MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 plasmid pMAR2

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011603	GGACAA	2	12	235	246	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_011603	TGGATA	2	12	498	509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276193
3	NC_011603	GCTTGC	2	12	2711	2722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276194
4	NC_011603	AGTATA	2	12	4297	4308	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	215276196
5	NC_011603	CATCTG	2	12	4838	4849	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	215276196
6	NC_011603	ATGATA	2	12	6217	6228	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	215276197
7	NC_011603	TTTTTC	2	12	6404	6415	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	215276197
8	NC_011603	AAACTG	2	12	9974	9985	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	215276201
9	NC_011603	ATTTAT	2	12	11323	11334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276202
10	NC_011603	ATAAGA	2	12	12720	12731	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	215276205
11	NC_011603	CTTGAA	2	12	15113	15124	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011603	CGTATT	2	12	26119	26130	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_011603	AGGGGG	2	12	26686	26697	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011603	GGATAA	2	12	26730	26741	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011603	CAGGAG	2	12	28435	28446	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_011603	GCCACC	2	12	31469	31480	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	215276215
17	NC_011603	GCCCCA	2	12	39098	39109	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	215276222
18	NC_011603	CCACAT	2	12	39404	39415	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	215276222
19	NC_011603	ACGGTT	2	12	43786	43797	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	215276225
20	NC_011603	GTAACT	2	12	48589	48600	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	215276228
21	NC_011603	CCTGCC	2	12	50585	50596	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	215276229
22	NC_011603	GCGTCA	2	12	50684	50695	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	215276229
23	NC_011603	AACAGA	2	12	51225	51236	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	215276231
24	NC_011603	GTTGAC	2	12	51484	51495	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	215276232
25	NC_011603	TTTCCA	2	12	60513	60524	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	215276243
26	NC_011603	TTCATT	2	12	67854	67865	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	215276256
27	NC_011603	TGCTGA	2	12	74082	74093	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	215276260
28	NC_011603	CCATCA	2	12	76523	76534	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	215276263
29	NC_011603	TTTATA	2	12	83525	83536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011603	ATAAGT	2	12	86567	86578	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	215276270
31	NC_011603	TGGTTT	2	12	87033	87044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011603	TTTTTA	2	12	87050	87061	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011603	GCTGTC	2	12	92161	92172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276277
34	NC_011603	AAAATC	2	12	92341	92352	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_011603	GCATAT	2	12	95680	95691	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.