MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 plasmid pMAR2

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011603	TGGATA	2	12	498	509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276193
2	NC_011603	GCTTGC	2	12	2711	2722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276194
3	NC_011603	AGTATA	2	12	4297	4308	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	215276196
4	NC_011603	CATCTG	2	12	4838	4849	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	215276196
5	NC_011603	ATGATA	2	12	6217	6228	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	215276197
6	NC_011603	TTTTTC	2	12	6404	6415	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	215276197
7	NC_011603	AAACTG	2	12	9974	9985	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	215276201
8	NC_011603	ATTTAT	2	12	11323	11334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276202
9	NC_011603	ATAAGA	2	12	12720	12731	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	215276205
10	NC_011603	GCCACC	2	12	31469	31480	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	215276215
11	NC_011603	GCCCCA	2	12	39098	39109	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	215276222
12	NC_011603	CCACAT	2	12	39404	39415	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	215276222
13	NC_011603	ACGGTT	2	12	43786	43797	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	215276225
14	NC_011603	GTAACT	2	12	48589	48600	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	215276228
15	NC_011603	CCTGCC	2	12	50585	50596	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	215276229
16	NC_011603	GCGTCA	2	12	50684	50695	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	215276229
17	NC_011603	AACAGA	2	12	51225	51236	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	215276231
18	NC_011603	GTTGAC	2	12	51484	51495	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	215276232
19	NC_011603	TTTCCA	2	12	60513	60524	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	215276243
20	NC_011603	TTCATT	2	12	67854	67865	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	215276256
21	NC_011603	TGCTGA	2	12	74082	74093	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	215276260
22	NC_011603	CCATCA	2	12	76523	76534	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	215276263
23	NC_011603	ATAAGT	2	12	86567	86578	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	215276270
24	NC_011603	GCTGTC	2	12	92161	92172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276277

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.