10	135614	135623	40 %	60 %	0 %	0 %	217076275
120	NC_011653	GCAAT	2	10	136031	136040	40 %	20 %	20 %	20 %	217076276
121	NC_011653	AATCC	2	10	136388	136397	40 %	20 %	0 %	40 %	217076276
122	NC_011653	TTGAC	2	10	137132	137141	20 %	40 %	20 %	20 %	217076276
123	NC_011653	TACAA	2	10	137951	137960	60 %	20 %	0 %	20 %	217076277
124	NC_011653	TCTTG	2	10	140218	140227	0 %	60 %	20 %	20 %	217076278
125	NC_011653	CAAAA	2	10	142648	142657	80 %	0 %	0 %	20 %	217076279
126	NC_011653	ATTTC	2	10	143675	143684	20 %	60 %	0 %	20 %	217076281
127	NC_011653	TTTAT	2	10	144553	144562	20 %	80 %	0 %	0 %	217076281
128	NC_011653	TAATT	2	10	145025	145034	40 %	60 %	0 %	0 %	217076282
129	NC_011653	TGACT	2	10	149133	149142	20 %	40 %	20 %	20 %	254555129
130	NC_011653	AATTA	2	10	151646	151655	60 %	40 %	0 %	0 %	217076287
131	NC_011653	AAACT	2	10	153499	153508	60 %	20 %	0 %	20 %	217076288
132	NC_011653	TTTCT	2	10	155245	155254	0 %	80 %	0 %	20 %	217076291
133	NC_011653	TAACA	2	10	156967	156976	60 %	20 %	0 %	20 %	217076292
134	NC_011653	CTCTT	2	10	157909	157918	0 %	60 %	0 %	40 %	217076292
135	NC_011653	TGCAC	2	10	159038	159047	20 %	20 %	20 %	40 %	217076294
136	NC_011653	TAATA	2	10	160932	160941	60 %	40 %	0 %	0 %	217076298
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